发表论文:Dosage sensitivity shapes balanced expression and gene longevity of homoeologs after whole-genome duplications in angiosperms
目前职位:中国科学院武汉植物园,研究员。
教育经历:2003-2007年,华中农业大学,本科;2004-2007年,华中科技大学,英语(双学位);2007-2012年,中国科学院大学/中国科学院武汉植物园,博士。
兴趣爱好:徒步、游泳、科幻美剧。
我长期致力于水生植物基因组演化研究,聚焦于睡莲目、莲属和菖蒲属等被子植物早期分支的湿地水生类群:1)从宏观演化角度,揭示植物早期分支关键节点的古多倍化(基因组加倍)事件以及染色体核型结构的演化规律,并探索剂量平衡效应等因素在古多倍化后复制基因的命运、表达与表观遗传修饰分化中的重要作用机制;2)从微观演化层面,通过群体遗传、共表达调控网络、非编码RNA、DNA甲基化修饰等多个维度,揭示莲属植物地下茎、花瓣数、花色等表型多样化的遗传基础和不同纬度气候适应性进化机制。 相关研究以第一作者或最后通讯作者发表在Nature Plants、Genome Biology、MBE、Plant Physiology、Plant Journal、Molecular Ecology等期刊,构建了莲基因组与遗传变异数据库NGD。ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tao-Shi
参考文献:
Tao Shi, Zhiyan Gao, Jinming Chen, Yves Van de Peer. Dosage sensitivity shapes balanced expression and gene longevity of homoeologs after whole-genome duplications in angiosperms. The Plant Cell, 2024. DOI: 10.1093/plcell/koae227Hypothesis showing that higher expression balance of duplicate copies is associated with more protein-protein interactions (PPIs) and higher sensitivity to expression change.
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