ImageJ实用技巧:快速掌握为图像添加比例尺的方法!

学术   科学   2024-03-21 07:58   日本  

在科研研究中,不论是做汇报还是论文发表,为了正确的呈现图像,包含比例尺都是至关重要的。在图像中添加比例尺,以便读者看到所呈现图像的比例,以获得准确的结论。本期内容小编将向大家介绍如何利用ImageJ软件轻松为科研图像添加比例尺,让你的研究工作更加精确和可靠!

▌校准图像--已知像素大小

在Image J中,默认使用的长度单位是像素,即Pixel;我们需要对其进行校准,即使用通用的长度单位μm,mm等。这里小编所说的“已知像素大小”就是指已知像素长度和通用长度的比例。
首先导入一张图片至Image J(Fiji)中;
在图像的左上角会显示图像的尺寸、位深度文件大小。在本例中图像的尺寸为1360x1024像素,我们需要将其校准,长度单位转换为μm
点击“Image -> Properties”,输入单位像素对应的比例尺单位的大小,本例中一个像素对应0.6μm,就如下输入,然后点击“OK”。
现在可以发现图像已经被校准,显示为816.0x614.4μm,长度单位改为了我们常用的“μm”。
需要注意的是在图像属性窗口,如果需要将属性应用于所有打开的图像直到关闭软件,可以将“Global”选项勾选。
▌校准图像--未知像素大小
如果像素大小未知,我们就需要一张已有比例尺的图像或其它已知长度的参考图像,可以用它来计算像素大小。
如下图已有一个100μm的比例尺,我们可以使用直线工具沿着比例尺进行划线,注意按住“Shift”键可保持直线,结果更准确。
然后点击“Analyze -> Set Scale…”,其中“Distance in pixels”指的就是刚刚划的直线的长度;这里在“Known distance”输入已知的距离,本例中比例尺是100μm,所以就输出“100”;在“Unit of length”输入长度单位,本例中为“μm”;然后点击“OK”即可。
同样的可以勾选“Global”设置全局应用该设置。现在图像就校准好了,可以添加比例尺啦。
▌添加比例尺
导入图像后,点击“Analyse -> Tools -> Scale Bar”,在打开的对话框中输出比例尺的详细信息。本例中设置了一个6像素粗细(Thickness in pixels)100μm(Width in μm)的比例尺,字体的大小为14(Font size),并加粗(Bold Text)。
还可以选择添加一个垂直的比例尺,本例中为50μm(Height in μm),注意勾选“Vertical”。
大家可根据自己的需要进行设置,下图为本例添加完成的比例尺,之后进行图像保存即可。
如果不喜欢比例尺默认的位置,可以在图像上画一条ROI线,然后在“Location”的下拉菜单中选择“At Selection”即可。

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