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熟悉的小伙伴知道,我们号比较喜欢整一些函数,除了自己想象原创的之外,很多我们都表明是站在巨人的肩膀上的。或者有些时候,我们想要了解一个函数的内在逻辑,想知道怎么得到的结果或者作图,想自己改进函数或者学习作者代码,就需要查看函数源码了。那么怎么查看呢?
library(Seurat)
edit(DimPlot)
#或者
fix(DimPlot)
最近升级了设备,安装包简直是噩梦:分享bioconductor以及github R包安装小技巧。其实也不是什么特别的技巧,就是笨办法,但是很管用。首先是bioconductor安装的包,很多时候可能BioManger::install()很慢,还不一定成功,那么我们可以打开bioconductor网站(https://www.bioconductor.org/)。右上角search的框框里面输入你需要安装的R包, 检索,一般就是第一个,打开它,滑动到页面最下方,下载source安装包,无论你是windows、macOS,Unix都没得问题。然后在自己rstudio右下角,点击packages=install=找到下载文件安装把!
#使用devtools::install_github安装某些包的时候,总是不成功,无法下载,很多时候github都不知道在哪下载安装包
devtools::install_github('shenorrlab/bseqsc')
# Downloading GitHub repo shenorrlab/bseqsc@HEAD
# Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet, :
# cannot open URL 'https://api.github.com/repos/shenorrlab/bseqsc/tarball/HEAD'
@解决办法
#其实很简单,哪个error后面都提供链接了,R下载不成,
#就把链接复制到浏览器,然后就可以下载包本地安装了
#你问我链接在哪里???那个报错里面嘞!
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