你要的4分+生信干湿结合思路已送达！单基因+通路也太好复现了！

文摘科学 2024-07-20 10:01 日本

各位小伙伴大家好呀~船长今天来分享一篇5分+的生信文章，这个影响因子区间相对来说属于努努力就能够到的，不论是满足毕业需求还是评奖评优都是很拿得出手的啦！并且这一区间的思路“性价比”都是比较高的。

比如说今天船长分享的这篇文章，作者仍旧是采取了生信+实验的经典思路，不过在讨论的角度上选择了一个热门信号通路，聚焦到信号通路那就可以研究上下游，进而辐射到整个机制了，是一个很好的切入点，对于后期的研究也能起到一个很好的铺垫作用。

话又说回来，这篇文章使用公共数据进行生信分析，又借助了线上分析工具和R软件，加上丰富的实验验证，这一套下来还用愁毕业吗，毕业论文都有了！换个疾病就能复现了啊有木有！总而言之，想发热点或创新升级的小伙伴们都可以来找船长哦~免费思路评估、付费生信分析和方案设计等统统不在话下！

后台回复321获取原文献，文献编号24312-2

l题目：STRN3通过抑制河马通路促进肝细胞癌肿瘤生长

l杂志：J Cell Mol Med

l影响因子：IF=5.3

l发表时间：2024年3月

研究背景

肝细胞癌（HCC）是全球癌症相关死亡人数最多的癌症，其治疗仍然面临挑战。该研究关注STRN3，属于stiatin家族，是多组分复合物PP2A的关键调控亚基，参与细胞过程。尽管在其他癌症中已发现STRN3上调，其在HCC中的具体作用尚不清楚。研究目的是评估STRN3在HCC中的表达特征、探讨其预后意义和临床关联，并深入研究其在HCC发展中的生物学功能。通过对STRN3的全面调查，研究旨在更好地理解其在HCC中的作用，为开发新的治疗策略提供基础。

研究思路

对来自TCGA数据库的371名肝癌患者以及来自GEO数据库的肝癌组织和正常组织进行了临床相关性分析。使用qRT-PCR和Western blot检测细胞中相关蛋白，通过CCK8和克隆形成实验分析细胞的增殖能力。进行Transwell和划痕愈合实验以检测细胞的侵袭能力，并利用流式细胞术检测细胞凋亡。通过单细胞测序数据和多重免疫荧光分析了特定蛋白质的表达丰度和分布。免疫组化用于评估患者肿瘤和邻近非癌组织中STRN3的表达。

主要结果

1.STRN3高表达与HCC患者不良预后相关

图1STRN3 与 HCC 临床病理特征之间的关系

2.STRN3在HCC中与转录调控过程密切相关

图2STRN3 的生物过程分析

3.STRN3 敲低抑制 HCC 细胞增殖、侵袭并诱导细胞凋亡

图3STRN3 促进 HCC 中的细胞增殖、侵袭和抗凋亡

4.STRN3在HCC中是Hippo信号通路的重要上游调节分子

图4STRN3 促进 YAP 的转录活性

5.HCC细胞中STRN3和YAP的表达分布和丰度

图5HCC 中 STRN3 的表达模式

6. STRN3在肝癌组织中上调并与不良预后相关

图6HCC 组织中 STRN3 的上调

文章小结

这篇文章利用TCGA、GEO以及HPA公共数据库进行了全面的生信分析，并且结合了充分的实验验证，使用干湿结合的经典思路进行方案设计，并且文章的讨论角度也蹭了热门Hippo 信号通路，可见讨论角度也很重要呀！当然文章也存在数据量不够大，缺乏动物实验，机制研究细节不够完善等问题，想在这个思路上进一步的小伙伴可以从这几个方面进行完善，那就可以发更高分啦！好了，最后有其它问题可以加船长的微信联系哦，我们下期不见不散！

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