研究进展:生物膜层干涉-生物传感器 | Nature Protocols

文摘   2024-11-24 10:44   北京  

蛋白质-蛋白质相互作用是几乎所有生物过程的基础,理解控制这些相互作用的分子机制,对于生物医学科学的进步,是至关重要的。人工智能驱动的计算工具,有助于重塑结构生物学的方法。然而,模型数据通常需要经验验证。因此,大规模的预测建模数据,将受益于蛋白质-蛋白质相互作用的高通量生化表征的优化方法。

生物膜层干涉测量法Biolayer interferometry是确定生物分子相互作用速率(称为动力学)的极少数方法之一,并且在常用动力学测量技术中,最适合于高通量实验设计。
近日,美国 俄勒冈健康与科学大学(Oregon Health and Science University)Timothy A. Bates,Fikadu G. Tafesse等,在Nature Protocols上发文,逐步说明了如何使用生物膜层干涉测量法进行动力学实验。
还描述了竞争法和表位分析实验的基础和执行,这对于抗体和纳米抗体筛选应用特别有用。该程序需要3小时才能完成,适用于对生化技术经验较少的用户。

Biolayer interferometry for measuring the kinetics of protein–protein interactions and nanobody binding. 

生物膜层干涉测量法,用于测量蛋白质-蛋白质相互作用和纳米体结合动力学。


图1: 生物膜层干涉biolayer interferometry,BLI测量的物理基础。


图2: 示例样本输入窗口。


图4: 从试点实验中,选择Kd估计的理想曲线。


图5: 表位分析Epitope binning实例。


图6: 普通感测图结果的示例数据。

文献链接
Bates, T.A., Gurmessa, S.K., Weinstein, J.B. et al. Biolayer interferometry for measuring the kinetics of protein–protein interactions and nanobody binding. Nat Protoc (2024). 
https://doi.org/10.1038/s41596-024-01079-8
https://www.nature.com/articles/s41596-024-01079-8
本文译自Nature
来源:今日新材料
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