棒棒糖气泡图是CNS期刊中常见的一种数据图。
棒棒糖气泡图是在棒棒糖图的基础上,添加尺寸参数,通过散点的大小表示一个额外的特征。
由于Matlab中没有现成的函数绘制棒棒糖气泡图,因此需要大家自行解决。
本文利用自己制作的Lollipop工具,进行棒棒糖气泡图的绘制,先来看一下成品效果:
特别提示:本期内容『数据+代码』已上传资源群中,加群的朋友请自行下载。有需要的朋友可以关注同名公号【阿昆的科研日常】,后台回复关键词【全家桶】查看加入方式。
此部分主要是读取原始数据并初始化绘图参数。
% 读取数据
load data.mat
% 初始化绘图参数
y = 1:length(data);
x = data;
ylabels = p;
SZ = sz';
作图不配色就好比做菜不放盐,总让人感觉少些味道。
但颜色搭配比较考验个人审美,需要多加尝试。
这里直接使用TheColor配色工具中的SCI权威配色库:
%% 颜色定义
C = TheColor('sci',501);
C1 = C(1,:);
(点击上图查看TheColor具体功能)
获取方式:公众号(阿昆的科研日常)后台回复 TC
调用‘Lollipop’命令,绘制初始棒棒糖气泡图。
[s,p,idx] = Lollipop(data,SZ,C1);
bubblesize([5 15])
yl = ylabels(idx);
hTitle = title('LollipopBubble');
hXLabel = xlabel('MeanDecreaseAccuracy');
hYLabel = ylabel('Product');
为了插图的美观,对坐标轴细节等进行美化:
% 点属性
s.MarkerFaceAlpha = 0.8;
% 线属性
p.Color = C1;
p.LineWidth = 1;
% 坐标区调整
set(gca, 'Box', 'off', ... % 边框
'LineWidth', 1,... % 线宽
'XGrid', 'on', 'YGrid', 'off', ... % 网格
'TickDir', 'out', 'TickLength', [.005 .005], ... % 刻度
'XMinorTick', 'off', 'YMinorTick', 'off', ... % 小刻度
'XColor', [.1 .1 .1], 'YColor', [.1 .1 .1]) % 坐标轴颜色
% 坐标轴刻度调整
set(gca, 'YTick', 1:16,...
'Ylim' , [0.5 15.5], ...
'Xlim' , [-0.05 1.05], ...
'XTick', 0:0.2:1,...
'yticklabel',yl)
% 气泡图图例
blgd = bubblelegend('Location','southeastoutside',...
'Style','vertical',...
'BubbleSizeOrder','descending',...
'box','off',...
'NumBubbles',3,... ...
'FontName', 'Arial',...
'FontSize', 10);
% 字体和字号
set(gca, 'FontName', 'Arial', 'FontSize', 9)
set([hXLabel, hYLabel], 'FontSize', 11, 'FontName', 'Arial')
set(hTitle, 'FontSize', 12, 'FontWeight' , 'bold')
% 背景颜色
set(gcf,'Color',[1 1 1])
% 添加上、右框线
xc = get(gca,'XColor');
yc = get(gca,'YColor');
unit = get(gca,'units');
ax = axes( 'Units', unit,...
'Position',get(gca,'Position'),...
'XAxisLocation','top',...
'YAxisLocation','right',...
'Color','none',...
'XColor',xc,...
'YColor',yc);
set(ax, 'linewidth',1,...
'XTick', [],...
'YTick', []);
设置完毕后,以期刊所需分辨率、格式输出图片。
%% 图片输出
figW = figureWidth;
figH = figureHeight;
set(figureHandle,'PaperUnits',figureUnits);
set(figureHandle,'PaperPosition',[0 0 figW figH]);
fileout = 'test';
print(figureHandle,[fileout,'.png'],'-r300','-dpng');
以上。
目前,Matlab棒棒糖气泡图的绘图【数据+代码】已加入全家桶中。
全家桶计划是指将过去以及未来发布的各种相关资源统统上传到一个群中,大家加入全家桶计划后,可以随时随地地下载群中的所有资源。
全家桶中收录有……
Matlab论文插图绘制模板系列(已完结,包含3种版本*139种经典数据图,后台回复关键词【139】查看单独获取方式):
Matlab进阶绘图系列(除Matlab默认绘图外的复杂绘图,现包括71种经典数据图):
Nature/Science论文插图复刻系列(让Matlab论文插图达到顶刊效果,现包括5种数据图):
顶刊论文高清图集系列,包括Nature高清图集(学习Nature绘图思路,包括2400张左右):
Science高清图集(学习Science绘图思路,超1000张):
Matlab配色补充包系列(包括配色强化addcolorplus、450种常用色colorplus、SCI专用配色工具Rggsci以及中国、日本、美国、英国、法国传统颜色等):
Matlab科研绘图精品工具包(包括渐变色生成/编辑器ColorMap、渐变色生成器专业版ColorMapPro、光影渲染器Shadow、顶级期刊配色拷贝工具ColorCopy和图片数据提取工具Fig2Data):
以及Matlab终极配色工具TheColor(2套):
公众号后台回复关键词【全家桶】查看加入方式。
以上。
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