药师佛（药师琉璃光如来）于过去世行菩萨道时，曾发十二大愿，愿为众生解除疾苦，使具足诸根、身相端正、资具丰饶、离诸横难等，并且导入解脱。
01
第一大愿
第一大愿。愿我来世得阿耨多罗三藐三菩提时。自身光明炽然。照耀无量无数无边世界。以三十二大丈夫相。八十随形。庄严其身。令一切有情。如我无异。
02
第二大愿
第二大愿。愿我来世得菩提时。身如琉璃。内外明彻。净无瑕秽。光明广大。功德巍巍。身善安住。焰网庄严。过于日月。幽冥众生。悉蒙开晓。随意所趣。作诸事业。
03
第三大愿
第三大愿。愿我来世得菩提时。以无量无边智慧方便。令诸有情。悉得无尽所受用物。莫令众生有所乏少。
04
第四大愿
第四大愿。愿我来世得菩提时。若诸有情行邪道者。悉令安住菩提道中。若行声闻独觉乘者。皆以大乘而安立之。
05
第五大愿
第五大愿。愿我来世得菩提时。若有无量无边有情。于我法中修行梵行。一切皆令得不缺戒。具三聚戒。设有毁犯。闻我名已。还得清净。不堕恶趣。
06
第六大愿
第六大愿。愿我来世得菩提时。若诸有情。其身下劣。诸根不具。丑陋。顽愚。盲。聋。喑。哑。挛。躄。背偻。白癞。癫狂。种种病苦。闻我名已。一切皆得端正黠慧。诸根完具。无诸疾苦。
07
第七大愿
第七大愿。愿我来世得菩提时。若诸有情。众病逼切。无救无归。无医无药。无亲无家。贫穷多苦。我之名号。一经其耳。众病悉除。身心安乐。家属资具。悉皆丰足。乃至证得无上菩提。
08
第八大愿
第八大愿。愿我来世得菩提时。若有女人。为女百恶之所逼恼。极生厌离。愿舍女身。闻我名已。一切皆得转女成男。具丈夫相。乃至证得无上菩提。
09
第九大愿
第九大愿。愿我来世得菩提时。令诸有情。出魔罥网。解脱一切外道缠缚。若堕种种恶见稠林。皆当引摄置于正见。渐令修习诸菩萨行。速证无上正等菩提。
10
第十大愿
第十大愿。愿我来世得菩提时。若诸有情。王法所录。绳缚鞭挞。系闭牢狱。或当刑戮。及余无量灾难凌辱。悲愁煎逼。身心受苦。若闻我名。以我福德威神力故。皆得解脱一切忧苦。
11
第十一大愿
第十一大愿。愿我来世得菩提时。若诸有情。饥渴所恼。为求食故造诸恶业。得闻我名。专念受持。我当先以上妙饮食饱足其身。后以法味。毕竟安乐而建立之。
12
第十二大愿
第十二大愿。愿我来世得菩提时。若诸有情贫无衣服。蚊虻寒热。昼夜逼恼。若闻我名专念受持。如其所好即得种种上妙衣服。亦得一切宝庄严具。华鬘涂香。鼓乐众伎。随心所玩。皆令满足。
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