【New Phytol】竹花叶病毒递送CRISPR系统,竹子无外源DNA基因编辑迈新台阶!

学术   2025-01-12 14:00   上海  


植物基因组编辑传统方法(如农杆菌介导转化或预组装的CRISPR/Cas9核糖核蛋白复合物递送)效率低下,尤其对竹子等难以诱导愈伤组织和再生的植物来说,这些方法限制了基因编辑的应用。

植物RNA病毒载体因其RNA不整合入基因组的特性,为无DNA残留的基因组编辑提供了便利、高效且低成本的选择。BaMV(竹花叶病毒)是一种正义单链RNA病毒,具有较大的外源基因携带能力,具有潜在的应用价值。

2025年1月6日,New Phytologist在线发表了福建农林大学顾连峰团队的最新研究成果:‘Bamboo mosaic virus-mediated transgene-free genome editing in bamboo’,作者利用BaMV载体系统递送Cas蛋白和单向导RNA(sgRNA),实现对烟草和竹子的靶向基因编辑。

pBaMV-Cas9载体在烟草测试中,成功实现了基因编辑,扩增子测序结果显示NbPDS基因平均编辑效率达41.3%;随后在不同竹子品种中测试该载体,扩增子测序结果显示,麻竹中最高实现了7.56%(茎,DlmRDR6基因)的编辑效率;毛竹中最高实现了8.88%(叶,PheRDR6基因)

BaMV介导的CRISPR系统还可以进行多基因编辑pBaMV-g1tg2t-Cas9载体,使用tRNA-Gly(77bp)连接两个sgRNA。

针对NbPDS基因的两个位点(gNbPDS & gNbPDS-2),扩增子深度测序显示,NbPDS-A的编辑效率:4.14%到5.79%(平均4.93%);NbPDS-B的编辑效率:5.49%到8.72%(平均7.41%)。

针对NbPDSNbRDR6基因(gNbPDS & gNbRDR6),扩增子深度测序显示,NbPDS的编辑效率:7.39%到16.88%(平均12.27%),NbRDR6的编辑效率:12.09%到16.67%(平均14.26%)。

pBaMV-Cas9系统简介
pBaMV-Cas9载体是在先前开发的BaMV-Cas9表达载体的基础上进行优化改造而成。
将SpCas9和sgRNA整合在BaMV的TGBps和CP之间包含了来自Tombusvirus的p19,p19通过2A肽与SpCas9连接,使用CP启动子控制异源RNA的表达。(图1)
TGBps(triple gene block proteins,三基因块蛋白):它通常编码3个重叠的基因,这些基因产生的蛋白质参与病毒的细胞间运动,在BaMV这样的线状病毒中是重要的功能元件。
CP(coat protein,外壳蛋白):在pBaMV-Cas9系统中,外壳蛋白(CP)启动子被用于驱动外源基因(如SpCas9和sgRNA)的表达。具体来说,CP启动子被插入到TGBp3的终止密码子之后,用于控制SpCas9和sgRNA的转录。
p19:是一种RNA沉默抑制因子(RNA silencing suppressor),抑制宿主的RNA沉默反应,有助于增强外源基因的表达,提高病毒载体在植物体内的稳定性。

图1

pBaMV-Cas9系统介导无外源DNA的基因编辑工作流程
质粒转化:将构建好的pBaMV-Cas9质粒转入农杆菌GV3101株。
农杆菌培养:在含有卡那霉素和利福平的YEB固体培养基上培养农杆菌,挑选单菌落进行液体培养,直至OD600达到0.5–0.8。
侵染准备:将农杆菌悬浮于烟草感染缓冲液中,25°C黑暗孵育2小时后,用于侵染烟草叶片。
机械侵染:侵染10天后,将感染的叶片研磨成感染汁液,用于竹子叶片的机械侵染。(图2)
可以将感染烟草的过程视为制备病毒阶段。

图2

该研究成功将CRISPR/Cas9基因编辑系统整合到竹花叶病毒载体中,克服了RNA病毒载体容量限制问题,实现了对植物基因的高效编辑。不需要提前制备转基因株系,操作简便,为植物基因功能研究提供了一个便捷实用的新工具。

为了不让您最关心的内容被湮没

防止我们一不小心失散

快把“iPlants”设置为星标吧★

只需三步↓↓

文章顶部点击「iPlants」名称进入公众号主页,点击右上角「三个小点」,点击「设为星标」,iPlants名称旁边出现一个黄色的五角星,就设置成功啦~


微信加群
iPlants专注于全球植物科学前沿研究报道,已有二十万多学者关注。现已组建了30个500人/群的植物科学研究的研究生/教授的实名认证交流群,其都来自全球各大高校和研究所的同学和老师。欢迎从事植物科学相关研究的同学和老师加入我们,一起讨论学术和梦想。温馨提示:iPlants助手微信号(ID: iplants-1)或长按下面二维码进群时,请备注一下学校+专业+学生/老师,以便我们能拉你进相应的交流群,否则不予通过)
投稿、商务合作、转载开白名单等事宜请联系微信ID:iplants或18321328797 或邮箱:703131029@qq.co


iPlants
传递有趣的、有意义的植物科学研究
 最新文章