文献导读 | Hepatology:针对病毒的抗体应答可预测酒精性肝炎的发病率和死亡率

文摘   2024-11-01 09:18   上海  

导语:酒精性肝炎(AH)是一种严重的酒精性肝病(ALD),患者预后较差,死亡率高。已有研究证实,酒精能够增加个体对细菌和病毒的易感性。

2024年9月,来自美国加州大学的研究团队在Hepatology杂志上发表了关于病毒抗体反应预测酒精性肝炎的发病率与死亡率研究。通过PhIP-seq技术,研究团队发现戒酒与血清病毒和细菌抗体应答的显著增加相关,同时,血清抗病毒抗体谱降低是AH患者肝脏疾病失调和死亡的预测指标。


【发表期刊】Hepatology

【发布时间】2024年9月

【影响因子】12.9

【核心技术】PhIP-seq

研究背景

酒精性肝炎(AH)是一种急性炎症性肝病,即使患者戒酒,依然有着非常高的死亡率,高达40% 的患者在诊断后 6 个月内死亡。同时AH 患者特别容易发生感染,这可能导致多器官功能障碍和较差的预后。

主要研究结果


    PhIP-seq技术利用表面展示有病毒肽的T7噬菌体展示文库表征样本中的抗体,使用下一代测序技术(NGS)对结合肽进行解码。文库的肽段长度为56个氨基酸,相邻肽段间包含28个氨基酸的重复序列[1]。本文使用的VirScan文库还包含了部分细菌蛋白。



    作者利用PhIP-seq技术对酒精使用障碍(AUD)和AH个体进行了血清学研究,数据处理时,作者除去了空白样品、交叉反应抗体的hits和在至少2个样品中不富集的肽。


    通过对PhIP-seq结果进行分析,作者发现AH患者血清中的hits数和多样性较低。同时,AUD个体戒酒后hits数显著增加,且增幅可能与肝病严重程度有关



    由于症状严重程度不同的AH患者的血清抗病毒hits数有显著差异,之后,作者对血清病毒表位的特征进行分析,构建了AH患者死亡率预测模型,较好地预测了AH患者的90天死亡率。

    综上所述,作者利用VirScan技术,对AUD和AH个体进行血清学研究,发现戒酒与血清病毒和细菌抗体应答的显著增加相关,同时,血清抗病毒抗体谱降低是AH患者肝脏疾病失调和死亡的预测指标。


参考文献

原文链接:

DOI: 10.1097/HEP.0000000000001046

文章引用:

[1] DOI: 10.1126/science.aaa0698


关于PhIP-seq技术

噬菌体免疫沉淀测序(Phage-immunoprecipitation sequencing, PhIP-seq)技术是一种高通量抗体谱检测技术,结合了高容量噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序技术。该项技术可针对数十万种抗原进行血清抗体检测,全面绘制血清抗体谱,是免疫力相关研究的有力工具。

PhIP-seq技术原理

首先选择目标抗原数据库,利用生信分析将每个蛋白切分成连续的具有重叠区的肽段。然后根据肽段序列合成对应的DNA寡核苷酸,连接到载体上并包装成T7噬菌体展示多肽库,即多肽抗原库。当样本血清与多肽抗原库孵育后,通过Protein G/A的磁珠富集抗体特异性的噬菌体,后续将噬菌体DNA进行PCR扩增、建库及测序获得抗原多肽序列,通过分析即可得到血液抗体表位谱组成,进而实现对相关疾病抗体组成特征的解析。


六大噬菌体展示肽库

全国独家定制六大抗体组库,助力解析恶性肿瘤、自身免疫性疾病、病毒感染、致病菌感染、肠道菌群及过敏原抗体组谱组成。

注:抗码芯瑞可以提供抗原库定制服务,欢迎咨询


PhIP-seq技术应用方向

疾病biomarker筛选、病因学研究、免疫力解码研究、疫苗疗效评估。


关于公司

上海抗码芯瑞生物科技有限公司(简称“抗码芯瑞”),由上海交通大学知名教授领衔创立,深耕蛋白组、抗体组领域研究超过20年。公司一直致力于抗体组学前沿技术方法的持续开发及成果转化,建立了国内领先的噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-seq)技术平台,独家定制六大抗原组库,并可提供定制化抗原建库服务。抗码芯瑞开展基于PhIP-seq平台的高通量筛选、数据分析及后续验证等技术服务,为抗体组学研究提供整体解决方案。

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