Frontiers in Genetics | 基于叶绿体基因组重构梓属系统发育关系
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科学
2022-05-22 21:05
河南
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梓属(Catalpa)是紫葳科(Bignoniaceae)的重要物种，共有11~13个种，多为半常绿或落叶乔木，叶对生或轮生，其中楸、灰楸、滇楸、梓、藏楸原产于我国。楸树是我国传统栽培优质珍贵用材树种，素有"木王"之称。梓属由于表型和分子水平研究的缺乏以及序列信息的不足，无法清楚地揭示梓属种间的系统发育关系。中国林业科学研究院林业研究所珍贵用材树种遗传改良创新团队以楸(Catalpa bungei)、滇楸(Catalpafargesii. f. duclouxii)、灰楸(Catalpa fargesii)、黄心梓木(Catalpa fargesii. f .duclouxii (Huangxinzimu)、金丝楸(Catalpa bungei (Jinsiqiu)和梓 (Catalpa ovata) 6个种为对象，运用比较基因组学的方法对比分析6种的叶绿体基因组差异，开展了基因组结构解析，高度变异区域发掘，种间系统发育关系构建。研究发现，梓属6个种的叶绿体基因组为典型的四分体结构(LSC、SSC、IRA/B)，总长度范围在157,765bp~158,355bp；6个种的叶绿体基因组总GC含量均为38.1%，共检测到113个独特基因，其中有19个基因位于IR区。同时，鉴定出5个高变区，分别为trnH-psbA、rps2-rpoC2、rpl22、ycf15-trnl-CAA和rps15，这些高变区可作为该属的DNA条形码。系统发育分析表明，梓属内的所有类群均为单系类群，能够清晰地反映梓属内种间亲缘关系。![]()
研究成果以 "Comparative Analysis of Chloroplast Genome Structure and Phylogenetic Relationships Among Six Taxa Within the Genus Catalpa (Bignoniaceae)" 为题发表在《Frontiers in Genetics》上。硕士研究生李凤为第一作者，麻文俊副研究员为通讯作者。研究得到"十三五"国家重点研发计划资助(2021YFD2200301)。
原文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35368674/
