EDI在设计时每个模块都有一个流量范围，以威立雅MK-5（原型号MK-3X）为例，模块运行包含产水流量、浓水流量和极水流量，产水流量范围为2.3-6.4m3/h。
EDI产水流会起到冷却模块的作用，MK-5最好按标准产水量5m3/h来考虑，最大不要超过标准产水量的20%。如果按最大流量6.4m3/h来考虑，过大的模块压差造成系统平衡困难，也会影响产水水质。同样产水流量如果低于最小2.3m3/h，模块内部可能会过热变形漏水。
以产水10m3/h，回收率90%的EDI装置为例，配置2台MK-5的浓水量为
10/0.9-10-0.16（单台MK-5的标准极水量为80L/h）=0.95m3/h
极水用于冷却电极并带走生成Cl2、H2等，每个不同型号的模块有极水流量要求，如MK-3的极水流量为60L/h，MK-5的极水流量为80L/h。在设计时需确保产水、极水、浓水三种低流量的报警并电源关闭。
