iMeta 讲坛十二
“接地气的”生物软件开发与社区维护-“用户视角”
陈程杰 副研究员
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
陈程杰，博士，就职于中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所，副研究员。研究方向为凤梨属作物遗传育种，手段为生物数据整合分析和生产级应用开发，内容为菠萝优异经济性状的高效精准聚合。主要参与完成了菠萝"铂金级"参考基因组与注释，解析其果皮与叶片颜色调控机理。项目期间开发并对外分享了TBtools、GSAman、EasyCodeML等软件，得到广泛认可。以第一/通讯作者身份在Molecular Plant/Science Bulletin/Journal of Integrative Plant Biology/New Phytologist等期刊发表论文10余篇（封面论文4篇），总SCI论文合为40余篇，H-index=20，i10-index=30，总被引次数~1.2万次。连续入选爱思唯尔2022和2023年度“中国高被引学者年度榜单”（园艺方向），2022和2023年度全球前2%顶尖科学家。
一个本硕博纯园艺学背景的科研人员，计划介绍他如何一步又一步地在生物软件开发这个副业上越走越远，以至于多数人只知道他参与开发的TBtools、EasyCodeML、sRNAanno、GSAman、SapBase、sRNAminer、SynGAP等软件，而忘了他其实只是一个想找到“更好吃的菠萝”的青年科研人员。除此之外，他还要介绍他又是如何一步一步抽身开来，建立BioAnno社区实现“用户自托管”，最终继续专心种菠萝的经历。
赵齐 副研究员
中山大学肿瘤防治中心
报告时间：2024年10月31日 星期四 19:00
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