在模仿中精进数据可视化_进化树历史合集

文摘   2024-10-18 18:03   中国香港  

在模仿中精进数据可视化_进化树历史合集

公众号上面画了诸多的进化树的内容,我比较开玩笑的说,公众号的粉丝,应该没有不会画进化树的
今天既然不想加班和工作,那么就汇总一下进化树的推文。


推文如下:

在模仿中精进数据可视化-ggplot2+ggtree复现Nature Microbiology的Figure1


在模仿中精进数据可视化_使用ggtree进行进化树的美化


在模仿中精进数据可视化_使用ggtree&ggplot2绘制散点图组合图



在模仿中精进数据可视化_使用ggtree绘制Nature Microbiology的Figure1



在模仿中精进数据可视化_使用ggtree绘制Nature_Microbiology的Fig5b


基因家族分析05_序列比对以及进化树的构建和可视化


基因家族分析06_进化树_结构域_motif_基因结构四合一可视化



基因家族分析流程_09.启动子分析及可视化


在模仿中精进数据可视化_R语言复现ISME全图之Figure1进化树


在模仿中精进数据可视化_R语言复现ISME全图之Figure3进化树


在模仿中精进数据可视化_R语言复现ISME全图之Figure2进化树



在模仿中精进数据可视化_使用ggtree绘制发表级基因家族进化树


在模仿中精进数据可视化_使用ggtree绘制配对连线的进化树


总体而言,所有的推文均是使用ggtree和ggplot2进行绘制的,(Y叔叔是真的猛,开发了这么牛P的R包),同时所有的绘图过程中充满了细节,均在推文中体现~


嗯,睡觉!实在是扛不住了!
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历史绘图合集


进化树合集


环状图


散点图


基因家族合集

换一个排布方式:

首先查看基础版热图:

然后再看进阶版热图:


基因组共线性


WGCNA ggplot2版本


其他科研绘图


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