三国两晋南北朝时期，从三国开始到南朝陈为隋文帝所灭，共370年（220—589）。此间，孙吴、西晋、东晋和南朝的宋、齐、梁、陈王朝先后统治南宁地域。政权更替频繁，风云变幻莫测，岭南出现秦统一之后的第一次政局大动荡。
东汉献帝初平元年（190）至献帝建安三年（198），朱符任职交趾刺史。他侵虐百姓，百姓怨叛，山贼并出，攻州突郡，结果被当地豪酋攻杀，此事遂成为汉末各方争夺岭南统治权的契机。后几经博弈，最终为孙权所得。孙吴黄武五年（226），孙权采纳替代步骘接任交州刺史的吕岱建言，分交州东部的南海郡、苍梧郡、郁林郡、合浦郡为广州，吕岱为广州刺史；西部的交趾郡、九真郡、日南郡为交州，戴良为交州刺史。这些举措，引起士氏一族激烈反抗，被镇压后，孙吴复合交、广两州为交州，吕岱封为镇南将军，领交州刺史。孙吴永安七年（264），吴主孙休又将两州分立。吴灭后岭南归于西晋。
西晋除苛抚民，致力于稳固地方统治。时任交州牧的陶璜统治岭南30年，史称其“威恩著于殊俗”。从其父陶基开始，四世五人先后为交州刺史，成为岭南又一大家族。广西地处南陲，西晋中期、后期的“八王之乱”和“永嘉之乱”均未波及，但执政于广西者却彼此对立，诉诸武力。此间战乱频发，政权变更频繁，旧的郡县不断更名改属，新的州郡又不断增设。东晋元帝大（太）兴（318—321）年间，朝廷在今南宁地置晋兴郡和晋兴县。南朝时期，政权更替频仍，令人眼花缭乱。受此影响，岭南地区也不断发生争权夺位的斗争，较之其他地区，涉及今南宁境域内的诸县，隶属关系虽有变动，但并无太多增置并减，相对较为稳定。
三国两晋南北朝时期，黄河、长江两大流域社会动荡，岭南僻居南隅，战乱相对较少波及，加之远离政治中心，官府对民众的控制较为松弛，地广人稀，未开发地较多，百姓易于落脚谋生，因此岭南成为天下大乱之时理想的避难之地。南下的中原人士不仅带来了制度文明，也将技术文明传播过来，南宁地域的社会经济就是在这样的历史条件下继续发展的。人口的南迁，极大地推动了六朝时期南宁地域经济开发的进程，为地广人稀的南宁增添了劳动人员，使用铁制农具的数量和范围有了提高，牛耕技术得到进一步推广。
南北朝负子蛙十芒太阳纹铜鼓。1962年3月在市郊心圩乡振兴村北岭出土 图片来自《南宁百年图录（下）》
