脑影像工具包| BASCO(BetA-Series COrrelation)介绍

文摘   2024-11-11 19:00   浙江  

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1. 软件界面




2.工具包功能简介

BASCO(BetA-Series COrrelation)是一种用于研究事件相关fMRI数据区域间功能连接并评估实验条件对功能连接调节的软件工具。该方法基于一般线性模型(GLM),其中每个试次中的诱发活动由单独的协变量建模。

BASCO提供以下分析方法:

(1)基于种子的功能连接分析利用定义的种子区域对其平均beta序列进行估算区域的平均beta序列,并与大脑中每个体素的beta序列相关联;

2)基于ROI的网络分析给定一个大脑区域,例如基于SPM AAL模板,提取每个ROI的平均beta序列,并计算出与所有 ROI 相关的网络矩阵;

(3)基于体素的全脑网络分析一个体素的度被定义为与大脑中其他体素的连接数,这些连接数强于定义的绝对阈值。体素度是功能连接性改变的灵敏标记功能连接性改变的敏感标记,具有很高的空间分辨率。


3.软件安装注意事项


BSACO是基于SPM和MarsBaR并在Matlab环境下运行的软件包。

(1)下载并安装SPM8或SPM12和 MarsBaR;

(2)确保已将SPM和MarsBaR添加到Matlab路径(不包含子文件夹)并且两个工具箱都能正常工作。运行SPM和MarsBaR并检查是否有错误信息;

(3)下载最新版本的 BASCO;

(4)解压文件,需要使用Matlab命令“unzip ”;

(5)将BASCO文件夹添加到 MATLAB 路径中(不包含子文件夹);

(6)下载教程数据。将数据解压缩到BASCO文件夹中;

(7)工具箱提供的一些分析脚本会调用脑连接工具箱中实现的功能,请从https://sites.google.com/site/bctnet获取。


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编译:富柄淇

校正:展琳琳

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