第一届 | 11.15-11.19 | 静息态数据分析基础实训 | 杭州

文摘   2024-11-06 19:02   黑龙江  


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主办单位

杭州脑海科技有限公司

脑海科技认知神经科学实验室

承办单位

杭州脑呈科技有限公司



1.课程简介

为回馈广大医生及脑科学研究者,并助力大家迅速掌握静息态功能磁共振成像的基础知识,本次课程特别设计,旨在帮助每位学员快速具备独立进行数据分析的能力。课程的主题聚焦于普及静息态数据分析的核心知识与实用流程,采用课程+答疑的教学方式,确保每位学员都能够轻松上手。

课程亮点包括

    静息态体系化基础知识:从零开始,系统讲解静息态功能磁共振的基本原理、关键技术及其在临床和科研中的应用前景。

    已发表案例详解:精选多角度的已发表研究案例,深入剖析实际应用中的分析方法和技术要点,帮助学员了解前沿进展,并启发创新思维。

    绘图技巧精讲:教授专业绘图技巧,提升数据可视化水平,让您的研究成果更加生动、直观,易于传播。

通过本次课程的学习,您将不仅能够掌握扎实的理论知识,还能在实战演练中提升技能,为您的科研之路增添强大的动力。无论您是初学者还是有一定经验的研究人员,我们都将为您提供最贴心、最有效的指导和支持,让您在静息态功能磁共振研究领域迅速成长!选择我们,开启一段精彩纷呈的学习旅程吧!

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2.学习内容

1、SCI注意事项讲解

SCI科普介绍

重点讲解SCI(影响因子,SCI分区),期刊举例,SCI的整体发表流程,文献检索网站介绍,讲解PUBMED常用操作,如何查看引用与被引文献等

SCI文献结构

重点讲解静息态基础案例文献的题目、研究背景、方法、结果、结论、关键词、引言、方法、结果等。以ABIDE数据集为例,讲解数据预处理、数据分析描述、统计校正与图表结果汇报等

论文写作格式注意事项

系统讲解静息态基础论文写作格式,例如:标题、摘要、关键词、引言、方法、图表等注意事项


2、体系课程

(1)静息态功能磁共振入门

  • 磁共振成像基础概念(空间分辨率、扫描参数、二维图像、三维图像、四维图像介绍等)

  • 大脑解剖学基础概念(脑的构成、额顶枕颞叶的功能、大脑组织分布等)

  • 功能磁共振成像与BOLD信号原理(BOLD信号原理、HRF函数等)

  • 静息态功能磁共振脑成像(任务态与静息态等)

(2)静息态功能磁共振数据整理

脑成像数据格式介绍(DICOM与NIFTI及转换)

  • 脑成像工具箱与软件的简介与安装(SPM、RESTplus、MRIcro、MRIcron、MRIcroGL等常用工具箱)

  • 数据信息查看(数据头信息查看)

  • 数据整理(开源工具箱要求的数据存放格式、BIDS格式等)

  • 数据格式转换

(3)静息态功能磁共振文献解读

  • 静息态经典文献解读

  • 文献检索方法(SCI简介、检索技巧、检索网站等)

(4)静息态预处理

  • RESTplus工具箱简介

  • 数据预处理步骤(去除时间点、时间层校正、头动校正、空间标准化、回归协变量、平滑、去线性趋势、滤波)

  • RESTplus预处理操作

(5)静息态低频振幅指标

  • 静息态ALFF算法讲解与实操(傅里叶变换、ALFF参数设置、注意事项等)

  • 静息态fALFF算法讲解与实操(fALFF原理、参数设置等)

  • 静息态PerAF算法讲解与实操(PerAF原理、注意事项等)

  • 静息态wavelet-ALFF算法讲解与实操(原理、wavelet-ALFF参数设置、注意事项等)

(6)静息态局部一致性指标

  • 静息态ReHo算法讲解与实操(局部一致性原理、参数设置、注意事项等)

(7)静息态度中心性指标

  • 静息态DC算法讲解与实操(度中心性原理、参数设置、注意事项等)

(8)静息态功能连接指标

  • 功能连接算法(FC)概述

  • 基于体素的功能连接算法讲解与实操(种子点FC原理、种子点选取、注意事项等)

  • 基于感兴趣区的功能连接算法讲解与实操(原理、ROI选取、注意事项等)

(9)NIFTI数据的统计与校正

  • 基于NIFTI数据的单样本T检验(原理、单样本适用情况、注意事项等)

  • 基于NIFTI数据的双样本T检验(原理、双样本适用情况、注意事项等)

  • 基于NIFTI数据的配对样本T检验(原理、配对样本适用情况、注意事项等)

  • 基于NIFTI数据的方差分析(原理、三组适用情况、注意事项等)

  • 多重比较校正(FDR校正、GRF校正等)

  • 统计结果RESTplus作图与汇报

(10)结果汇报

  • 脑区结果三线表(表头制作、信息获取等)

  • RESTplus脑区结果图制作(参数设置、colorbar设置、图片的保存等)

  • BrainNet作图:map图、球棍图(参数设置、球棍图文件准备等)

(11)数据分析常用小工具

  • NIFTI图像重采样

  • NIFTI图像数学运算

  • NIFTI图像信号提取


3、SCI已发表案例实操

静息态功能磁共振研究发表众多的原因之一在于多批数据集应用不同的研究思路与方法可衍生出不同的课题,由此说明,分析思路对于课题的至关重要,本课程包含不同已发表成果案例讲解。


(1)多模态(功能像与结构像跨模态)已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词多模态分析、灰质体积比较、功能连接

课程主要内容

  • 文献方法部分解读

  • VBM原理及预处理实操

  • 功能像预处理原理及实操

  • 人口统计学与临床特征分析讲解

  • VBM分析实操

  • FC原理及实操

  • VBM结果汇报(层图、三线表、散点图等)

  • FC结果汇报


(2)静息态频段特异性已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词频段特异性、静息态局部指标、分频分析

课程主要内容

  • 数据预处理原理及实操

  • 多频段分析实操

  • fALFF原理及实操

  • 多频段fALFF结果组间比较

  • 相关性分析

  • 结果可视化讲解:三线表、差异脑区可视化、散点图等


(3)静息态多指标组合已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词探索性体素全脑分析、局部自发脑活动、网络水平改变的差异、内在功能变化模式

课程主要内容

  • 文章方法解读

  • 数据预处理原理及实操

  • ALFF指标分析

  • ReHo指标分析

  • 基于局部指标的组间统计学差异分析

  • FC指标分析

  • 基于功能连接的组间统计学差异分析

  • 结果可视化讲解:三线表、差异脑区可视化、球棍图等


4、脑影像绘图(多工具)

基础绘图

课程关键词:MRICRON、RESTplus、BrainNet、GRETNA、GraphPad等


进阶绘图

R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。本次培训侧重讲解如何使用R进行脑图呈现、相关图绘制、差异脑区信号图绘制等。


注:基础绘图与进阶绘图课程(原价1500元/人),现限时免费赠送:成功报名静息态数据分析基础实训后,免费赠送基础绘图与进阶绘图课程

以上课程均支持培训期间反复观看






3.脑海科技介绍

脑海科技核心团队组建于2018年,公司位于萧山区紫橙国际创新中心3号楼6层及10层,是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司,已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”、“浙江省创新型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”,入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目,并通过ISO9001质量管理体系认证,并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。

2021年脑海科技成立了下属的研究实验室(脑海科技认知神经科学实验室)专注于神经影像相关的学术工作,脑海实验室目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇。实验室研究团队有着丰富的脑影像研究经验,目前已有近百余名研究生或医生的联合培养或短期访学的合作经验,联合培养了很多优秀的研究生,如:高*艳以主要作者发表SCI文章5篇、郝*奇以主要作者发表SCI文章6篇、李*婷以主要作者发表SCI文章6篇、孙*伟以主要作者发表SCI文章4篇、王*以主要作者发表SCI文章3篇、展*琳以主要作者发表SCI文章3篇等等(鉴于篇幅所限,仅列举部分同学)。学习中心核心团队具有丰富的SCI文章审稿经验,担任50余个SCI杂志审稿人,包括:Alzheimer's Research & Therapy、Molecular Autism、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、NeuroImage、BMC Psychiatry、Human Brain Mapping、Translational Stroke Research、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Autism Research等等。

贾熙泽,博士,杭州脑海科技有限公司创始人、浙江师范大学心理学院特聘教授、主要研究方向为静息态功能磁共振方法学及焦虑障碍的神经机制。自2013年起,师从臧玉峰教授从事静息态功能磁共振方法学研究,RESTplus软件包的开发人,负责REST-meta-PD 国际多中心项目。现兼任山东第二医科大学附属医院特聘专家、大连市友谊医院特聘教授、常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、山东第二医科大学医学影像学院硕士生导师及佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师等。现为中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员、浙江省康复医学会神经调控专委会委员,主持国自然青年基金项目1项、入选杭州市青年科技人才培育工程项目,目前以主要作者在Science Bulletin、 Human Brain Mapping、 The Journal of Headache and Pain 及 Journal of Affective Disorders 等杂志发表文章 30 余篇(第一作者或通讯作者),文章被 SCI 杂志引用1057次,h-index =16,担任 40余个SCI杂志的审稿人。





4.报名及费用
(1)学习内容静息态功能磁共振数据分析基础实训

(2)学习模式:学习规划 + 导师制 + 小组答疑(5人以内)  +  体系化视频课程  +  定期进度跟进 + 学习效果评估 + 完整案例数据

(3)硬件资源每名学员配备2台电脑,1台用于观看学习视频,1台用于分析数据(Intel i7或以上配置)

(4)学习周期5天

(5)答疑方式:每天下午固定16点进行小组答疑,数据分析遇到报错,助教随时响应并协助解决问题

(6)学习费用

2024年11月15日-11月19日期间到场学习,可享受优惠价2900元/原价4500元/人),转发朋友圈,集赞超过28个,立减200元(即2700元/人

注:交通及食宿费用自理






 
5.报名流程及付款

报名流程。报名可扫描以下二维码添加樊衍孜微信联系报名(扫描以下二维码或添加微信号:19906719439) 

可开具能够报销的正式发票(如:技术服务费及培训费等)。支持预存,可以现场刷公务卡或银行卡转账,学习期间谢绝录像及录音。

电话咨询:0571-2883 4398(请按3号键)

微信咨询:19906719439

邮箱咨询:fanyanzi@brainimaging.cn

实验室地址:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼6楼602室






6.FAQ
Q:课程具体是什么形式?
A:脑海科技团队录制了完整的讲课视频,并且整理了相应的数据分析工具、代码以及技术文档,报名的学员会有一份学习规划,可根据学习规划观看对应教学视频。操作问题助教随时响应,理论以及科研问题每天下午16:00进行小组答疑(5人以内)。


Q:随到随学吗?每次提前多久预约?

A:建议提前预约,实验室位置有限,我们需要提前准备资料以及安排助教。预约不及时可能会没有位置,特别是周末及法定节假日的时间。


Q:与传统培训班相比,学习效果怎么样?

A:远比传统培训班学习效果好, 1)学习时间集中且充足,每天包括9小时的学习时间(9:00 ~ 18:00),方便请假和安排时间。2)答疑及时,操作问题可以随时响应,解决问题效率高。3)视频课程经过反复设计和打磨,可以根据自己的进度灵活调整,由浅入深,不怕跟不上。4)有导师定期跟进进度,确保能够跟上。目前来访的学员都可以掌握相应的技术,并且满意度都很高。


Q:价格及优惠活动

A:我们会推出在固定时间段内的优惠价格,具体以当期通知为准,在此基础上,可参加朋友圈集赞等优惠活动。





  
7.一对一学习方案
以下1对1学习方案现已开启,火热报名中!敬请关注“脑海科技学习中心”公众号:

一对一 | 大脑白质功能信号数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:白质功能信号相关研究进展概述、白质功能信号计算局部指标方法、白质功能脑网络创建、白质指标的统计分析与多重比较校正等。

一对一| 静息态数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:静息态功能磁共振入门、数据整理、静息态功能磁共振文献解读、数据预处理、局部指标与功能连接指标计算、统计分析与多重比较校正、结果汇报及可视化等

一对一 | 磁共振结构数据分析(VBM)基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:基于体素的形态学分析流程介绍、横向及纵向数据的结构像分割、数据质量检查、VBM项目实战演示与结果汇报等

一对一 | 弥散张量成像(DTI)数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:Linux 基础命令、头动校正、涡流校正、张量指标计算(FA、AD、MD、RD指标),基于体素水平的分析(VBA)、基于白质纤维骨架的统计分析(TBSS)等。

一对一 | 基于结构协变网络的格兰杰因果分析(CaSCN) | 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:CaSCN分析流程讲解、VBM分析、基于BCCT工具包的CaSCN分析、基于REST工具包的CaSCN分析、基于RESTplus工具包的CaSCN分析等。

一对一 | 独立成分分析与网络间连接(ICA+FNC)基础训练 | 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:ICA基本原理讲解、ICA参数设置讲解、独立成分挑选注意事项、大脑功能网络识别、FNC讲解与实操等

一对一  | 基于大脑皮层分析基础训练 | 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:FreeSurfer工具包介绍、recon-all步骤解析与命令实操、FreeSurfer生成结果讲解、统计分析与结果呈现等

一对一  | 共波动分析(Cofluctuation analysis) 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:共波动分析流程讲解、数据预处理与Scrubbing设置、共波动分析(RSS和方根计算)、高振幅时间点功能连接分析、高振幅时间点共波动的主成分分析等

一对一 | 脑影像元分析(META)基础培训 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:脑影像元分析入门及流程介绍、脑影像元分析文献解读、元分析文献检索、AES-SDM元分析基础操作、AES-SDM额外分析操作、ALE基础分析讲解与实操、脑影像元分析结果图表等

一对一 | 基于机器学习的脑影像数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:MATLAB编程入门、静息态脑影像数据分类特征的制作、常用核函数讲解、交叉验证方法讲解、信号提取与特征构建、支持向量机模型评价、项目实战等

一对一 |基于结构协变网络的网络攻击分析、模块化与拓扑属性(GAT)随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:基于结构协变网络分析概述、灰质形态学指标分析、基于结构协变网络分析、全局指标计算、节点指标计算、网络攻击分析、HUB节点分析、模块化分析、度分布分析等

一对一 | 基于滑动时间窗的动态分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

主要内容包含:动态分析方法概述、数据预处理、滑动窗参数设置、基于动态指标的统计分析、基于动态指标的聚类分析等

如有其他想要学习的内容,欢迎添加樊衍孜的微信反馈
(微信号:19906719439),我们将研发新的学习方案。




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