第二届 | 11.15-11.19 | 结构像数据分析实训 | 杭州

文摘   2024-11-04 20:13   山东  

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主办单位

杭州脑海科技有限公司

脑海科技认知神经科学实验室

承办单位

杭州脑呈科技有限公司


















1. 课程简介


基于体素的形态学分析(Voxel-Based Morphometry, VBM)是一种广泛应用于神经影像学研究中的技术,用于检测大脑结构的变化,特别是灰质体积的变化。为回馈广大医生及脑科学研究者,并助力大家迅速掌握静息态结构成像数据处理的相关知识,本次课程特别设计,旨在帮助每位学员快速具备独立进行数据分析的能力。采用课程+答疑的教学方式,确保每位学员都能够轻松上手。

课程亮点包括

多工具包讲解:结合多种VBM分析工具包进行讲解,涵盖CAT12、VBM8、FSL、FreeSurfer,帮助学员掌握多种结构像分析技能。

已发表案例详解:精选多角度的已发表研究案例,深入剖析实际应用中的分析方法和技术要点,帮助学员了解前沿进展,并启发创新思维。

绘图技巧精讲:教授专业绘图技巧,提升数据可视化水平,让您的研究成果更加生动、直观,易于传播。

通过本次课程的学习,您将不仅能够掌握扎实的理论知识,还能在实战演练中提升技能,为您的科研之路增添强大的动力。无论您是初学者还是有一定经验的研究人员,我们都将为您提供最贴心、最有效的指导和支持,让您在静息态功能磁共振研究领域迅速成长!选择我们,开启一段精彩纷呈的学习旅程吧!

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2. 学习内容


1.结构像数据分析(基于CAT12)
(1)结构像分析概述

    结构像数据及参数介绍

    结构像数据分析方法概述

    基于体素的形态学分析流程介绍

    CAT12工具包介绍

    VBM应用案例介绍

(2)VBM讲解与实操

    横向数据的结构像分割

    纵向数据的结构像分割

    数据质量检查

    数据预处理

    统计分析与多重比较校正

    皮层指标计算(层厚、沟深、皮层复杂度等)

    CAT12小工具使用讲解与实操

(3)VBM文献导读

    VBM文献检索

    已发表文献方法部分导读

    已发表文献结果部分导读

(4)项目实战

    VBM实战

    统计差异脑图制作

    三线表制作

2.结构像数据分析(基于VBM8)
(1)案例介绍

    已发表SCI案例方法讲解(案例分析流程、被试信息介绍、研究目的讲解等)

    例子数据参数讲解(结构像常见参数介绍)

(2)数据预处理

    VBM8工具包介绍

    VBM8分析流程讲解

    VBM8预处理参数设置

(3)灰质体积的组间比较

    全脑颅内总体积计算

    灰质体积的组间比较统计分析

    灰质mask的重采样

    灰质体积的组间多重比较校正(FDR校正、GRF校正等)

    基于特定团块的平均灰质体积比较

(4)差异结果汇报

    差异脑区三线表制作

    差异脑区空间可视化

    团块内灰质体积可视化(三线表制作)

3.结构像数据分析进阶(基于FSL
(1)结构像数据整理

    数据整理为FSL可使用的格式

(2)LINUX系统入门

    LINUX基本概念讲解

    LINUX常用命令介绍与使用

(3)FSL工具包介绍

(4)基于FSL的VBM分析

    基于FSL的VBM分析流程

    FSL命令使用分步骤讲解

    VBM分析结果介绍

(5)SCI已发表案例实操

    已发表SCI文献方法解读

    VBM结果汇报与图表制作

4.结构像数据分析进阶(基于FreeSurfer)
(1)FreeSurfer概述与recon-all命令

    FreeSurfer官网及工具包介绍

    recon-all步骤介绍

    recon-all结果介绍

    recon-all命令实操

    FreeView可视化操作

(2)recon-all结果查看与皮层指标统计

    recon-all生成结果讲解

    皮层指标提取:皮层表面积、皮层厚度、皮层灰质体积和皮下核团体积

    GLM准备文件讲解

(3)FreeSurfer统计分析与结果呈现

    GLM分析讲解与实操

    多重比较校正讲解


3. VBM的SCI应用案例


静息态功能磁共振研究发表众多的原因之一在于多批数据集应用不同的研究思路与方法可衍生出不同的课题,由此说明,分析思路对于课题的至关重要,本课程包含不同已发表成果案例讲解。
(1)多模态(功能像与结构像跨模态)已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词:多模态分析、灰质体积比较、基于体素的形态学分析、功能连接

课程主要内容

  • 文献方法部分解读

  • VBM原理及预处理实操

  • 功能像预处理原理及实操

  • 人口统计学与临床特征分析讲解

  • VBM分析实操

  • FC原理及实操

  • VBM结果汇报(层图、三线表、散点图等)

  • FC结果汇报
(2)患者治疗前后与对照组的灰质体积改变已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词:VBM8、灰质体积、治疗前后的形态学变化

课程主要内容详见结构像数据分析入门(基于VBM8)

 
(3)灰质体积、皮层厚度、皮层折叠指数分析已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词:基于体素的形态学分析,基于皮层的形态学分析

课程主要内容
  • 文献涉及技术原理介绍
  • 文献分析流程解读
  • 结构像分割原理
  • 结构像分割实操
  • VBM分析原理与实操讲解
  • SBM分析原理与实操讲解
  • 统计分析:GMV结果双样本t检验
  • 统计分析:CT与GI结果双样本t检验
  • 结果呈现: GMV结果图呈现
  • 结果呈现: CT与GI结果图呈现
  • 结果呈现:GMV结果脑区信息呈现
  • 结果呈现:CT与GI结果脑区信息呈现



4.脑影像绘图(多工具)


基础绘图

课程关键词:MRICRON、RESTplus、BrainNet、GRETNA、GraphPad等

进阶绘图

R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。本次培训侧重讲解如何使用R进行脑图呈现、相关图绘制、差异脑区信号图绘制等。

注:基础绘图与进阶绘图课程(原价1500元/人),现限时免费赠送:成功报名结构像数据分析实训后,免费赠送基础绘图与进阶绘图课程
以上课程均支持培训期间反复观看


5. 脑海科技相关介绍


脑海科技核心团队组建于2018年,公司位于萧山区紫橙国际创新中心3号楼6层及10层,是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司,已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”、“浙江省创新型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”,入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目,并通过ISO9001质量管理体系认证,并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。

2021年脑海科技成立了下属的研究实验室(脑海科技认知神经科学实验室)专注于神经影像相关的学术工作,脑海实验室目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇。实验室研究团队有着丰富的脑影像研究经验,目前已有近百余名研究生或医生的联合培养或短期访学的合作经验,联合培养了很多优秀的研究生,如:高*艳以主要作者发表SCI文章5篇、郝*奇以主要作者发表SCI文章6篇、李*婷以主要作者发表SCI文章6篇、孙*伟以主要作者发表SCI文章4篇、王*以主要作者发表SCI文章3篇、展*琳以主要作者发表SCI文章3篇等等(鉴于篇幅所限,仅列举部分同学)。学习中心核心团队具有丰富的SCI文章审稿经验,担任50余个SCI杂志审稿人,包括:Alzheimer's Research & Therapy、Molecular Autism、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、NeuroImage、BMC Psychiatry、Human Brain Mapping、Translational Stroke Research、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Autism Research等等。

贾熙泽,博士,杭州脑海科技有限公司创始人、浙江师范大学心理学院特聘教授、主要研究方向为静息态功能磁共振方法学及焦虑障碍的神经机制。自2013年起,师从臧玉峰教授从事静息态功能磁共振方法学研究,RESTplus软件包的开发人,负责REST-meta-PD 国际多中心项目。现兼任山东第二医科大学附属医院特聘专家、大连市友谊医院特聘教授、常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、山东第二医科大学医学影像学院硕士生导师及佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师等。现为中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员、浙江省康复医学会神经调控专委会委员,主持国自然青年基金项目1项、入选杭州市青年科技人才培育工程项目,目前以主要作者在Science Bulletin、 Human Brain Mapping、 The Journal of Headache and Pain 及 Journal of Affective Disorders 等杂志发表文章 30 余篇(第一作者或通讯作者),文章被 SCI 杂志引用1057次,h-index =16,担任 40余个SCI杂志的审稿人。

6. 报名及费用说明


(1)学习内容:结构像数据分析实训

(2)学习模式:学习规划 + 导师制 + 小组答疑(5人以内)  +  体系化视频课程  +  定期进度跟进 + 学习效果评估 + 完整案例数据

(3)硬件资源:每名学员配备2台电脑,1台用于观看学习视频,1台用于分析数据(Intel i7或以上配置)

(4)学习周期:5天

(5)答疑方式:每天下午固定16点进行小组答疑,数据分析遇到报错,助教随时响应并协助解决问题

(6)学习费用

2024年11月15日-11月19日期间到场学习,可享受优惠价3100元/原价4500元/人),转发朋友圈,集赞超过28个,立减200元(即2900元/人

注:交通及食宿费用自理

7. 报名流程及付款方式


报名可扫描以下二维码添加樊衍孜微信联系报名(扫描以下二维码或添加微信号:19906719439)

可开具能够报销的正式发票(如:技术服务费及培训费等)。支持预存,可以现场刷公务卡或银行卡转账,学习期间谢绝录像及录音。

电话咨询:0571-2883 4398(请按3号键)

微信咨询:199 0671 9439

邮箱咨询:fanyanzi@brainimaging.cn

实验室地址:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼6楼602室


8. FAQ


Q:课程具体是什么形式?
A:脑海科技团队录制了完整的讲课视频,并且整理了相应的数据分析工具、代码以及技术文档,报名的学员会有一份学习规划,可根据学习规划观看对应教学视频。操作问题助教随时响应,理论以及科研问题每天下午16:00进行小组答疑(5人以内)


Q:与传统培训班相比,学习效果怎么样?

A:远比传统培训班学习效果好, 1)学习时间集中且充足,每天包括9小时的学习时间(9:00 ~ 18:00),方便请假和安排时间。2)答疑及时,操作问题可以随时响应,解决问题效率高。 3)视频课程经过反复设计和打磨,可以根据自己的进度灵活调整,由浅入深,不怕跟不上。4)有导师定期跟进进度,确保能够跟上。目前来访的学员都可以掌握相应的技术,并且满意度都很高。


Q:价格及优惠活动

A:我们会推出在固定时间段内的优惠价格,具体以当期通知为准,在此基础上,可参加朋友圈集赞等优惠活动。

9. 更多学习方案欢迎详询

以下学习方案现已开启,火热报名中!敬请关注“脑海科技学习中心”公众号:

实训 11.15-11.19 | 静息态数据分析基础实训 | 杭州(点击跳转至链接)

一对一 | 大脑白质功能信号数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

一对一 | 静息态数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

一对一 | 磁共振结构数据分析(VBM)基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

一对一 | 弥散张量成像(DTI)数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

一对一 | 基于结构协变网络的格兰杰因果分析(CaSCN) | 随到随学(点击跳转至链接)

一对一 | 独立成分分析与网络间连接(ICA+FNC)基础训练 | 随到随学(点击跳转至链接)

一对一  | 基于大脑皮层分析基础训练 | 随到随学(点击跳转至链接)

一对一  | 共波动分析(Cofluctuation analysis) 随到随学(点击跳转至链接)

一对一 | 脑影像元分析(META)基础培训 随到随学(点击跳转至链接)

一对一 | 基于机器学习的脑影像数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

一对一 |基于结构协变网络的网络攻击分析、模块化与拓扑属性(GAT)随到随学(点击跳转至链接)

一对一 | 基于滑动时间窗的动态分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)

注:如有其他想要学习的内容,欢迎添加樊衍孜的微信反馈(微信号:19906719439),我们将研发新的学习方案。






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