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GROMACS每年发表文章10000篇+，在分子动力学领域的扛把子地位无可撼动。为让大家尽快了解和上手GROMACS，杨站长特此推出了这期GROMACS特训营！
本次特训营中，将包括GROMACS拓扑文件介绍，从根本上了解GROMACS，从而实现快速入门、多种建模方式和VMD展示模型！3. 使用Materials Studio构建二氧化硅纳米孔道；5. 使用GROMACS模拟油塞在纳米孔道内的形成；6. DNA在金属表面+葡萄糖在纳米管的吸附、解离、聚集；7. RMSD、RMSF、RDF、SDF、MSD；8. H-bonds、π-π、salt-bridge、密度、粘度、相互作用能。上课方式：添加下方微信好友，加入课程群，具体上课方式会在群内发布。GROMACS是一款用于分子动力学模拟的高性能开源软件包，它适用于从笔记本电脑到超级计算机的各种硬件。它的优势在于其高性能的计算能力，能够处理大规模生物分子系统；它支持多种力场，适用于广泛的研究领域；具有出色的可扩展性，可以很好地利用并行计算资源；以及拥有活跃的社区支持和丰富的文档资源，便于用户学习和使用。GROMACS在生物、医药、材料、化学等众多学科领域均有广泛的应用。主要用来模拟蛋白质、脂质、核酸等生物大分子体系，也可以用于非生物体系模拟，如聚合物、有机溶液等。可调用多种势函数/力场，支持各种系综、粗粒化，能够实现对百万级原子分子体系的计算。并且基于算法上的优化，其计算效率很高。GROMACS被广泛用于发表在顶级科学期刊的研究中，例如Nature、Nat. Nanotechnol.、Nat. Commun.、Nat. Sustain.、J. Am. Chem. Soc.、Angew. Chem. Int. Edit.、 Adv. Mater.、Bioinformatics等。这些出版物证明了GROMACS在学术界的影响力和认可度。生物领域是GROMACS称霸的应用领域，本次特训营将展示其在该领域的部分案例：![]()
DNA双螺旋结构在金属表面的吸附和脂质纳米囊泡结构特训营另一个重点内容就是固体模型建模和制作GROMACS力场文件：本期也将为大家展示储油岩层缝隙静态油滴模拟过程：![]()
1. 构象及构象变化、运动轨迹(RMSD、RMSF)原子、分子分布情况(RDF、SDF)4. 作用形式分析（H-bonds,π-π,salt-bridge）程老师：华算科技GROMACS授课老师，拥有十年以上GROMACS软件使用经验。主要研究领域为：分子动力学模拟方法在生物大分子体系、材料等领域的应用。上课方式：添加下方微信好友，加入课程群，具体上课方式会在群内发布。
