📖划重点
巴西圣保罗大学和美国加州的联合团队于2024年8月23日在《Microorganisms》杂志上发表了题为“New Iflavirus Species Characterized from Mosquitoes Captured in the Sao Paulo Zoological Facilities”的文章，对巴西圣保罗动物园捕获的蚊子进行了宏基因组分析，鉴定出一种新的Iflavirus，命名为Mosq_B20_SP01。该病毒基因组为单链正义RNA，包含一个编码2987个氨基酸的开放阅读框，其编码的多蛋白包含结构蛋白和非结构蛋白。系统发育分析表明，该病毒属于Iflaviridae和Riboviria。与其他已知的Iflavirus相比，它在衣壳区域的序列相似性低于90%，表明它可能是一种新的Iflavirus物种。本研究结果有助于扩展我们对巴西和全球蚊媒病毒组组成的认识，并为该地理区域蚊科病毒提供了一个病毒基因组参考。
关键词：蚊科，伊蚊，按蚊，库蚊，昆虫特异性病毒，宏基因组学，Iflavirus，新病毒鉴定
🔬研究背景
蚊媒病毒病是全球公共卫生的重大威胁，例如登革热、寨卡病毒病、黄热病等。近年来，随着宏基因组学技术的应用，研究人员发现了许多新的蚊子病毒，其中许多是昆虫特异性病毒。iflavirus是一种单链正义RNA病毒，主要感染节肢动物，包括蚊子。了解蚊子病毒组的组成对于监测蚊媒病毒的传播和发现新的病毒物种具有重要意义。
🧪采样方法
样品采集： 2020年，研究人员在圣保罗动物园共采集了866只雌性蚊子，包括库蚊属、伊蚊属和按蚊属。在动物园不同地点设置了16个陷阱，使用光（白色或紫外线）和二氧化碳引诱剂。每个采集的信息都记录在特定的公告中，包括使用的技术、气候变量、位置、日期、试管数量和采集周期。
样品前处理：将采样的昆虫在液氮中活体冷冻，置于正式鉴定的冻存管中，并运输到实验室，储存在 −80 °C 冰箱中。
1. 从23只按蚊样品中鉴定到一个完整的iflavirus基因组，命名为Mosq_B20_SP01，具有典型的iflavirus结构。全基因组长度为9709个核苷酸，其特征是正向单链，具有单个大ORF，编码2987个氨基酸的多蛋白。
2. 系统发育分析表明，Mosq_B20_SP01与蚊子感染iflaviruses具有较近的亲缘关系，与病毒科 Iflaviridae 和 Riboviria 领域有关
3. Mosq_B20_SP01的蛋白结构域与蚊子感染iflaviruses相似，但与感染家蚕的iflavirus flachiere存在差异。与其他已知的Iflavirus相比，Mosq_B20_SP01在衣壳区域的序列相似性低于90%，表明它可能是一种新的Iflavirus物种。
本研究发现了一种新的iflavirus病毒，为蚊子病毒多样性的研究提供了新的见解。该病毒的发现表明，蚊子病毒组中可能存在着未被发现的病毒物种，需要进一步的研究和监测。了解蚊子病毒组的组成对于控制蚊媒病毒病具有重要意义，并为开发新型控制策略提供了潜在的可能性。
1. 采用高通量测序和宏基因组学分析，克服了传统检测方法的局限性，可以全面地识别和鉴定样品中的病毒序列，更利于发现新病毒。
2. 提供了该地理区域蚊科的病毒基因组参考，该资源有助于未来在宏基因组数据集中对病毒基因组进行计算机识别和组装。
3. 利用Viral Host Predictor算法预测了Mosq_B20_SP01的宿主范围，为理解病毒的传播和生态提供了重要的信息。
4. 结合了病毒学、分子生物学、生物信息学和生态学等多学科知识，为蚊子病毒的研究提供了全面的分析。
