大脑磁共振数据预处理、分析和统计过程中,生成的中间数据和结果数据可能由于电脑系统问题、软件问题和算法问题出现一些错误,用错误的数据去做医学科研,影响科研的结果和医生的职业发展。如何确保中间各步骤的数据和结果数据的质量就非常重要。
medicalai.top 平台在装了Brainsuite BIDS App服务器上预置了Dashboard,可以一键式提供交互式可视化 的中间工作流输出,让您能够实时跟踪处理状态,并在发生错误时立刻识别错误。您不仅可以通过它来实时查看Brainsuite BIDS App的计算进程和中间数据、结果数据的质量,也可以用来验证您通过其他方式计算出来的中间数据和结果数据的质量。
1.实时查看计算进程和实时质量控制:
您只需要在运行Brainsuite BIDS App后,点击桌面的Brainsuite Dashboard字样的图标,弹出浏览器,里面显示主要步骤的图像结果和 QC 情况,绿色圆点指示合格,红色圆点指示错误。主要步骤都会产生一些图片的快照和合格与错误的指示,您可以看到实时的中间数据和结果数据的QC。如下图所示,
请点击下面视频,查看Brainsuite Dashboard 的QC图示输出演示(另外还有QC专门的报告),
2. 数据验证和QC:您也可以验证您通过其他软件或者其他方式计算出来的中间数据和结果数据。
如果您需要验证您的各种中间数据和结果数据,可以把您的数据按照Brainsuite BIDS App的要求和指定目录、格式,把您的数据放到平台上测试样品数据对应的输入文件夹和输出文件夹,然后点击 medicalAI 为您预置的Dashboard,您就可以在弹出的浏览器里看到您的大脑磁共振数据处理过程中的中间数据和结果数据有哪些是合格、可用的。如果需要,你也可以通过 Brainsuite BIDS App进行验算,再进行QC。
赛博尔医学算法和数据处理平台www.medicalai.top上的推出了主要基于Brainsuite BIDS App 和 Brainsuite 自动化的大脑磁共振数据预处理、常用的批量数据处理和分析算法: 自动生成大脑磁共振数据处理结果和分析报告,可批量进行数据预处理、数据处理和分析(请点击我浏览)
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备注:Brainsuite、 FSL、Freesurfer、 3D Slicer、ANTs、 Matlab Runtime、 AFNI、 Java、 Python、 R 等软件属于他们各自所属的开源组织和软件开发机构,请在发表论文时详细按照这些软件相关网站要求准确标注软件出处和引用的文章。
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