开源 vGPU 方案:HAMi,实现细粒度 GPU 切分

科技   2024-10-14 12:00   上海  



本文主要分享一个开源的 GPU 虚拟化方案:HAMi,包括如何安装、配置以及使用。

相比于 TimeSlicing 方案,HAMi 除了 GPU 共享之外还可以实现 GPU core、memory 的限制,保证共享同一 GPU 的各个 Pod 都能拿到足够的资源。

01

为什么需要 GPU
共享、切分等方案

开始之前我们先思考一个问题,为什么需要 GPU 共享、切分等方案?

或者说是另外一个问题:明明直接在裸机环境使用,都可以多个进程共享 GPU,怎么到 k8s 环境就不行了。

这里推荐阅读几篇文章:这两篇分享了如何在各个环境中使用 GPU,在 k8s 环境则推荐使用 NVIDIA 提供的 gpu-operator 快速部署环境

GPU 使用指南:如何在裸机、Docker、K8s 等环境中使用 GPU

GPU 环境搭建指南:使用 GPU Operator 加速 Kubernetes GPU 环境搭建

这两篇则分析了 device-plugin 原理以及在 K8s 中创建一个申请 GPU 的 Pod 后的一系列动作,最终该 Pod 是如何使用到 GPU 的。

自定义资源支持:K8s Device Plugin 从原理到实现

在K8S中Pod是如何使用到GPU的:device plugin&nvidia-container-toolkit 源码分析

看完之后,大家应该就大致明白了。

资源感知

首先在 k8s 中资源是和节点绑定的,对于 GPU 资源,我们使用 NVIDIA 提供的 device-plugin 进行感知,并上报到 kube-apiserver,这样我们就能在 Node 对象上看到对应的资源了。

就像这样:

root@liqivm:~# k describe node gpu01|grep Capacity -A 7
Capacity:
  cpu:                128
  ephemeral-storage:  879000896Ki
  hugepages-1Gi:      0
  hugepages-2Mi:      0
  memory:             1056457696Ki
  nvidia.com/gpu:     8
  pods:               110

可以看到,该节点除了基础的 cpu、memory 之外,还有一个nvidia.com/gpu: 8 信息,表示该节点上有 8 个 GPU。

资源申请

然后我们就可以在创建 Pod 时申请对应的资源了,比如申请一个 GPU:

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: gpu-pod
spec:
  containers:
  - name: gpu-container
    image: nvidia/cuda:11.0-base   # 一个支持 GPU 的镜像
    resources:
      limits:
        nvidia.com/gpu: 1          # 申请 1 个 GPU
    command: ["nvidia-smi"]         # 示例命令,显示 GPU 的信息
  restartPolicy: OnFailure

apply 该 yaml 之后,kube-scheduler 在调度该 Pod 时就会将其调度到一个拥有足够 GPU 资源的 Node 上

同时该 Pod 申请的部分资源也会标记为已使用,不会再分配给其他 Pod。

到这里,问题的答案就已经很明显了:

1)device-plugin 感知到节点上的物理 GPU 数量,上报到 kube-apiserver
2)kube-scheduler 调度 Pod 时会根据 pod 中的 Request 消耗对应资源

即:Node 上的 GPU 资源被 Pod 申请之后,在 k8s 中就被标记为已消耗了,后续创建的 Pod 会因为资源不够导致无法调度。

实际上:可能 GPU 性能比较好,可以支持多个 Pod 共同使用,但是因为 k8s 中的调度限制导致多个 Pod 无法正常共享。

因此,我们才需要 GPU 共享、切分等方案。

之前的一篇文章《一文搞懂 GPU 共享方案:NVIDIA Time Slicing》中给大家分享了一个 GPU 共享方案。

可以实现多个 Pod 共享同一个 GPU,但是存在一个问题:Pod 之间并未做任何隔离,每个 Pod 能用到多少 GPU core、memory 都靠竞争,可能会导致部分 Pod 占用大部分资源导致其他 Pod 无法正常使用的情况

今天给大家分享一个开源的 vGPU 方案 HAMi[1]

ps:NVIDIA 也有自己的 vGPU 方案,但是需要 license

02

什么是
HAMi?

HAMi 全称是:Heterogeneous AI Computing Virtualization Middleware,HAMi 给自己的定位或者希望是做一个异构算力虚拟化平台

HAMi 原身第四范式 k8s-vgpu-scheduler[2],这次改名 HAMi 同时也将核心的 vCUDA 库 libvgpu.so 也开源了。

但是现在比较完善的是对 NVIDIA GPU 的 vGPU 方案,因此我们可以简单认为他就是一个 vGPU 方案。

整体架构如下:

可以看到组件还是比较多的,涉及到 Webhook、Scheduler、Device Plugin、HAMi-Core 等等。

这篇文章只讲使用,因此架构、原理就一笔带过,后续也会有相关文章,欢迎关注~。

Feature

使用 HAMi 最大的一个功能点就是可以实现 GPU 的细粒度的隔离,可以对 core 和 memory 使用 1% 级别的隔离

具体如下:

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: gpu-pod
spec:
  containers:
    - name: ubuntu-container
      image: ubuntu:18.04
      command: ["bash", "-c", "sleep 86400"]
      resources:
        limits:
          nvidia.com/gpu: 1 # 请求1个vGPUs
          nvidia.com/gpumem: 3000 # 每个vGPU申请3000m显存 (可选,整数类型)
          nvidia.com/gpucores: 30 # 每个vGPU的算力为30%实际显卡的算力 (可选,整数类型)
  • nvidia.com/gpu:请求一个 GPU
  • nvidia.com/gpumem:只申请使用 3000M GPU Memory
  • nvidia.com/gpucores:申请使用 30% 的 GPU core,也就是该 Pod 只能使用到 30% 的算力

相比于上文分享了 TimeSlicing 方案,HAMi 则是实现了 GPU core 和 memory 的隔离。

在开源方案里面已经算是比较优秀的了。

Design

HAMi 实现 GPU core 和 memory 隔离、限制是使用的 vCUDA 方案,具体设计如下:

HAMi 使用的是软件层面的 vCUDA 方案,对 NVIDIA 原生的 CUDA 驱动进行重写(libvgpu.so),然后挂载到 Pod 中进行替换,然后在自己的实现的 CUDA 驱动中对 API 进行拦截,实现资源隔离以及限制的效果

例如:原生 libvgpu.so 在进行内存分配时,只有在 GPU 内存真的用完的时候才会提示 CUDA OOM,但是对于 HAMi 实现的 libvgpu.so 来说,检测到 Pod 中使用的内存超过了 Resource 中的申请量就直接返回 OOM,从而实现资源的一个限制。

然后在执行 nvidia-smi 命令查看 GPU 信息时,也只返回 Pod Resource 中申请的资源,这样在查看时也进行隔离。

ps:需要对 CUDA 和 NVML 的部分 API 拦截。

03

HAMi
部署

HAMi 提供了 Helm Chart 安装也是比较简单的。
部署 GPU Operator

需要注意的是 HAMi 会依赖 NVIDIA 的那一套,因此推荐先部署 GPU-Operator

参考这篇文章 --> GPU 环境搭建指南:使用 GPU Operator 加速 Kubernetes GPU 环境搭建

部署好 GPU Operator 之后再部署 HAMi

部署 HAMi

首先使用 helm 添加我们的 repo。

helm repo add hami-charts https://project-hami.github.io/HAMi/

随后,使用下列指令获取集群服务端版本。

这里使用的是 v1.27.4 版本。

kubectl version

在安装过程中须根据集群服务端版本(上一条指令的结果)指定调度器镜像版本,例如集群服务端版本为 v1.27.4,则可以使用如下指令进行安装。

helm install hami hami-charts/hami --set scheduler.kubeScheduler.imageTag=v1.27.4 -n kube-system

通过 kubectl get pods 指令看到 vgpu-device-plugin 与 vgpu-scheduler 两个 pod 状态为 Running 即为安装成功。

root@iZj6c5dnq07p1ic04ei9vwZ:~# kubectl get pods -n kube-system|grep hami
hami-device-plugin-b6mvj                          2/2     Running   0          42s
hami-scheduler-7f5c5ff968-26kjc                   2/2     Running   0          42s

自定义配置

官方文档:HAMi-config-cn.md[3] 

你可以在安装过程中,通过 -set 来修改以下的客制化参数,例如:

helm install vgpu vgpu-charts/vgpu --set devicePlugin.deviceMemoryScaling=5 ...
  • devicePlugin.deviceSplitCount:整数类型,预设值是 10。GPU 的分割数,每一张 GPU 都不能分配超过其配置数目的任务。若其配置为 N 的话,每个 GPU 上最多可以同时存在 N 个任务。

  • devicePlugin.deviceMemoryScaling: 浮点数类型,预设值是 1。NVIDIA 装置显存使用比例,可以大于 1(启用虚拟显存,实验功能)。对于有 M 显存大小的 NVIDIA GPU,如果我们配置devicePlugin.deviceMemoryScaling参数为 S ,在部署了我们装置插件的 Kubenetes 集群中,这张 GPU 分出的 vGPU 将总共包含 S * M 显存。
  • devicePlugin.migStrategy: 字符串类型,目前支持"none“与“mixed“两种工作方式,前者忽略 MIG 设备,后者使用专门的资源名称指定 MIG 设备,使用详情请参考 mix_example.yaml,默认为"none"
  • devicePlugin.disablecorelimit: 字符串类型,"true"为关闭算力限制,"false"为启动算力限制,默认为"false"
  • scheduler.defaultMem: 整数类型,预设值为 5000,表示不配置显存时使用的默认显存大小,单位为 MB
  • scheduler.defaultCores: 整数类型(0-100),默认为 0,表示默认为每个任务预留的百分比算力。若设置为 0,则代表任务可能会被分配到任一满足显存需求的 GPU 中,若设置为 100,代表该任务独享整张显卡
  • scheduler.defaultGPUNum: 整数类型,默认为 1,如果配置为 0,则配置不会生效。当用户在 pod 资源中没有设置 nvidia.com/gpu 这个 key 时,webhook 会检查 nvidia.com/gpumem、resource-mem-percentage、nvidia.com/gpucores 这三个 key 中的任何一个 key 有值,webhook 都会添加 nvidia.com/gpu 键和此默认值到 resources limit 中。
  • resourceName: 字符串类型, 申请 vgpu 个数的资源名, 默认: "nvidia.com/gpu"
  • resourceMem: 字符串类型, 申请 vgpu 显存大小资源名, 默认: "nvidia.com/gpumem"
  • resourceMemPercentage: 字符串类型,申请 vgpu 显存比例资源名,默认: "nvidia.com/gpumem-percentage"
  • resourceCores: 字符串类型, 申请 vgpu 算力资源名, 默认: "nvidia.com/cores"
  • resourcePriority: 字符串类型,表示申请任务的任务优先级,默认: "nvidia.com/priority"
除此之外,容器中也有对应配置:
  • GPU_CORE_UTILIZATION_POLICY: 字符串类型,"default", "force", "disable" 代表容器算力限制策略, "default"为默认,"force"为强制限制算力,一般用于测试算力限制的功能,"disable"为忽略算力限制
  • ACTIVE_OOM_KILLER: 字符串类型,"true", "false" 代表容器是否会因为超用显存而被终止执行,"true"为会,"false"为不会

我们只是简单 Demo 就不做任何配置直接部署即可。

04

验证

查看 Node GPU 资源

类似于之前分享的 TimeSlicing 方案,在安装之后,Node 上可见的 GPU 资源也是增加了。

环境中只有一个物理 GPU,但是 HAMi 默认会扩容 10 倍,理论上现在 Node 上能查看到 1*10 = 10 个 GPU。

默认参数就是切分为 10 个,可以设置。
$ kubectl get node xxx -oyaml|grep capacity -A 7
  capacity:
    cpu: "4"
    ephemeral-storage: 206043828Ki
    hugepages-1Gi: "0"
    hugepages-2Mi: "0"
    memory: 15349120Ki
    nvidia.com/gpu: "10"
    pods: "110"

验证显存和算力限制

使用以下 yaml 来创建 Pod,注意 resources.limit 除了原有的 nvidia.com/gpu 之外还新增了 nvidia.com/gpumem 和 nvidia.com/gpucores,用来指定显存大小和算力大小

  • nvidia.com/gpu:请求的 vgpu 数量,例如 1。

  • nvidia.com/gpumem :请求的显存数量,例如 3000M。

  • nvidia.com/gpumem-percentage:显存百分百,例如 50 则是请求 50% 显存

  • nvidia.com/priority: 优先级,0 为高,1 为低,默认为 1。

  • 对于高优先级任务,如果它们与其他高优先级任务共享 GPU 节点,则其资源利用率不会受到 resourceCores 的限制。换句话说,如果只有高优先级任务占用 GPU 节点,那么它们可以利用节点上所有可用的资源。

  • 对于低优先级任务,如果它们是唯一占用 GPU 的任务,则其资源利用率也不会受到 resourceCores 的限制。这意味着如果没有其他任务与低优先级任务共享 GPU,那么它们可以利用节点上所有可用的资源。

完整 gpu-test.yaml 内容如下:

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: gpu-pod
spec:
  containers:
    - name: ubuntu-container
      image: ubuntu:18.04
      command: ["bash", "-c", "sleep 86400"]
      resources:
        limits:
          nvidia.com/gpu: 1 # 请求1个vGPUs
          nvidia.com/gpumem: 3000 # 每个vGPU申请3000m显存 (可选,整数类型)
          nvidia.com/gpucores: 30 # 每个vGPU的算力为30%实际显卡的算力 (可选,整数类型)
Pod 能够正常启动
root@iZj6c5dnq07p1ic04ei9vwZ:~# kubectl get po
NAME      READY   STATUS    RESTARTS   AGE
gpu-pod   1/1     Running   0          48s
进入 Pod 执行 nvidia-smi 命令,查看 GPU 信息,可以看到展示的限制就是 Resource 中申请的 3000M。
root@iZj6c5dnq07p1ic04ei9vwZ:~# kubectl exec -it gpu-pod -- bash
root@gpu-pod:/# nvidia-smi
[HAMI-core Msg(16:139711087368000:libvgpu.c:836)]: Initializing.....
Mon Apr 29 06:22:16 2024
+-----------------------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 550.54.14              Driver Version: 550.54.14      CUDA Version: 12.4     |
|-----------------------------------------+------------------------+----------------------+
| GPU  Name                 Persistence-M | Bus-Id          Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp   Perf          Pwr:Usage/Cap |           Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|                                         |                        |               MIG M. |
|=========================================+========================+======================|
|   0  Tesla T4                       On  |   00000000:00:07.0 Off |                    0 |
| N/A   33C    P8             15W /   70W |       0MiB /   3000MiB |      0%      Default |
|                                         |                        |                  N/A |
+-----------------------------------------+------------------------+----------------------+

+-----------------------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                                              |
|  GPU   GI   CI        PID   Type   Process name                              GPU Memory |
|        ID   ID                                                               Usage      |
|=========================================================================================|
|  No running processes found                                                             |
+-----------------------------------------------------------------------------------------+
[HAMI-core Msg(16:139711087368000:multiprocess_memory_limit.c:434)]: Calling exit handler 16
根据最后的日志就是 HAMi 的 CUDA 驱动打印的。
[HAMI-core Msg(16:139711087368000:multiprocess_memory_limit.c:434)]: Calling exit handler 16

05

小结

本文主要分享了开源 vGPU 方案 HAMi,并通过简单 Demo 进行了验证。

为什么需要 GPU 共享、切分?

在 K8s 中使用默认 device plugin 时,GPU 资源和物理 GPU 是一一对应的,导致一个物理 GPU 被一个 Pod 申请后,其他 Pod 就无法使用了。

为了提高资源利用率,因此我们需要 GPU 共享、切分等方案。

HAMi 大致实现原理

通过替换容器中的 libvgpu.so 库,实现 CUDA API 拦截,最终实现对 GPU core 和 memory 的隔离和限制。

更加详细的原理分析,可以期待后续文章~

参考资料

[1] HAMi:
https://github.com/Project-HAMi/HAMi
[2] 第四范式 k8s-vgpu-scheduler:
https://github.com/4paradigm/k8s-vgpu-scheduler
[3] HAMi-config-cn.md:
https://github.com/Project-HAMi/HAMi/blob/master/docs/config_cn.md




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