scientific data | 用于深度学习的带有病理诊断注释的甲状腺结节超声数据集

文摘   2024-12-02 09:02   广东  
2024.11.23. 上海交通大学医学院附属仁济医院、哈尔滨医科大学研究团队在《scientific data》上发表研究文章 “An ultrasonography of thyroid nodules dataset with pathological diagnosis annotation for deep learning”,甲状腺结节超声数据集与病理诊断标注深度学习

甲状腺结节的超声检查(US)通常很耗时,并且观察者之间可能不一致,活检中恶性肿瘤的阳性率较低。即使在确定超声甲状腺成像报告和数据系统(Thyroid Imaging Reporting and Data System, TIRADS)阶段后,仍需要细针穿刺活检(FNAB)以获得明确的诊断。尽管在医学领域开发了各种深度学习方法,但它们往往使用TIRADS报告作为图像标签进行训练。

本研究为每个病例提供了一个带有病理诊断注释的大型US数据集,旨在开发深度学习算法,以直接从甲状腺超声图像中推断组织学状态。该数据集收集自两个回顾性队列,包括842例病例的8508张US图像此外,还解释了三个深度学习模型,这些模型用作使用该数据集的验证示例。

甲状腺图像实例


数据集结构概述


本研究中提出的深度学习框架


文章链接

https://doi.org/10.1038/s41597-024-04156-5
Hou, X., Hua, M., Zhang, W. et al. An ultrasonography of thyroid nodules dataset with pathological diagnosis annotation for deep learning. Sci Data 11, 1272 (2024).
本研究中使用的代码是用Python3编写的,可在GitHub上获得。代码基于PyTorch(1.6版)。

https://github.com/TomHardy1997/ThyUS2Path


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