小核仁RNA (Small nucleolar RNA, snoRNAs)是非编码RNA,以指导RNA修饰而闻名,包括2'-O-甲基化(Nm)和假吡啶(Ψ)。虽然snoRNA也可能与其他RNA(如mRNA)相互作用,但由于缺乏有效的技术来识别snoRNA靶转录组,因此snoRNA靶向的全部RNA仍然难以捉摸。
2024年11月22日,芝加哥大学何川团队在Cell 在线发表题为“snoRNA-facilitated protein secretion revealed by transcriptome-wide snoRNA target identification”的研究论文,该研究开发了一种基于化学交联的方法,全面检测snoRNAs的细胞RNA靶点,在人类细胞和小鼠脑组织中产生数千种以前未被识别的snoRNA-mRNA相互作用。何川是中国科学技术大学8912校友。
许多相互作用发生在snoRNA引导的RNA修饰位点之外,这暗示了RNA修饰之外的非规范功能。该研究发现其中一个snoRNAs, SNORA73,靶向编码分泌蛋白和膜蛋白的mRNA。SNORA73还与7SL RNA相互作用,7SL RNA是蛋白质分泌所需的信号识别颗粒(SRP)的一部分。mRNA-SNORA73-7SL RNA相互作用增强了SNORA73靶mRNA与SRP的关联,从而促进编码蛋白的分泌。