【青年学者说】沉积植物古DNA在第四纪植被重建中的应用

科技   2024-10-12 17:30   甘肃  

随着气候变化和人类活动对地球生态系统的影响日益加剧,理解过去的植被变化对于预测未来生态趋势和制定保护策略至关重要。最近,一篇由徐海涛、李泉和赵艳共同完成的综述文章,通过分析沉积植物古DNA,为我们展示了一个重建第四纪植被变迁的分子生物学工具。

沉积植物古DNA研究地点示意图

这项研究的核心在于利用沉积植物古DNA(Plant sedimentary ancient DNA, PsedaDNA),这是一种从沉积物中提取的古植物DNA,它能够提供比传统形态学分类方法更精细的物种信息。通过这种方法,研究人员可以在分子水平上揭示植物的生物性状、种类、丰度和演化过程,同时记录植被对气候和环境变化的响应,极大地提高了我们对古植被重建的能力。

文章首先分析了沉积植物古DNA保存的主要影响因素,包括温度、含氧量、含水量、pH值和沉积物中矿物的组成等。尽管植物DNA分子结构相对脆弱,但在特定的沉积环境中,如多年冻土和湖泊沉积物中,古DNA可以得到良好的保存。

其次,文章概述了沉积植物古DNA分析的流程,包括沉积物的采集、古DNA的提取、DNA的扩增与测序,以及最终的序列分析。尽管沉积植物古DNA在沉积环境中容易降解,但通过现代分子生物学技术,科学家们已经能够成功提取并分析这些宝贵的分子化石。其中,还介绍了古DNA检测技术,对目前主要的2种检测技术:宏条形码技术和鸟枪法宏基因组技术进行了详细阐述,这些技术能够高通量地鉴定物种,提供更全面的古生物群落情况。

沉积植物古DNA分析的简化流程图

沉积植物古DNA 序列的鉴别方法对比表

此外,文章分析了沉积植物古DNA技术在古植被重建中的应用,结果表明,沉积植物古DNA分析在重建植物群落动态演变过程、气候与环境变化以及生态演化对人类活动的响应等方面具有显著优势。通过这种方法,研究人员能够重建植物群落演变过程,定量、半定量重建古气候,并探究人类农牧活动对生态系统的影响。该研究不仅为古植被研究领域带来了新的视角,也为应对当前全球变化背景下的生态保护提供了科学依据。沉积植物古DNA技术在古植被重建中的应用,也为我们理解气候变化和人类活动如何影响生态系统提供了新的工具。例如,通过分析湖泊沉积物中的古DNA,科学家们能够揭示植物群落对气候变化的响应,以及人类活动如何改变植被分布和多样性等。

尽管沉积植物古DNA技术在古生态学研究中展现出巨大的潜力,但文章也指出了当前研究面临的挑战,包括沉积植物古DNA的保存和降解问题、实验方法的优化、实验过程中的污染问题,以及数据分析体系的完善等。为了克服这些挑战,未来的研究需要构建更加完善的植物物种DNA分类参考数据库,加强沉积植物古DNA分子的埋藏学研究,并推广其在第四纪古环境研究中的应用。

总之,沉积植物古DNA技术的发展和应用,不仅为我们提供了一种新的视角来研究古植被和古环境,也为应对当前全球变化的挑战提供了重要的科学依据。随着技术的不断进步和数据库的完善,我们有理由相信,沉积植物古DNA分析将在未来的古植被与气候变化研究中发挥更加重要的作用。

该研究得到国家重点研发计划项目(编号:2022YFF0801501)和国家自然科学基金项目(编号:42277454,41977395)的联合资助,相关成果已经在《地球科学进展》2024年第8期发表。

徐海涛, 李泉, 赵艳. 沉积植物古DNA 在第四纪植被重建中的应用[J].地球科学进展, 2024,39(8): 801-812. DOI:10.11867/j.issn.1001-8166.2024.064.
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《地球科学进展》是由中国科学院西北生态环境资源研究院和国家自然科学基金委员会地球科学部联合主办的综合性、学术性刊物,主编郭正堂院士。

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