这篇《Cell》论文的3位共同第一作者中,有一对博士生夫妇——余延辉和刘塬方。从本科到读博都在华中农业大学,科研为两人牵起了“红线”。今年,他们迎来了科研的结晶,也诞生了爱情的结晶——可爱的女儿萱萱。夫妇俩感慨地说:“科研之路尽管艰苦,但更多的是幸福。”余延辉2012年考入华中农大植物科学技术学院。两年后,刘塬方也考入同一个学院。然而直到2020年,他们才在严建兵教授举办的一次学术会议上认识,当年9月结为夫妻。余延辉、刘塬方和导师华中农大校长严建兵教授(左一)在讨论课题(朱熙勇 摄)
余延辉、刘塬方在家陪半岁的女儿玩电子琴(朱熙勇 摄)
在作物遗传改良全国重点实验室,余延辉、刘塬方夫妇正在做实验(蒋朝常 摄)
在作物遗传改良全国重点实验室,余延辉、刘塬方夫妇在测量玉米穗部表型(蒋朝常 摄)
在作物遗传改良全国重点实验室,余延辉、刘塬方夫妇用显微镜观察玉米籽粒切片(朱熙勇 摄)
2024年11月12日,《细胞》(Cell)杂志在线发表了华中农业大学严建兵教授团队的研究论文“A Zea genus-specific micropeptide controls kernel dehydration in maize”,为打开籽粒脱水这扇大门找到了一把有效的钥匙。研究鉴定到一个影响籽粒脱水的小肽microRPG1,是玉米及其近缘种中特有的一种含31个氨基酸的新型小肽,由非编码序列从头起源,通过精确调节乙烯信号通路关键基因的表达来控制籽粒脱水。该研究首次揭示了玉米籽粒脱水的分子机制(图1),为快脱水宜机收玉米培育奠定重要基础。玉米是我国种植面积最大、总产量最高的作物,但长期受限于缺乏快脱水的品种,玉米机械粒收水平较低,影响了生产效率和种植成本。迄今为止,控制籽粒脱水速率这一性状的基因很少被克隆,其潜在机制尚不清楚,这是难以通过遗传改良培育快脱水宜机收玉米品种的根本原因。研究团队围绕这一产业关键问题持续攻关,建立了籽粒脱水表型田间鉴定技术,利用该技术通过QTL定位,定位到四个影响籽粒脱水的QTL(图2A),本研究对其中一个主效QTL-qKDR1进行了精细定位,并成功缩小至1417-bp,发现是一段不编码任何蛋白也不转录的DNA序列,在目标区域双亲之间存在一个约6.2Kb的转座子序列(图2)。敲除双亲序列后,不管是否含有转座子,都能导致籽粒脱水速率显著降低。分析表明,qKDR1可能作为一个抑制子,抑制其上游约10Kb处一个名为RPG (qKDR1 REGULATED PEPTIDE GENE)基因的表达。进一步研究发现,RPG就是qKDR1调控的目标基因,两个转录因子ZmMYBST1和ZmMYBR43可以结合到qKDR1而抑制RPG的表达。RPG在玉米基因组中尚未被注释,是一个全新的基因。研究团队通过多种技术共同证明了RPG通过编码一段31个氨基酸的小肽发挥功能,命名为microRPG1。敲除microRPG1可加快脱水速率,超表达则显著降低脱水速率。进一步研究发现microRPG1可能通过调控乙烯信号途径中的关键基因ZmEIL1和ZmEIL3的表达而影响脱水。RPG在授粉后26天的籽粒中表达,在38天达到最高,此时玉米籽粒灌浆基本结束,调控乙烯的表达可以促进籽粒的快速脱水,又不影响产量,实现了产量和脱水的平衡。这一发现也为下一步籽粒脱水的精准调控提供了新思路。microRPG1和任何已知的小肽并不同源,在其它物种中也未被鉴定到,是玉米及其近缘种特有的,其如何起源是一个值得探究的问题。研究发现,该小肽仅在玉蜀黍属和摩擦禾属中存在同源序列,在禾本科的其他成员中没有。虽然相似的序列存在于摩擦禾属中,但缺乏起始密码子,不能翻译,无法行使功能。在玉蜀黍属中,一个核苷酸(ACG到ATG)的突变产生了新的起始密码子,导致一段非编码序列起始翻译,从头产生了一个新基因。系统发育树表明,该突变可能发生在65万年前玉蜀黍属和摩擦禾属分化之后(图3),该发现为新基因的起源提供了一个新的范例,也为从头创造新基因提供了方向。图3. microRPG1小肽从头起源于一个非编码序列
这一独特的小肽在其它物种中是否起作用?研究团队体外合成该小肽并外源施加于拟南芥,发现可以显著延迟角果的成熟,并显著提高了拟南芥种子的水分含量。在拟南芥中超表达microRPG1,也能够显著延迟角果的成熟。拟南芥的根可以吸收小肽并可以被运输到地上部分。这些结果暗示microRPG1小肽在其它物种中可能具有保守的功能,这为进一步探索该小肽的应用价值提供了富有想象的空间。适合机械化收获的玉米籽粒含水量要求在15%至25%之间,但我国大多数玉米品种在收获时的含水量通常在30%至40%之间。多年多点的试验表明,敲除microRPG1可使收获时的籽粒含水量下降2%至17%,平均下降7%,同时其他农艺和产量性状没有明显的变化。研究团队分析了数百份具有代表性的玉米种质材料,发现几乎所有的材料都存在RPG基因,意味着操纵RPG来改变籽粒脱水速率培育宜机收的品种具有巨大的应用潜力。据悉,团队围绕玉米籽粒脱水的精准调控已经布局多个专利,并授权未米生物公司开展商业化应用,目前已经取得良好进展。作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室、崖州湾国家实验室严建兵教授为该论文的通讯作者。博士研究生余延辉、刘塬方,青年教师李文强副教授为该论文的共同第一作者,华中农业大学刘衍军教授、欧阳亦聃教授、杨宁教授、肖英杰教授、赖志兵教授、殷平教授、卓琳老师,华中农业大学讲座教授David Jackson,未米生物科技有限公司许洁婷博士,华中科技大学薛宇教授,崖州湾国家实验室主任科学家刘海军研究员、贾安强博士,以及德国马普分子植物生理研究所Alisdair R. Fernie教授等多个团队的师生参与了该项工作或提供了有价值的讨论。该研究得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、湖北省科技厅重大项目及111计划等项目的支持。https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.10.030