R 进行荟萃分析的实践指南

学术   教育   2023-08-31 18:07   中国台湾  

Hi, 我是钟多少玲

谢谢你看到这里🌈

本期分享一份用R做meta分析的(免费)线上资源

note: 本期预计阅读时间 4 分钟

note: 总结cc ChatGPT 3.5

背景

荟萃分析/元分析(meta analysis)的研究步骤可以分为:确定问题——文献检索——筛选文献——质量评估——数据提取——综合分析

Fig. IWH systematic review steps and stakeholder engagement (Irvin, Van Eerd et al, 2010; Keown, Van Eerd & Irvin, 2008)

往期推送介绍了其中几个步骤

  • 研究注册👇

90%的人不知道META分析这1步有多关键 |PROSPERO注册

  • 文献检索👇

从一个实例说说文献检索的二三事|meta分析

如何选择检索数据库|荟萃分析

  • 文献筛选👇

轻巧解决META分析的摘要筛选 | Rayyan教程

Meta分析筛选文献的一把好手—— Covidence 安利贴

  • 初学者学习meta分析可以参考的资源👇

荟萃分析入门,看什么教材靠谱?

而荟萃分析中关键的环节——数据分析还未涉及

实际上,由于meta分析的普及性,目前市面上已有多个工具可用于数据整合分析

如专用工具 RevMan

常用数据分析软件 Stata、R 等

我在以往的研究经历中主要使用了R 工具,其原因已有过解释——R 功能强大且免费,并拥有开放的社区👇

想自学R语言,从哪里入门|R教程

在边学习边实操用R进行荟萃分析的过程中,《使用 R 进行荟萃分析:实践指南》一书对我的帮助不可忽略

难能可贵的是,这本书的线上版本使得实践更加便捷

因此,本期着重介绍 《如何使用R进行荟萃分析:实践指南》一书的内容

Doing Meta-Analysis with R

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简介

Doing Meta-Analysis in R: A Hands-on Guide 《如何使用R进行荟萃分析:实践指南》

网站:https://bookdown.org/MathiasHarrer/Doing_Meta_Analysis_in_R/

作者:Mathias Harrer, Pim Cuijpers, Toshi A. Furukawa, David D. Ebert

这本书简要介绍了如何在 R 中进行荟萃分析

本书作者多为心理学和公共卫生背景,因此对初学者相当友好

无论初学者还是有一定经验的研究者,这些内容都能帮助你更深入地理解和应用荟萃分析

从R开始

对R初学者和荟萃分析初学者都很友好

从R的基本介绍、安装、资源包、数据导入和转换、保存均一一介绍

基本方法

荟萃分析的基本步骤——

涵盖了效应值分析、森林图、异质性诊断、亚组分析、荟萃回归,以及发表偏倚分析

以绘制森林图为例

每个步骤都详细描述了原理、代码、参数说明,并提供了示例

高级方法

除了基础内容,本书还涵盖了一些高级分析方法

如网络荟萃分析、贝叶斯元分析方法以及 SEM 元分析

和基础方法一样,描述了原理、代码、参数说明,并提供了示例

以网络荟萃分析为例

实用工具

荟萃分析中可能涉及到的其它方面,包括效力分析、偏移风险图、效应值计算和转换

总结

本期介绍了——《如何使用R进行荟萃分析:实践指南》

无论是初学者还是正在实施过荟萃研究,本书都将提供实用的指导,教你如何使用 R 进行荟萃分析

通过这个在线版本,你可以轻松掌握荟萃分析的精髓,为你的研究增添新的方法和视角

开始你的荟萃分析之旅吧!🚀

Reference: Harrer, M., Cuijpers, P., Furukawa, T.A., & Ebert, D.D. (2021). Doing Meta-Analysis with R: A Hands-On Guide. Boca Raton, FL and London: Chapman & Hall/CRC Press. ISBN 978-0-367-61007-4.

正文图片:见图片下注释或参考文献

封面图片:Pixabay



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