NepTrainKit NEP训练集可视化软件

学术   2024-12-19 19:37   中国台湾  

NepTrainKit 是一个专注于NEP训练数据集的操作与可视化的工具包,主要用于简化和优化 NEP训练集的制作,提供直观的图形界面和分析工具,帮助用户更高效地制作势函数。

项目链接
https://github.com/aboys-cb/NepTrainKit
文档链接
https://neptrainkit.readthedocs.io/en/latest
视频教程
https://www.bilibili.com/video/BV1MskJY2EEz

2 演示例子:

2.1 数据导入 

在本部分,我们仅使用 nep.txttrain.xyz 两个文件。你可以将任何文件直接拖入软件窗口进行加载。加载后的界面如下所示,红星标记表示右侧结构在训练集中的位置。

2.2 轨迹播放 

接下来,我们介绍轨迹播放功能。在结构索引输入框的右侧,有一个播放按钮。点击后,系统将逐帧播放轨迹,这是一个预览功能。

2.3 数据集编辑 

接下来,我们将演示如何编辑和筛选训练集。 

2.3.1 最大误差选点

首先,根据能量的最大误差选取前10个点并删除。  

2.3.2 最远点取样稀疏 

本训练集包含约200个结构。我们设置最小距离为0.01,最多保留100个结构。  

2.3.3 手动选择 

接下来演示如何手动选择和取消选择结构。 

2.3.4 Config_type 选择 

接下来,我们演示如何使用 Config_type 进行选择。 

该工具通常与上述三个功能联合使用,以便更精确地筛选结构。下面展示如何将 Config_type 与最远点取样结合使用。基于最远点取样稀疏,我们保留了 AIMD 结构。   

2. 4 导出数据集 

最后,在删除选定结构后,我们可以导出筛选后的数据集。  

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