Small Methods|重大罗阳/山大二院王传新/张洪团队构建RECOGNIZER体系用于呼吸道病毒多重检测

学术   2025-01-25 14:17   浙江  

近日,重庆大学医学院罗阳教授联合山东大学第二医院王传新教授张洪博士后在《Small Methods》发表题为“Commercial Strip-inspired One-pot CRISPR-based Chip for Multiplexed Detection of Respiratory Viruses”的文章,并获选为2025年首期封面文章。该文章以商业妊娠试纸作为结果输出载体,构建了RECOGNIZER(Re-building commercial pregnancy strips via large-size nanoflowers)检测体系,可在25分钟内同时检测4种呼吸道病毒。该体系利用具有大比表面积的DNA纳米花(DNFs)用于人体绒膜促性腺激素(hCG)报告探针的高效装载,信噪比达到10倍以上。经等温扩增预处理后,该方法检出限低至10 拷贝/微升,且50例临床咽拭子样本验证准确率达100%。RECOGNIZER体系具有高度的可编程性,有望成为用户友好的病毒感染监测平台,为病毒大流行的应急救援提供技术支持。

RECOGNIZER标准检测流程包括样本裂解、一步法信号扩增和微流控芯片读取,仅需25分钟即可实现四种不同呼吸道病毒的同步检测。

  图1.RECOGNIZER检测原理

利用滚环扩增技术合成的DNFs呈现花状结构,平均粒径约为1 μm,储存200天后仍然保持稳定。

    图2 DNFs的合成与表征

利用化学耦连将hCG蛋白标记在核酸探针上,并与DNFs杂交成功制备hCG-DNFs。相较于其他捕获技术(如hCG-RCA,hCG-beads等),hCG-DNFs显著提升hCG捕获效率,且具有更高的CRISPR切割效率,信噪比超10倍。进一步构建四通道微流控芯片,可最低检测到0.1 nM的新冠核酸样本。

  图3 hCG-DNFs的制备与性能验证

进一步对影响链置换和CRISPR切割反应的关键因素(如DNFs杂交比例、序列设计、缓冲液浓度、反应时间等),以达到最佳检测灵敏度。

  图4 RECOGNIZER条件优化

在优化的反应条件下,系统地验证了RECOGNIZER的检测性能。RECOGNIZER对核酸片段的最低检出限达5.42 皮摩尔。利用等温扩增对病毒颗粒进行预扩增,RECOGNIZER可最低检测到10拷贝/微升的病毒颗粒,满足大规模筛查需求。与此同时,RECOGNIZER具有较高的特异性、可重复性和稳定性。50例临床样本检测结果准确率达100%。

    图5 RECOGNIZER检测性能验证

为拓展RECOGNIZER检测场景,研制高通量呼吸道病毒检测芯片及读取应用软件,仅需简单的加样、扫描步骤,即可实现4种不同呼吸道病毒(新型冠状病毒、中东呼吸系统综合征冠状病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒)的同步检测,最低检出限分别达到5.42 皮摩尔、5.85皮摩尔、4.38 皮摩尔和6.34皮摩尔。

    图6 高通量呼吸道病毒联合检测芯片验证

综上所述,本研究以商业妊娠试纸为读取载体,构建了快速、可编程、超敏的高通量呼吸道病毒检测平台,极大地简化了商业试纸条开发流程。

来源 重大检验

编辑  老Q


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