日前，我校2019级公共卫生学院本科生庄楷、2021级药学院本科生王丽珊，以共同第一作者身份在中科院一区TOP期刊Molecular Cancer（2023IF=27.7）上发表了题为“Assessment of SWI/SNF Chromatin Remodeling Complex Related Genes as Potential Biomarkers and Therapeutic Targets in Pan-cancer”的研究论文，该研究联合生物信息学和单细胞测序在理解SWI/SNF染色质重塑复合体(SCRC)在多种癌症中影响预后和免疫微环境提供新见解。药学院鲁澄宇教授、暨南大学药学院刘志平教授也并列共同第一作者。本科生钟昊和研究生杨东力参与本项课题。研究生院副院长黄遵楠教授与特聘副研究员王娇娇为本文通讯作者。
论文链接：
https://doi.org/10.1186/s12943-024-02015-w
以往研究发现，SWI/SNF染色质重塑复合物（SCRC）亚基编码基因的突变频率和异常表达程度高。然而，SWI/SNF基因的致癌效应直到近期才受到关注，研究相对有限。在这项研究中，团队全面分析了SCRC相关基因（SCRGs）在泛癌中的表达差异、体细胞突变、潜在生物通路、基质或免疫细胞浸润以及药物敏感性。研究结果表明，SCRGs在14种肿瘤类型中有13种出现表达变化，与预后密切相关，并且在30.9%的肿瘤患者中存在突变。此外，SCRGs与免疫相关通路和肿瘤转移通路密切相关。SCRGs的表达与免疫评分和基质评分呈正相关，但与肿瘤纯度呈负相关。研究还发现了三种潜在药物，包括WZ3105, Ispinesib mesylate和FK886，可以靶向SCRC。
流程图
在KIRC中，单细胞RNA测序分析显示，随着肿瘤细胞进展，SCRC的富集水平不断降低。而SCRC的富集度和与免疫细胞的交流频率在肿瘤细胞进展过程中显著下降。此外，研究团队还在KIRC中构建了一个预后模型，并证明其在预测KIRC免疫治疗响应中的有效性。本研究将SCRGs鉴定为潜在的生物标志物和治疗靶点，并揭示了其与免疫微环境和转移的潜在关联，为肿瘤靶向治疗提供了新的见解。
庄楷：2019级卫生检验检疫专业，本文第一作者，以第一或共一作者分别在Mol Cancer，Gene Dis和Front Mol Biosci发表SCI论文各1篇，累计影响因子39.1分。作为项目负责人获得第十七届“挑战杯”广东大学生课外学术科技作品竞赛一等奖。主持广东省科技创新战略专项资金（攀登计划），广东省大学生创新创业训练项目。获得广东省学位与研究生教育学会优秀教学成果奖一等奖。现已被中山大学录取硕士研究生。
王丽珊：2021级药学专业，本文共同第一作者。擅长多组学数据分析，包含转录组学，单细胞组学和空间组学等，立志探究癌症的发生和演进的生物学机制。曾获得第十七届“挑战杯”广东大学生课外学术科技作品竞赛一等奖。参与国家级和广东省大学生创新创业训练项目。
该论文作为墙报展出（左/杨东力 中/庄楷 右/王丽珊）
“黄老师，感谢您的悉心指导！我们在广东省‘挑战杯’竞赛中获得了一等奖！”、“老师，我被中山大学录取了，真心感谢您的帮助！”微信上，王丽珊和庄楷激动地向表达感激之情。
这个本科生科研团队，八年传承下，共主持了创新创业项目国家级14项、省级14项，校级60余项以及省攀登计划6项。他们以第一作者或共同一作发表了30篇高质量的学术论文，累计影响因子160余，并在省‘挑战杯’竞赛中荣获一等奖5项、二等奖3项、三等奖2项。
“学生不仅要‘学会’知识，还要学会‘用’知识。”作为指导老师，黄遵楠不仅为团队指明了科研方向，还传授了严谨的实验设计、数据分析和论文撰写技巧。他激励同学们独立思考、勇于创新，并强调了团队合作的重要性。通过启发式教育，激励学生独立思考。每个成员都被鼓励参与科研项目，锻炼从实验设计到数据分析的全流程能力。
“能看到有学生从科研写作的新手到经过创新科研培训，到成长为科研写作能家，并具有独立科研能力，是非常让老师感到欣慰的。”本科生参与也给黄遵楠团队的科研带来了强力的催化作用。2016年黄遵楠带领本科生开展创新科研以来，他以（共同）第一或通讯作者发表76篇SCI论文，累计影响因子高达380余分，并且每年论文的发表量也在递增。在他看来，本科生的思维非常活跃，创新能力总体非常强，只要给予他们信任，他们就能设计出很好的课题思路，常常能给他带来不少启发。
信源 | 科学技术部
责编 | 王丽君
复核 |谢炯明
审发 | 裴金涛
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