产品目录
01
5K 育种家芯片 辅助育种
02
20K 低密度作图芯片 遗传图谱
03
60K 中高密度芯片 遗传图谱
04
120K 高密度芯片 QTL定位
05
800K 超高密度芯片 群体分析
06
外显子捕获芯片 突变库检测
07
转录组测序 表达分析/BSR
08
重测序 群体研究/低丰度测序
预存活动
1
预存≥3万元 预存期大于3个月
所有项目95折
2
预存≥5万元 预存期大于3个月
所有项目9折
以上预存活动时间限2024.10-2024.12
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产品简介
01 - 5K育种家芯片
利用3000份国内外品种材料群体遗传多样性数据开发,包含群体遗传多样性位点、小麦品种真实性鉴定SNP标记法包含的96个SNP位点。能够有快速有效进行遗传关系分析、回交后代背景恢复率分析、品种真实性验证等用途,是性价比最高的低密度芯片。为了更好地服务于小麦分子育种,5K芯片包含了目前公开发表的功能基因,QTL及GWAS位点等超过2000个功能标记位点,涵盖数十个抗病及农艺性状基因、标记。
图1 公开报道的产量形状位点(shuanghe cao etc., 2020)
图2 公开报道的部分农艺性状位点(《The Wheat Genome》,Chittaranjan Kole)
02 - 20K低密度作图芯片
TC-Wheat-Core-20K 从全球范围内5000份小麦种质资源数据中挑选最具有遗传代表性的20K位点,包含了1500份国外品种及3500份国内骨干亲本、历史品种、地方品种及现代品种的核心多态性位点。TC-Wheat-Core-20K 检测结果提供多基因组位置信息,可帮助科研工作进行准确的遗传图谱构建。
图3 20K芯片标记在基因组上的分布
03 - 120K高密度芯片
Agriculture
应用
种质资源鉴定
BSA定位
关联分析
遗传作图
小麦120K芯片(120K-4HWA)由中国农业科学院作物科学研究所贾继增研究员团队与成都天成未来科技有限公司合作开发。基于55K/660K芯片位点及超过5000份国内外自然群体数据设计,包含55K芯片中的部分位点,可兼容55K的芯片检测数据。芯片在基因组均匀覆盖及功能基因密度分布上做到平衡。120K-4HWA是目前小麦种质资源精准鉴定工作及功能研究性价比最高的芯片之一。
图4 120K芯片中标记在基因组上的分布及基因覆盖
图5 120K-4HWA芯片进行GWAS关联分析
04 - 800K超高密度芯片
Agriculture
应用
群体研究
GWAS分析
BSA分析
遗传分析
全新小麦800K超高密度芯片由河南农业大学陈锋团队联合成都天成未来科技有限公司共同开发完成。基于小麦泛基因组使用全球范围内的小麦材料进行分析,选择代表性的多态性位点,主要覆盖基因及调控区域变异信息。该芯片是目前公开报道的密度最高的液相捕获探针产品,可满足小麦群体研究的各类需求。特别适合于在群体遗传结构分析,GWAS关联分析,BSA基因定位方向应用。
图6 基因组选择热点分布
图7 800K芯片GWAS关联分析
05 - 外显子捕获芯片
Agriculture
应用
突变库测序
群体研究
GWAS
BSA分析
根据Wheat 10+ Genomes Project研究发现每个现代品种相对于中国春有3%~4%基因数量差异(Walkowiak et al., 2020),使用中国春参考基因组为模板的探针无法全面覆盖这些信息,特别是一些通过长期驯化获得基因或者是通过一些外源片段的移位系材料(例如1BL/1RS移位系等)。不论是自然群体测序的GWAS分析,还是大规模突变体库测序都会因探针背景差异造成信息的丢失。
为了帮助科研工作在自然群体及突变体库测序中尽可能获得完整的基因变异信息。公司在前期设计的小麦外显子探针基础上,以多个现代小麦品种基因组序列为模板,使用泛基因组迭代算法设计开发了小麦泛基因组外显子探针。在经过内部测试优化后推出WheatPanExome产品。
外显子捕获芯片是小麦突变库群体检测最优选择。目前公开报道的小麦突变体库测序及大量的突变体基因定位工作都采用了外显子捕获技术。例如济麦22突变库(烟台大学)、矮抗58突变库(河南大学/中国农科院)、京411突变库(中国农科院)、科农9204突变库(中国遗传发育研究所/河北农大)等突变库均由天成未来开发的外显子捕获芯片完成测序及数据分析。
图8 京411突变库
图9 KN9204突变库
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