作为生命科学最基础的学科，进化生物学关注生命的起源以及生命形式的多样化和适应性。通过了解生命进化的过程，不仅可以解读人类自身的进化历史，而且可以应对重大挑战，例如：传染病的防控、保护自然资源等。同时，进化生物学一直专注于研发新技术和方法，例如使用AI（人工智能）等新兴手段辅助蛋白质结构和药物预测、利用古DNA技术解析人类起源进化等。
分子生物学和进化学会（Society for Molecular Biology & Evolution, SMBE）是一个成立于1982年的国际组织，其目标是为分子进化学家之间的交流提供便利，并进一步实现推广、研究分子进化学。该学会由分子进化学界先驱Masatoshi Nei与Walter Fitch创建，目前已拥有来自世界各地的2,995名会员。自2001年开启年会以来，SMBE学会已在全世界多个国家举办过年会。2025年是SMBE年会首次在中国举办。
本届SMBE会议邀请了来自于全世界多个国家的进化生物学的专家并设置了26个专题，涵盖了人类的起源和进化、动物/植物/微生物的进化、细胞类型与功能的进化、人工智能在进化生物学的应用等议题。
SMBE2025会议将于2025年7月20-24日在北京会议中心举办。目前，会议已经正式开放投稿（www.smbe2025.org），请各位老师同学留意！
会议关键日期包括
会议摘要投稿截止
2025年01月30日
会议注册开放
2025年01月下旬
早鸟票购买截止日期
2025年4月20日
本次会议大会报告人包括2025年SMBE学会主席，英国皇家学会院士杨子恒教授，及悉尼大学Katherine Belov教授，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所付巧妹研究员，牛津大学Peter Holland教授，美国国立卫生研究院Eugene Koonin研究员，和哥伦比亚大学Molly Przeworski教授。
会议分会主题
1. 农作物的进化：从达尔文的遗产到混合基因组学和气候适应力/Crop evolution: from Darwin’s legacy to genomics of admixture and climate resilience
从达尔文进化论的起源开始，作物就被用作选择性进化的例子。来自人类和环境的强烈选择压力，创造了我们今天所见的作物多样性及其显著的适应性。杂交作为一种额外的变异来源，经常发生在包括驯化作物及其野生近缘种的物种复合体中，为适应性进化和抗胁迫性状提供了重要基因来源。同时，作物也可能逃离人类管理的环境，减弱人类影响并重塑物种基因库。展望未来，作物育种面临着在加速适应气候变化和保持产量、营养和风味等优良作物特性之间寻找平衡的挑战。基因组学和机器学习的突破为研究作物在不断变化气候中的进化和适应提供了前所未有的机会。本次研讨会将汇集进化和种群遗传学、系统生物学、作物建模和分子生物学领域的科学家，讨论作物的历史轨迹，并探索如何利用这些知识指导未来具有气候适应性的作物育种。
2. 性染色体的进化、调控及性别决定/Evolution and regulation of sex chromosomes and sex determination
性染色体在真核生物中十分普遍，并且独立进化。然而，目前仍是未解之谜的是，性染色体为何停止重组，以及为何性染色体在某些谱系（如哺乳动物和鸟类）中高度稳定，而在其他谱系中频繁更替。此外，大多数物种的上游性别决定基因仍然未知。即使在少数已经确定了性别决定基因的物种中，其下游路径如何构建和进化也不明确。随着基因组学的发展，越来越多的非模式物种为这些基本问题提供了洞见。最近的研究鉴定了性别决定区域，并描述了性别决定及性别分化的调控机制。本次研讨会旨在为性染色体进化和性别决定领域的国际研究人员提供一个平台，交流最新发现。我们很高兴确认邀请到Tatiana Giraud教授作为主讲嘉宾，她是研究生态和农业重要真菌种性染色体的先驱，其工作将为与会者提供综合视角。
3. 实验进化：研究进化的实际过程/Experimental Evolution: Studying Evolution in Action
进化问题通常通过比较当前形式并推断祖先状态来解决，而实验进化提供了一个更直接的方式来观察进化正在发生的过程。在实验进化研究中，克隆、种群或群落中的有机体在可控的环境和选择方案中传播数十、数百甚至数千代。这种方法允许在行动中观察进化，并通过操控突变、重组、随机漂变和自然选择等因素，实时监测其对基因组和表型的影响。本次研讨会将汇集利用实验进化研究重要生物学问题的科学家，探讨最新发现、建立新合作，并共同推进我们对动态进化的理解。
4. 基因树：谱系学方法及其在进化遗传学的应用/Gene trees and beyond: genealogical methods and their applications in evolutionary genetics
基因组测序和计算方法的进步正在彻底改变进化遗传学研究方法。谱系学方法成为核心，结合大数据和复杂算法，解锁了从物种层级到单细胞层级的生物学洞见。本次研讨会将聚焦祖先重组图、系统发育方法和单细胞谱系追踪的前沿进展，探讨这些方法在推断分支历史中的挑战与创新，促进理论与应用的跨学科交流。
5. 古基因组视角下的人类历史和社会组织：新方法、新发现/Human history and past social organisation in the light of palaeogenomes: new methods, new findings
考古遗传学结合遗传学与考古学，从独特视角揭示人类社会动态的历史。最近十年的研究通过古基因组数据，探讨了社会流动性、亲缘关系、病原体传播以及家畜交换等问题。本次研讨会邀请探讨古基因组新发现、方法创新及跨学科整合的报告，分析古DNA如何在理论构建和进化生物学中发挥作用。
6. 突变率规则：生殖细胞基因突变的起源及其进化命运/Mutation Rate Rules: on the origin of germline mutations and their evolutionary fate
生殖系新生突变（DNM）是驱动进化变化的遗传变异来源。研究这些突变对于理解塑造基因组的进化力量至关重要。最新技术（如HiFi PacBio长读长测序）使得研究DNM的分辨率达到前所未有的水平。本次研讨会将讨论这一领域的突破性发现，探索DNM在进化变迁中的作用。
7. 新基因的起源、进化和表型贡献/The Origin, Evolution, and Phenotypic Contributions of New Genes
新基因的起源是重要的进化现象，通过基因复制和新起源等机制驱动。高通量组学和基因编辑等技术为研究新基因的起源、功能及进化模式提供了前所未有的机会。本次研讨会旨在更新关于新基因研究的最新进展，强调其在生物学和应用领域的重要性。
8. 基因组的结构进化新见解/Novel Insights on Genome Architecture Evolution
基因组数据的爆发式增长使我们能够探索大规模结构变异如何产生及其对适应和物种形成的影响，例如染色体重排、全基因组加倍等。本次研讨会将聚焦基因组结构进化的动态变化，探讨其对新颖性进化和选择响应的影响。
9.细胞类型的起源和进化/Origin and evolution of cell types
单细胞测序技术的进步为理解细胞类型的起源与进化提供了深刻见解。然而，技术限制、数据规模和跨物种比较分析的难题仍然存在。本次研讨会将探讨最新技术、数据分析方法及其在细胞进化研究中的应用。
10. 泛基因组图在生物多样性基因组学中的应用/Pangenome graphs and their applications in biodiversity genomics
泛基因组图谱通过整合多个基因组序列信息，克服了单一参考基因组的偏差，为种群多样性研究提供了新工具。本次研讨会将重点展示泛基因组学在生物多样性和保护遗传学中的最新应用，探讨构建和操作泛基因组图谱的新技术。
11. 基因流与系统基因组学：机遇与挑战/Phylogenomics in the presence of gene flow: opportunities and challenges
基因流导致基因树不一致性，为系统发育推断带来挑战。多物种联合模型为整合基因流、谱系不完全分选及基因组进化提供了框架。本次研讨会将探讨在此模型下的最新进展、统计与计算挑战，以及揭示物种分化和基因流模式的新发现。
12. 群体遗传学/Population genetics through time
近期推断方法的突破和大量古代全基因组序列的可用性使得我们能够超越对当代遗传变异的研究，揭示塑造基因组的长期进化过程。诸如基于系谱的推断方法等新统计方法，可以重建现代基因组与古代基因组在过去数千年间的关系。这为理解自然选择的长期作用、过去种群迁徙与混血的影响以及分子机制的演化提供了令人兴奋的可能性。本次研讨会将展示尖端的方法学进展，重点介绍利用现代和古代 DNA 数据研究遗传适应的最新发现，包括在人类和其他物种中的应用。
13. 合成生物学与进化论：过去与未来的对话/Synthetic approaches to evolutionary theory: a dialog between the past and the future
进化生物学的重大突破通常源自统一自然观察和生物学发现的理论框架，例如种群遗传学和适应性景观模型。近年来的实验进展使得这些经典理论得以直接测试，既验证了它们的相关性，又挑战了长期以来的假设。例如，深度突变扫描细化了我们对适应性效应分布的理解，而实验进化通过“重放生命的录音带”，揭示了适应机制和进化种群的动态。
合成生物学为这一探索增添了新的维度。它使研究者能够从头合成基因和基因组，以前所未有的规模研究进化过程。进化生物学家面临的常见困惑是，进化关注物种的过去，而我们只能研究其现存形式。实验性祖先重建使我们能够从分子层面“窥探”生命的进化历史，提供分子进化的实证见解。此外，体内高通量实验揭示了广泛的基因型-表型图谱，发现替代的进化路径，并推动新理论的发展。
14. 杂交、基因渐渗与进化/The roles of hybridization and introgression in evolution
过去几十年，基因渐渗及其在进化中的作用受到越来越多的关注。如今我们清楚地知道，基因渐渗通过将大量突变引入基因组，对许多物种的进化轨迹产生了重要影响。大多数这些突变是有害或中性的，但少数有益的突变可能促进适应。尽管如此，估算基因组中渐渗的水平和分布仍然是一个挑战。目前已开发出多种方法，如基于基因树与物种树的系统发育冲突，以及基于更先进的祖先重组图方法。
本次研讨会的目标包括：
1. 评估近期在基因组渐渗和分布估算方面所取得的进展；
2. 探讨基因渐渗片段的插入、维持及其对适应贡献的分子机制；
3. 研究基因流与物种形成的关系。尽管基因流通常被认为是一种防止种群分化的同质化力量，广泛的杂交和渐渗已在数百种动物和植物中被检测到。
15. 转座因子、基因组进化和生物技术发展/Transposable Elements in Genome Evolution and Biotechnology Development
转座元件（TEs）长期以来被认为是“垃圾”DNA。然而，随着短读长和长读长测序技术及现代深度学习算法的进步，转座元件研究正在蓬勃发展。TEs 现被公认为基因组功能演化和生物技术发展的驱动力。
一方面，TEs广泛分布于生命界，在与宿主的进化军备竞赛中，宿主进化出多种机制调控TEs的活性。此外，TEs可被宿主基因调控网络利用，或被驯化为蛋白编码基因的组成部分。这种整合导致新基因组特征的出现，促进宿主的适应性进化，例如应对病原体或环境胁迫。另一方面，TEs的极端多样性为开发基因组工程工具提供了天然宝库。TEs编码的转座酶（如Tn5）和辅助酶（如TnpB）已被用于诱变、转基因、测序文库构建和基因组编辑。
本次跨学科研讨会旨在探讨TEs生物学及其在生物技术中的潜力，涵盖宿主对TEs入侵的响应、TEs的共利用，以及其广泛的应用前景。
16. 专题研讨会：进化发育/Thematic symposium: Evo-devo
17. 专题研讨会：调控基因组学和非编码元件/Thematic symposium: Regulatory genomics, non-coding elements
18. 专题研讨会：前沿单细胞分析方法/Thematic symposium: Frontiers in single-cell level analysis methods
19. 专题研讨会：保护基因组学/Thematic symposium: Conservation genomics
20. 专题研讨会：免疫的进化/Thematic symposium: Evolution of immunity
21. 专题研讨会：病毒、病原的进化/Thematic symposium: Virus evolution and pathogen evolution
22. 专题研讨会：进化理论与前沿方法进展/Thematic symposium: Evolution theory and recent methodological advances
23. 专题研讨会：共生/Thematic symposium: Symbiosis
24. 专题研讨会：新环境的开拓与生物入侵/Thematic symposium: Colonizing new environments and invasiveness
25. 促进分子生物学和进化领域的包容性、多样性、公平性和可及性/Advancing Inclusion, Diversity, Equity, and Accessibility in Molecular Biology and Evolution
26. MBE、GBE杂志副主编研讨会/Associate editor's symposium
