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2011年学校顺利入选教育部第二批“卓越工程师教育培养计划”高校。卓越工程师教育培养计划，是贯彻落实《国家中长期教育改革和发展规划纲要（2010－2020年）》和《国家中长期人才发展规划纲要（2010－2020年）》的重大改革项目，旨在培养造就一大批创新能力强、适应经济社会发展需要的高质量各类型工程技术人才。
同年，学校以市场需求为导向，强调能力培养、注重夯实基础、坚持专业规范与专业特色相结合、加强综合创新实践教学环节，全面修订了2011版本科人才培养方案。被列为国家教育体制改革项目“探索省、部（行业）共建模式，构建产学研结合的人才培养机制”江西省8所试点高校之一。新增无机非金属材料工程、交通工程、表演等3个本科专业，本科专业数达54个，学科专业结构进一步优化。国际合作与交流再上新台阶，2012年与英国伍斯特大学合作举办工商管理、英语、会计学等3个本科专业。
大学生科技创新能力显著提升。2011年，全年公开发表学术论文101篇、授权专利6项；获得“中航工业杯”国际无人飞行器创新大赛无人机竞技大赛一等奖及创意大奖赛创新奖；获得第十二届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛二等奖3个、三等奖3个，总分位列全国54名，首次进入挑战杯发起单位行列。2012年5月，在全国高等院校企业竞争模拟大赛暨MBA培养院校企业竞争模拟大赛总决赛中，经济管理学院纪辉林、王金龙、张凯、肖刚等同学组成的“飞鹰之队”荣获高校组全国一等奖。同年6月，在第三届全国高校环保科技创意设计大赛中，环境与化学工程学院李蕾、薛山、骆安、邓孝荣等同学组成的代表队荣获大赛金奖。同年6月，在第八届“挑战杯”江西省大学生创业计划竞赛决赛中，信息工程学院江攀、饶建锋、陈银海、高虎，经管学院杨浩、魏麟、刘雪卿同学的团队作品《绿盾有限责任公司》创业计划书荣获本科组决赛金奖。
2011年学校获批52项国家基金项目，其中国家自然科学基金项目49项、国家社科基金项目3项。2012年学校获批68项国家基金项目，其中国家自然科学基金项目64项、国家社科基金项目4项。
2011年，学校参与项目荣获国家技术发明二等奖。同年，学校还获批江西省自然科学奖一等奖1项、二等奖1项，科技进步奖一等奖1项、三等奖2项。
2011年6月8日至12日，学校参与研制的国内首架具有完全自主知识产权的碳纤维轻型运动飞机在广东某机场“红嘴鸥”首飞成功。9月21日，“红嘴鸥”飞机代表江西省名优产品、代表学校科技成果，在第七届泛珠三角区域合作与发展论坛暨经贸洽谈会上亮相。11月14日，两架“红嘴鸥”轻型运动飞机在珠海航空产业园正式下线，并参加了珠海航展。
战略合作进一步推进。学校与中国人民解放军海军融合式发展全面铺开，2011年3月和6月，学校分别与海军航空装备论证研究所、南海舰队某师签署仪式，在科研项目、实训基地、人才培养等方面展开合作。2011年，学校还分别与珠海强恩玻璃钢制品有限公司、珠海中翔航空实业有限公司、胜利油田胜利建设监理有限责任公司签署合作协议，对进一步强化国防军工和航空特色，提升专业建设水平，促进产学研合作具有重大意义。2012年5月14日，学校与沈阳飞机工业（集团）公司签订产学研合作框架协议，本着优势互补、资源共享、共同发展的原则，双方决定在科学研究、人才培养等方面开展全方位、多层次的长期合作。
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