为了适应学校的可持续发展，为地方经济和国防现代化作出更大贡献，在广泛调研、充分发扬民主的基础上，学校果断决策，全面启动将南昌航空工业学院更名为南昌航空大学的工作。
2005年8月8日，学校向江西省教育厅提交《关于更名为南昌航空大学的请示》和《关于更名为南昌航空大学的论证报告》。报告详细地阐明学校更名的必要性和可行性。8月30日，省人大教科文卫委副主任、博士生导师周绍森应邀来校作了题为“如何做好更名大学的工作”的专题报告。9月17日至18日，以省人大常委、教科文卫委副主任周绍森为组长，省教育厅副厅长洪三国为副组长的江西省高等院校设置评议委员会专家组莅临学校，进行实地考察。经听取刘高航的汇报，实地查看学校校园、教学科研基础设施、重点实验室、工程训练中心等，审阅相关申报材料等，专家组形成了《关于南昌航空工业学院更名为南昌航空大学的考察报告》，一致认为，南昌航空工业学院已经具备更名为大学的条件。建议省政府向教育部申报将学校更名为南昌航空大学。经考评，11月江西省人民政府同意学院更名为南昌航空大学，并于12月7日向教育部提交《关于恳请将南昌航空工业学院更名为南昌航空大学的函》。随后，中国航空工业第二集团公司与国防科学技术工业委员会分别于12月23日、28日致函教育部，全力支持学校更名为大学。
2006年1月9日，中国人民解放军海军政治部致函教育部，全力支持学校更名为南昌航空大学。2月13日，中国航空工业第一集团公司致函教育部，全力支持学校更名为南昌航空大学。4月11日，中国科学院院士曹春晓、颜鸣皋、陈达和中国工程院院士冯培德、石屏、张文海联名致函教育部部长周济，支持将学校更名为南昌航空大学。11月7日，国防科学技术工业委员会再次致函教育部，大力支持学校更名为大学。
2006年12月14日至15日，学校先后组织全体政工干部、全体中层干部和全体教职工等3次动员大会。会议阐述更名大学工作的必要性和历史意义，详细介绍更名大学工作的进展情况，并对下一步的工作做了部署。会议要求各部门、各单位统一思想和认识，树立主人翁的精神和姿态，热情洋溢地迎接教育部专家组来校考察，向教育部专家组展示学院良好的教风、学风。
2007年3月16日，教育部下发《关于同意南昌航空工业学院更名为南昌航空大学的通知》。同年4月2日，江西省人民政府正式批复，同意学校更名为南昌航空大学。
老领导祝贺学校更名成功（2007）
2007年4月28日上午9时30分，南昌航空大学揭牌庆典大会在前湖校区田径运动场隆重举行。副省长孙刚代表江西省人民政府向大会表示热烈祝贺，向为学校发展付出辛勤劳动的全校师生员工致以亲切的问候。他在讲话中充分肯定了学校55年的办学成绩。希望学校以更名大学为新的起点，在加强学校各项基本建设的基础上，培育大师，涵养大气，雕琢大器，为中华民族、为祖国的未来培养更多优秀人才，使南昌航空大学享誉中国大学之林。海军政治部副主任刘纪林少将代表海军全体官兵向大会表示最热烈的祝贺。省委教育工委书记、省教育厅厅长漆权宣读了教育部《关于同意南昌航空工业学院更名为南昌航空大学的通知》和江西省人民政府《关于同意南昌航空工业学院更名为南昌航空大学的批复》。江西省人民政府副省长孙刚和国防科工委人事教育司司长屠森林共同为“南昌航空大学”揭牌。校长余欢在讲话中豪情满怀地提出建设成为一所特色突出、优势明显、充满活力、和谐发展的多科性教学研究型航空大学的奋斗目标。出席大会的还有省人大常委会副主任万学文，江西省政协原副主席黄懋衡，中科院院士曹春晓、颜鸣皋、陈达，中国工程院院士张文海、石屏，中国航空第二集团高级顾问关敦，省委组织部副部长刘三秋，中航工业第一、第二集团公司，航空企事业单位和兄弟院校的代表等。当天晚上的庆典晚会上，著名男高音歌唱家、国家一级演员吕继宏带领海政歌舞团的青年演员们和南昌航空大学的师生同台演出，为庆典活动增添了新的喜庆。南昌航空工业学院更名为南昌航空大学，是我国航空工业和国防事业迅速发展的需要，标志着南昌航空大学的建设和发展进入了一个新阶段。
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