免费资源:
一、国自然类:
5 标书写作模板
2 2018-24年国自然清单
4 基金插图素材(可编辑)
5 泛癌分析万能代码
7 130套SCI实验视频
9 单细胞数据挖掘课
11 统计分析万能模板
2 100个SCI实验Protocol
10 SCI写作万能模板
9 资源共享群
10 相亲交友微信群
2023年3月21日,浙江大学医学院第一附属医院干细胞与再生医学中心及骨髓移植中心的Zebin Yu(第一作者) & Pengxu Qian(通讯作者 音译 钱鹏旭) & 浙江大学医学院第一附属医院血液科的Jianhu Li(第一作者) & 浙江大学医学中心良渚实验室的He Huang(通讯作者 音译 黄河) 在Journal of Hematology & Oncology(中科院一区 IF=29.5)期刊上发表了一篇论文,题为“AMLnet, A deep-learning pipeline for the differential diagnosis of acute myeloid leukemia from bone marrow smears”(AMLnet,从骨髓涂片对急性髓性白血病进行鉴别诊断的深度学习管道)
撤稿原因
之前我们给大家分享了R语言绘制50种SCI插图的视频教程(点击免费下载)。
也将输入文件和代码分享出来了(点击下载)。还给大家分享了单基因GSEA富集分析的代码(点击下载)。
今天我们要给大家分享一款:
“miRNA-mRNA互作一键批量预测工具”
输入miRNA或者mRNA,一键、批量通过9大数据库(“ENCORI","miRDB","miRWalk","RNA22","RNAInter","TargetMiner","TargetScan","NPInter","miRTarBase")预测miRNA的mRNA和预测mRNA的miRNA。同时,筛选出交集靶基因。
比你只用一个数据库准确性高太多了。这个工具我们内部是用来发生信类的文章的(人种属),原价4599元。现在只要200元。
如果你也有了这个工具,那就轻松发纯生信类SCI(随便整一个疾病的miRNA数据集,用这9个数据库构建一下miRNA-mRNA网络,肯定就是一篇低分SCI。因为这9个数据库源文件+代码,是全网首发)。同时,我们做实验预测的时候也能够去除假阳性,轻松做实验。如下下载该工具:
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下面我给大家介绍一下如何使用。
首先,下载这份miRNA-mRNA互作一键预测工具后是这样的,有三份文件,分别是:R语言万能代码、输入文件和9大数据库文件(数据库源文件+万能代码,这一次我们是全部分享出来了哦):
9大数据库文件是我们内部发生信类文章的,于是2022年3月中下旬从这9个数据库官网整理好的(非常新):
具体每一个数据库格式如下:第一列是miRNA,第二列是mRNA:
接着,我以hsa-let-7a-2-3p和PDLIM5来一键批量预测给大家进行示范。
第一步:环境布置:
我们要把9大数据库文件、输入文件和函数代码放在一个非中文名的文件夹下:
第二步:整理输入文件:
输入文件格式如下:只有一列,这一列你可以放mRNA,也可以放miRNA。反正都是会去预测miRNA对应的mRNA,mRNA对应的miRNA。而且随便你放多少个,这里是批量进行预测的。
第三步:运行万能代码:
用Rstudio打开代码(自己百度下载R和Rstudio软件,都是免费的,下载默认安装就行了):
这里运行代码的时候要注意,这一句代码一定要记得修改哦:
source("C:/Users/A/Desktop/2/data/.venn_P.R")#改成自己的目录
我这里data是在桌面的2文件夹下:
所以我的代码就是source("C:/Users/A/Desktop/2/data/.venn_P.R")。你自己放在哪个文件夹下,就按照这样的方式修改就行。
第四步:结果解读:
运行完之后,每一个miRNA/mRNA预测的靶标都会有一个文件夹:
文件夹内是其对应的靶标,如我打开hsa-let-7a-2-3p文件夹:
里面每一个数据库所预测的结果都是一个txt文档。这里也就是说hsa-let-7a-2-3p可以在miRDB、miRTarBase、miRWalk、NPInter、RNA22、RNAInter、TargetMiner这7个数据库中均有靶标,随便打开两个给大家看看:
同时重要的是,他们的靶标交集基因如下:
并且也有可视化的结果:7个数据库都能预测的交集靶基因有5个,分别是上面文件夹内的:ABI2、IGF1R、TP53INP1、FNDC3A、ARID1A。
然后我们用AI修图一下,就可以投稿啦:
嗯,这个工具就这么用,非常方便,比如我有几十个、几百个、几千个miRNA/mRNA,要预测他们对应的mRNA/miRNA。那只要替换我输入文件里面的名字:
然后点击代码运行:
随后就可以等待出结果啦:
轻松又简单。如下2022年这篇文章,miRNA-mRNA互作套路不管是做湿实验,还是生信预测。都是非常实用:
不说了。赶紧整起来,发纯生信SCI吧。
“miRNA-mRNA互作一键预测工具”
领取方式:
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顶级CNS插图如下:
但是自己画一只小鼠可能需要花一整天的时间。
所以,今天小编给大家免费赠送:
“生物医学之家CNS插图可编辑素材永久VIP账户”
生物医学之家CNS插图素材部分截图如下:
这些素材都是用Adobe illustrator绘制的,打开后可以继续编辑修改,这些素材原价是9999元的,现在免费给大家送永久账户。如下免费获取永久VIP账户:
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一、比如我需要用到小鼠插图来描述自己的小鼠动物实验模型,那就直接搜索鼠,有几百张小鼠插图就出现了:
有了VIP账号之后就可以随意下载。下载下来是AI绘制的可编辑图:
可以随意修改颜色:
也可以随意修改大小:
Ctrl+c和V复制粘贴到自己的画板中,并对齐:
随后画一条线,示意要D369打药:
随后添加字体,这样审稿人一看就知道你做了什么动物模型。
最后保存和导出,一定要记得保存,保存就是矢量图了,以后还能修改。导出就是导出为图片,用来讲PPT或者投稿。
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还有,我们下载的素材,也可以右键取消分组:
然后修改任何一个你想要修改的元素,比如修改液体的颜色:
也可以将注射器放在背上,模拟皮下注射:
还可以将小鼠变为黑色:
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二、比如我需要绘制细胞机制图。那就搜索细胞:
有了这些素材,分分钟就可以绘制如下这种高分插图:
三、各种Nature插图原图:
下载下来之后每个细微的元素都可以修改:
我们一共上传1万张Nature插图。大家赶紧获取永久VIP账户吧,投稿绘图的时候用得着:
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