本地化孟德尔随机化分析代码和原始数据，一键分析，发SCI必备

那最近大家都在申请国自然，但是很多没有基础怎么办？孟德尔随机化分析来帮你选分子和选疾病。首先，大家看看下面这篇中华牌论文套路，了解一些基础：

就非常简单，用两表和一图说明了肺组织中基因表达水平与肺疾病的因果关系：

我们完全可以模仿分析，那分析完后也可以模仿这个论文写作，那发一篇SCI就简直太快了，或者用来申请国自然也是非常有意义的。

为了实现上面论文分析并达到发10分SCI的要求，我们给大家分享一个能发Nature的数据和代码。这是我们内部培训用的，原价10万元的资料，里面有49个组织的所有人类基因表达量eqtl数据和疾病结局数据。很多学员分析一个组织中哪些基因变化会导致该组织该疾病的发生（如肺组织中哪些lncRNA增加会导致肺癌的发生），就发了10多分的SCI，那你把所有组织中的基因和所有疾病都做了，那就是一篇Nature了。

该资源用的是：本地化孟德尔随机化分析任意组织中任意基因的eqtl数据与任意疾病的关系，从而明确任意基因表达量对任意疾病的影响。不用担心网络，也不用做基因过表达和敲降等湿实验。如果你有一个铁死亡或者铜死亡基因集，然后这样通过孟德尔随机化分析，得到铁死亡或者铜死亡基因集对各种疾病的影响，就是一篇SCI。如下：

这个【能发Nature的数据和代码】已经分享到年VIP资源群中，大家想发Nature的直接加入我们我们年VIP资源共享群（我们分享的资源都是非常有用，原价都是几百上千上万的。那一天一份资源，算50元一份，一年买起来就是365天×50元=18250元。你现在加入才3块钱一天）。

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如下，资料里面一共26个文件夹：

有个这个数据和代码，你可以得到任何组织中任何基因对任何疾病的影响：

那怎么用呢？1_Tissure_gene_eqtl文件是所有组织所有基因的eqtl文件，该文件里面一共是49个组织文件，每一个组织文件都是一个组织中所有基因的eqtl数据（你线下买这个数据就要好几万了）。所以，你想做哪个组织就用哪个文件即可：

2_Finn_R10文件是所有疾病数据：

你想分析哪个疾病，就下载哪个疾病的数据即可，一共是2408个疾病文件，下载后不用任何修改，代码直接跑通。

还有工具文件：

知道这三类之后。下面比如我想知道血液中CDK11A这个疾病高表达后会不会导致冠状动脉粥样硬化。下面看我操作。

先从1_Tissure_gene_eqtl文件夹中找到血液组织并复制到跑代码的文件夹中：

同时，从2_Finn_R10文件夹中找到冠状动脉粥样硬化，并将网址粘贴到浏览器即可自动下载数据：

下载后放在跑代码的文件夹:

然后用Rstudio打开代码：

然后只要修改6处代码即可，输入你想要了解的基因名（如上图第7行代码，我这里输入的是CDK11A），随后只要修改运行路径和文件名，其他一个字都不用改。整个孟德尔分析和后面的验证就都做完了：

然后一键就出来了孟德尔随机化分析结果和敏感性、异质性、多效性等验证结果，一共9个结果：

结果解读也很方便，从表中我们可以看到b小于0，也就是说血液中CDK11A高表达与冠状动脉粥样硬化是负相关的。然而P是没有意义的，所以这是阴性结果（小编只是随意拿一个基因而已，你自己做分析，应该是要做转录组学差异分析，或者单细胞分析中差异表达的基因，或者是根据临床经验要进行探索的基因）。做出10个左右的阳性结果，基本SCI就稳了。

分析完了，写作的时候就模仿下面这篇论文写就行了，直接套用这个模板（比如作者用的是肺腺癌全基因组关联分析数据，那我们的代码疾病数据是芬兰R9，作者用的eQTL联盟数据，我们用的是gTEX数据库的eqtl数据，分析也是一模一样。后面的三大验证结果也是出来的，这一套代码分分钟搞定了）。

然后再给大家介绍一下，1_Tissure_gene_eqtl文件整理的方式，方便大家写论文。该数据来源于https://gtexportal.org/home/：

于是下载：

选择人群：

下载后是压缩包：

解压后有98个文件：

整合后就是49个组织中基因的eqtl数据：

好了。这个【能发Nature的数据和代码】已经分享到年VIP资源群中，大家想发Nature的直接加入我们我们年VIP资源共享群（我们分享的资源都是非常有用，原价都是几百上千上万的。那一天一份资源，算50元一份，一年买起来就是365天×50元=18250元。你现在加入才3块钱一天）。

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一共26个文件哦，傻瓜式操作：

新手刚开始写项目的时候，如果能看到别人也在研究这个分子，研究的怎么样了，‍参考他们的数据‍，那就太好了。那，如何一键下载结题报告的pdf全文？如下：

‍

首先，我们给大家免费发放了500多份国自然标书（点击免费下载全文）：

下面进入正文：

从生物医学之家（www.swyxzj.com）进入国自然官网，并检索自己的关键词：

点击进入后拖到下方，显示无法下载：

那我们就在浏览器安装油猴插件+NSFC_conclusion_downloader插件。就可以下载了：

接着操作：打开Edge浏览器，进入插件下载页面：

安装好后，点击获取脚本：

进入页面后，到这里取下载安装：

搜索NSFC_conclusion_downloader安装它:

安装好后，再回到下载页面，刷新一下，就能下载啦：

2023年国家自然科学基金资助项目总计【47160项】。其中面上项目20321项、重点项目751项、重点国际（地区）合作研究项目74项、青年科学基金项目22879项、优秀青年科学基金项目630项、国家杰出青年科学基金项目415项、创新研究群体项目43项、地区科学基金项目3538项和外国学者研究基金项目109项。 

因此，科研部今天给大家免费发送：

“2023国自然标书（原价9877元）”

2023年的标书，为申报2024当作模板刚刚好（原价9877的国自然内部培训资料，现在免费发送给大家），涉及八个学部。我们生科和医学都是研究如DNA、RNA（mRNA、miRNA，circRNA、tRNA）、蛋白质、分子结合（RNA结合蛋白、IP）、分子修饰（磷酸化、乙酰化、）、神经外科、神经内科、免疫应激、心血管、儿科、胃肠道、骨科等。这些标书就可以当作模板。每份标书都是完整的，非常具有参考意义，如下：

（为保护隐私，已打码，下载的标书是没有打码的哦）

特别是一些别人则会那个在研究的东西，靠这边走就行。还有就是对于新手来书，实验经费那一块怎么写？每个实验花费多少？这些直接复制粘贴就行。

“2023国自然标书（原价9877元）”

标书截图如下：

一、医学科学部（部分截图）：

二、生命科学部（部分截图）：

三、地球科学部（部分截图）：

四、工程与材料部（部分截图）：

五、管理科学部（部分截图）:

六、化学科学部（部分截图）:

七、数理科学部（部分截图）：

八、信息科学部（部分截图）:

这些标书我已经上传百度云了，需要的赶快保存起来：

【2023国自然标书（原价9877元）】

顶级CNS插图如下：

但是自己画一只小鼠可能需要花一整天的时间。

所以，今天小编给大家免费赠送：

“生物医学之家CNS插图可编辑素材永久VIP账户”

生物医学之家CNS插图素材部分截图如下：

这些素材都是用Adobe illustrator绘制的，打开后可以继续编辑修改，这些素材原价是9999元的，现在免费给大家送永久账户。如下免费获取永久VIP账户：

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免费发送1万个永久VIP账户，有了这个账号之后，你可以无限、永久下载生物医学之家的CNS插图素材。共有1万张素材，囊括了各种生物、人体组织、细胞、病毒、植物等。素材首页如下：

一、比如我需要用到小鼠插图来描述自己的小鼠动物实验模型，那就直接搜索鼠，有几百张小鼠插图就出现了：

有了VIP账号之后就可以随意下载。下载下来是AI绘制的可编辑图：

可以随意修改颜色：

也可以随意修改大小：

Ctrl+c和V复制粘贴到自己的画板中，并对齐：

随后画一条线，示意要D369打药：

随后添加字体，这样审稿人一看就知道你做了什么动物模型。

最后保存和导出，一定要记得保存，保存就是矢量图了，以后还能修改。导出就是导出为图片，用来讲PPT或者投稿。

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还有，我们下载的素材，也可以右键取消分组：

然后修改任何一个你想要修改的元素，比如修改液体的颜色：

也可以将注射器放在背上，模拟皮下注射：

还可以将小鼠变为黑色：

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二、比如我需要绘制细胞机制图。那就搜索细胞：

有了这些素材，分分钟就可以绘制如下这种高分插图：

三、各种Nature插图原图：

下载下来之后每个细微的元素都可以修改：

我们一共上传1万张Nature插图。大家赶紧获取永久VIP账户吧，投稿绘图的时候用得着：

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