一、研究背景：RNA修饰与肿瘤研究的前沿
二、ac4C在RNA中的分布：从tRNA到mRNA
图1 ac4C在RNA上的分布
三、ac4C的分子机制：NAT10的作用
图2 NAT10在mRNAs上调节ac4C的机制和功能
四、NAT10在癌症中作用：从肿瘤发生到免疫逃逸
图3 NAT10在癌症中起着关键作用
图4 癌症中ac4C相关信号通路综述
五、ac4C研究的局限性与挑战：探索与解决
图5 癌症中ac4C当前研究的局限性和挑战
六、总结
文章来源于：同济大学医学院泌尿肿瘤研究所
关于易基因ac4C乙酰化RNA免疫沉淀测序
（acRIP-seq）
ac4C RNA乙酰化（N4-acetyicytidine，ac4C），N4位乙酰胞嘧啶，是真核原核生物中保守的化学修饰，早期研究认为ac4C主要存在于tRNA和18S rRNA上。近期研究显示，mRNA上也存在大量的ac4C，该修饰在促进蛋白翻译、影响RNA稳定性和可变剪接、调控基因表达发挥重要作用，是继m6A修饰之后表观转录组学的新兴发展方向。
ac4C RNA修饰的检测，易基因采用基于抗体富集的ac4C RNA乙酰化免疫共沉淀 (acetylated RNA Immunoprecipitation，acRIP)技术：基于抗体特异性结合乙酰化修饰碱基原理，以RNA免疫共沉淀富集乙酰化修饰片段为基础，然后通过高通量测序（acRIP-seq），在转录组范围内研究发生乙酰化的RNA区域，高效获得结果。
易基因提供适用于不同科研需求的acRIP -seq技术：
ac4C 乙酰化-常量mRNA acRIP -seq
ac4C 乙酰化-常量mRNA +lncRNA acRIP -seq
ac4C 乙酰化-微量mRNA +lncRNA acRIP -seq
实验原理：
首先通过poly(A)捕获RNA，将获得的RNA打成100nt左右的小片段；之后使用ac4C特异性抗体进行免疫共沉淀，含有ac4C修饰的RNA片段被富集并回收；进而对回收的RNA进行文库构建、高通量测序和生物信息学分析，通过peak分析鉴定出ac4C修饰的位点。
易基因提供全面的表观基因组学（DNA甲基化、DNA羟甲基化、cfDNA）和表观转录组学（m6A、m5C、m1A、m7G、ac4C、RNA与蛋白互作）、DNA与蛋白互作及染色质开放性技术方案（ChIP-seq、ATAC-seq），详询易基因：0755-28317900。
参考文献：
Gu Z, Zou L, Pan X, Yu Y, Liu Y, Zhang Z, Liu J, Mao S, Zhang J, Guo C, Li W, Geng J, Zhang W, Yao X, Shen B. The role and mechanism of NAT10-mediated ac4C modification in tumor development and progression. MedComm (2020). 2024 Dec;5(12):e70026. pii: MCO270026. doi: 10.1002/mco2.70026. PubMed PMID: 39640362.
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关于易基因
深圳市易基因科技有限公司(简称易基因，E-GENE Tech Co.,Ltd.)是一家专注表观遗传学科学研究与临床应用转化的国家高新技术企业。公司以“引领表观遗传学科学研究与临床应用”为愿景，提供以表观基因组学、表观转录组学、染色质结构构象等表观遗传学为核心的多组学科研服务及解决方案，全面覆盖生命科学基础研究、医学、临床应用研究。
公司拥有一支顶尖的表观遗传学研究团队，在DNA甲基化，羟甲基化修饰；RNA m6A，m5C, m7G，m1A和ac4C等修饰，DNA和蛋白质互作及染色质开放性等表观遗传领域不断创新，完成上百个物种的表观遗传测序检测，创建了cfDNA甲基化/羟甲基化多组学多技术检测方案，建立了微量/单细胞DNA和RNA修饰检测技术，服务高校科研单位、三甲医院及企事业单位近千家，在The Lancet、Nature、Cell、Science、Nature Communications等国际著名期刊发表过上百篇论文，累计影响因子数千分，申请发明专利、软件著作权数十项。
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