该研究主要探索了IGF2BP3如何通过识别mRNA的内部m7G修饰来促进mRNA的降解,从而实现对特定通路的调控,为进一步深入研究m7G的生物学意义提供了基础,并拓宽了对与mRNA修饰多样性的认知。
关于易基因RNA m7G甲基化测序
(MeRIP-seq)技术
N7-甲基鸟苷(N7-methylguanosine,m7G)是真核生物tRNA、rRNA和mRNA 5'cap中最丰富的修饰之一。作为一种重要的表观遗传修饰,m7G RNA甲基化在基因表达、加工代谢、蛋白质合成、转录稳定等方面发挥着重要的作用,参与疾病发生发展等多种生命过程。
对于m7G RNA甲基化修饰的检测,易基因采用基于抗体富集的m7G-MeRIP-seq,利用m7G特异性抗体富集发生m7G甲基化修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,对RNA上的m7G修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。
易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术:
m7G甲基化-常量mRNA 甲基化测序(MeRIP-seq)
m7G甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化测序(lnc-MeRIP-seq)
m7G甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化测序(Micro-lnc-MeRIP-seq)
高通量m7G甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2)
技术优势:
起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 高通量测序:全转录组m7G位点高通量测序,可同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m7G检测; 重复性高:m7G-MeRIP-seq的IP富集重复性高,最大化降低抗体富集偏差; 应用范围广:广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症的发生与发展、药物应答等研究领域。
易基因提供全面的表观基因组学(DNA甲基化、DNA羟甲基化)和表观转录组学(m6A、m5C、m1A、m7G)、染色质结构与功能组学技术方案(ChIP-seq、ATAC-seq),详询易基因:0755-28317900。
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关于易基因
深圳市易基因科技有限公司(简称易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引领表观遗传学科学研究与临床应用”为愿景,依托高通量测序技术和云数据分析平台。为医疗机构、科研机构、企事业单位等提供以表观遗传学技术为核心的多组学科研服务及解决方案,全面覆盖针对生命科学基础研究、医学及临床应用研究等内容。
易基因专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务。技术团队在国际上首创LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羟甲基化技术流程,研发建立简化基因组甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,单细胞/微量DNA全基因组甲基化及简化高通量甲基化测序技术,RNA甲基化测序等技术和方法,并建立易基因科技全自动化弹性资源生信分析系统。在Nature、Cell、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊发表论文100余篇,申请发明专利14项、软件著作权29项。