Hola~巴塞罗那 | Mini-symposium on Genomic Regulation会议回顾

学术   科学   2024-11-04 22:00   广东  
10月22日,西班牙基因组调控中心(Centre for Genomic Regulation,简称CRG)代表团应深圳湾实验室系统与物理生物学研究所的邀请,到访深圳湾实验室进行学术访问。


CRG位于西班牙巴塞罗那,是欧洲顶级的生命科学研究机构之一,专注于基因组调控研究,致力于揭示生物体基因组的运作机制,以及这些机制如何影响生物体的发育、功能和疾病的发生。CRG的研究领域广泛,涵盖了遗传学、发育生物学、细胞生物学、生物信息学和计算生物学等多个方面,并在这些领域取得了多项重要研究成果。


会议伊始,深圳湾实验室副主任张欣豪全面介绍了深圳湾实验室和深圳医学科学院的发展概况。随后,CRG代表团成员Natalia Dave博士详细介绍了CRG的研究领域和战略合作情况。


张欣豪与Natalia Dave博士在会议现场作介绍


CRG代表团成员Bernardo Rodriguez博士介绍了长读长测序技术在基因组遗传变异和DNA重复序列研究中的应用。他指出,第二代测序技术在解析结构变异、重复序列以及由重复序列所引发的结构变异方面存在困难。随后,Bernardo Rodriguez博士详细阐述了实验室如何利用第三代长读长测序技术来解析这些结构变异和重复序列,以及其中所涉及的计算生物学问题。


Bernardo Rodriguez博士


深圳湾实验室PI李磊博士介绍了基因组非编码序列变异与疾病治疗间的关联。具有调控功能的罕见非编码变异与人类复杂表征和疾病存在联系,这类非编码变异能够通过改变多聚腺苷酸(poly(A))信号和剪切位点来影响mRNA可变腺苷酸化,进而发挥转录后调控功能。因此这类非编码变异有可能作为疾病治疗靶标。


李磊博士


CRG 代表团成员Mara Dierssen博士介绍了空间分辨率基因表达谱对唐氏综合症研究的重要性。Mara Dierssen博士实验室利用光遗传学、化学遗传学、组学测序等尖端技术,在空间和时间分辨率上揭示了印迹细胞(engrams)在唐氏综合症中的异常状态。


Mara Dierssen博士


深圳湾实验室PI尹延东博士介绍了高内涵成像中的分子定位显微技术。超分辨图像定量解析技术滞后阻碍超分辨成像技术的广泛应用。尹延东博士发展了随机共定位模拟、三阶相关函数及其理论延申、快速高阶相关函数计算等统计分析技术,实现高通量超分辨图像的定量解析。


尹延东博士


CRG 代表团成员Manuel Irimia博士介绍了两侧对称动物组织特异性转录组的进化。基因表达调控是表型多样性的主要机制。Manuel Irimia博士对多个物种多种组织转录组数据研究发现,接近一半的古老基因 (ancestral genes) 的表达具有组织特异性。组织特异性的进化模式与基因复制有关,揭示全基因组复制对脊椎动物进化的长期影响。


Manuel Irimia博士


深圳湾实验室PI黄恺博士介绍了利用物理学和机器学习方法对染色质多体互作的研究。黄恺博士提出染色质折叠“森林”模型,利用分子模拟方法证实了染色质能够发生相分离并形成染色质多体互作结构。利用图卷积神经网络方法,从多组学数据中学习染色质多体互作模式,并利用生物实验验证了方法的准确性。


黄恺博士


此次学术交流活动让双方科研人员有机会深入了解彼此的研究领域和成果。通过深入的探讨和分享,双方成员都表示收获颇丰。最后,CRG代表团与深圳湾实验室的成员们进行了合影留念,共同见证了这一难忘的时刻。



撰稿 | 周兴华

编辑 白 白
责编 远 山

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