国自然明星通路cGAS-STING通路,再发10+分一区SCI!中南大学团队的选题思路,绝了!

学术   2024-10-04 18:38   江苏  
信号通路,简言之就是细胞内的一系列分子进行信息传递的过程。其本质上是前人研究的比较透彻的一些分子,包括它的调控方式的一个总结。
在很多高分论文中,信号通路都担任着极其重要的位置。中南大学湘雅医院等知名医院学者发表高分期刊都少不了抱抱信号通路的大腿。




7月27日,湘雅三医院周文虎教授团队就在《Journal of Nanobiotechnology》期刊(生物学Top,IF=10.6)发表了一篇学术论文。


文章标题:Repolarizing neutrophils via MnO2 nanoparticle-activated STING pathway enhances Salmonella-mediated tumor immunotherapy(通过MnO2纳米颗粒激活STING通路重新极化中性粒细胞可增强沙门氏菌介导的肿瘤免疫疗法。)



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都说,医学人最难的路是信号通路。但信号通路又是我们不可避免要学习的一个重点内容。

研究信号通路可以帮助我们:

了解细胞的生理或病理过程

比如细胞增殖,分化,自噬,坏死,凋亡等等,而这些生物过程的了解对于人类的健康非常重要。

寻找潜在治疗的靶点

大部分疾病都是由于信号通路的异常激活或抑制而引起的,研究信号通路可以发现新的治疗目标,并以此作为药物开发的策略。

为实现精准化治疗提供依据

每个人的信号通路可能都存在差异,这些差异可以解释为何同一种药物在不同个体中的效果不一致,学习信号通路,有利于理解个人的独特性。

为了帮大家更好的在课题中应用信号通路,这次小刀就对信号通路的基础概念做了一次全面梳理,定义/本质、关键成员、普遍规律、相关科学问题等等。
同时,筛选和检测信号通路的一些方法技巧,如WB蛋白检测、IF免疫荧光检测、生物芯片技术等等,我们也会分享给大家~
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信号通路在课题中扮演什么角色?

信号通路在课题中应该是万年配角,很少作为主角出现,通常是做因变量。

但是,信号通路中的某个关键分子,是可以作为课题的主变量来出现的。我们现在提及的,都是把一群分子当做一个整体的这种信号通路。

在【AI辅助信号通路研究】伴学营中,老师总结好了信号传导过程中的的5条普遍规律:

信号通路作为因变量,可以有间接机制,也可以有直接机制。

简单来说,间接机制就是知其然不知其所以然。比如说,在某疾病模型中,或者细胞在某种刺激下,检测到了某信号通路发生了异常活化。但是并不知道为什么活化了。这就是最简单的间接机制。

对于信号通路的下游,常见的间接机制表现为某通路激活后,某基因的表达量改变导致细胞的表型变化。这些基因有可能是其他人研究过的,该通路的常见下游靶基因。但是,文章并未论述为什么通路活化后靶基因表达量增多,其实这得做转录因子和靶基因启动子区域的结合才能看出来。

一般,信号通路的上游和下游分别对应两类直接机制。

上游的直接机制就是指,这条通路的激活是由某分子介导的激活,可能是因为某个转录因子促进了通路中关键分子的mRNA的转录。或者,是某个比较上游的激酶异常激活导致的。

下游的直接机制则体现在,某通路活化后,该通路下游的效应分子也就是转录因子,通过结合某基因的启动子调控靶基因的转录,最终导致细胞某表型的变化。

如果现在你不清楚:
  • 做某通路时,需要检测哪些分子?
  • 通路与表型之间有何联系,已知表型如何聚焦到通路
  • 如何利用数据库来筛选通路
  • 如何证明某通路参与了调控作用
这些问题你统统都可以问问AI工具——LibreChat。秒解答!
老师也在【AI辅助信号通路】伴学营中给到了提示词指令的参考话术,感兴趣的同学,上滑扫码即可入营学习~


信号通路的检测方法有哪些?

在伴学营中,老师详细介绍了两种信号通路的检测方法——Western Blot检测和IF免疫荧光检测。

01

Western Blot是什么?

Western Blot,即蛋白印迹,是将电泳分离后的细胞或组织中的蛋白质从凝胶转移到固相支持物NC膜或PVDF膜上,然后用特异的抗体来检测某特定蛋白的一种蛋白质检测技术,现已广泛应用于基因在蛋白水平的表达研究。

Western Blot法采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,根据其英文首字母缩写,又叫PAGE胶。

简化的实验流程就是,先将细胞和组织中的蛋白提取出来,使用裂解液低温裂解半小时后,离心取上清即可。然后将蛋白样品进行PAGE胶电泳。再将凝胶上的蛋白样品转移至膜上,然后对膜进行封闭和抗体杂交。最后通过抗体上偶联的荧光蛋白或辣根过氧化物酶,进行显影。

Western Blot主要检测信号通路的磷酸化蛋白,那它的难点和注意事项分别是什么?

在检测磷酸化蛋白时,总体的Western Blot实验步骤是一样的,但的确存在一些难点,所以很多新手朋友并不能得到理想的结果。具体来说,老师在伴学营中总结成了3点。👇

为了避免误差带来实验结果的假阴性,针对上述的难点,老师还在伴学营中给大家提供了以下几条注意事项。

*如果想了解更多检测过程中的注意事项,或者不清楚对WB蛋白检测实验有任何不清楚的地方,你都可以问问AI工具--LibreChat,它会为你秒解答!


02

IF免疫荧光检测是什么?

IF,即细胞免疫荧光,利用抗原与抗体特异性结合的原理,使用偶联了荧光蛋白的抗体去标记组织细胞内的某蛋白质,也可以是磷酸化蛋白,然后通过荧光显微镜观察荧光信号,通常还需要用另一种颜色的荧光蛋白偶联抗体来标记相应细胞器,共同来确定某蛋白的亚细胞定位和相对表达量。

一般步骤是:

制备组织切片或细胞爬片,进行抗原修复和抗体杂交☞然后复染细胞核,封片,观测荧光蛋白和拍照☞最后进行图像分析,包括共定位和荧光信号相对强弱等。(图像的分析推荐使用IPP,也就是ImagePro Plus。)


在信号通路中,某些蛋白会发生从细胞膜到细胞质的迁移,或者从细胞质向细胞核的迁移,通常来说,关键蛋白的移位会根据其功能来决定通路的状态。一般,这种亚细胞定位的变化,可以通过细胞免疫荧光(IF)的方法来检测。

文章篇幅有限,以上仅极少部分内容介绍~
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