太顶了!Wnt、Notch、NF-κB、MAPK等明星通路的普遍规律、筛选策略全都知道!(快收藏)

学术   2024-10-17 19:46   上海  

近期,来自复旦大学上海肿瘤内科的研究团队在 Signal Transduction and Targeted Therapy期刊(Nature子刊,IF=40.8分)在线发表研究论文《NF-κB in biology and targeted therapy: new insights and translational implications》。

本研究对NF-κB信号通路的组成、激活和调控机制,以及与其他重要通路的相互作用进行了分析。

作者在文章中阐明了NF-κB信号通路在炎症、免疫调节和肿瘤微环境,以及多种人类疾病,包括癌症、炎症和自身免疫性疾病、心血管疾病、代谢性疾病、神经系统疾病和COVID-19中的参与;并讨论了靶向NF-κB信号通路的治疗方法,为NF-κB信号传导领域的研究提供了展望。



信号通路千千万,找到一条是关键,通路关系太复杂,讲不清楚就完蛋。

作为刚入行的医学生,你是不是总是对弯弯绕绕的信号通路图束手无策,更别提在课题中设计信号通路相关的实验方案了。
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说真的,如果你能搞清楚以下3点问题,信号通路相关的课题设计,你从此就能得心应手!

常见的信号通路有哪些?我的课题里可以用哪些信号通路?

通路和表型之间的联系,当研究的表型确定后,如何聚焦到通路?也就是说哪一条通路与我的研究有关?

当通路确认后,需要检测哪些指标?如何做实验设计才能证明该通路参与了D表型的调控?

别急~

今天,小编就带来了这3个问题的答案~





1.常见的信号通路有哪些?我的课题里可以用哪些信号通路?

在细胞信号传导中,有几条被广泛研究和认可的重要信号通路,通常被称为“明星通路”

常见的明星通路有:PI3K/Akt通路、MAPK通路(特别是ERK通路)、Wnt/β-catenin通路、TGF-β/SMAD通路、NF-κB通路、Notch通路、Hedgehog通路……

这些信号通路在细胞生物学、发育、生理、病理过程(例如癌症、炎症和代谢疾病)中起着重要作用,是生物医学领域研究的重点。理解这些通路对于开发靶向药物和治疗策略至关重要。




2.通路和表型之间的联系,当研究的表型确定后,如何聚焦到通路?也就是说哪一条通路与我的研究有关?

在解决这一问题前,我们首先要明确一些基础概念:信号通路、信号转导、分子、表型、配体和受体、蛋白激酶、转录因子。以此,大家才能更好地去理解科研中抽象复杂的内容。

对此,我们准备了一节【AI辅助信号通路研究】伴学营课程,里面理清了关于信号通路相关的各类基础概念、普遍规律。0基础的同学可以来看看哦~

掌握了这些基础概念,我们就可以想想如何进行信号通路相关课题设计了。

具体表现为:

  1. 提炼出该条通路有代表性的待测分子。也就是说,检测哪些分子的表达能够指示该条通路的状态。

  2. 该条信号通路的活化过程,及其受到的正调控和负调控。

对此,我们往往通过实验手段或数据库(TCGA、GEO等)筛选的方法,来了解待测分子或通路的活化情况。

但如果借助AI工具,就可以帮助我们快速理解某通路与表型之间的关系,节省自己查文献、查数据库(以及学习数据库使用)等的时间。

AI可以一键产出内容,大大提升课题设计的工作效率!




3.当通路确认后,需要检测哪些指标?如何做实验设计才能证明该通路参与了D表型的调控?

通路和表型之间存在一定的相关性,比如Wnt通路与上皮间质转化有很强的联系,但是由于细胞内的信息传递是网状的,所以通路和表型之间的对应关系不是绝对的。

我们需要在自己的研究模型中进行实验筛选和检测。

常见的通路检测方法有:

  1. 大量的做Western检测通路明星蛋白表达变化,走猜分子+验证的路子;

  2. 通路芯片,尤其是蛋白芯片Pathway Array。方法效率更加出色;

  3. 方法比较小众一点,但也是很聪明的策略,那就是用通路的抑制剂和激活剂来筛。

借助AI工具,我们可以快速了解该通路相关的实验策略和实验细节,设计实验方案,还能避开实验过程中的常见雷区和误区!

以上仅部分课程内容介绍~

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写在最后

信号通路作为细胞内活动的真实写照,素来都是分子机制研究的重头戏,因而无论是高分文章还是申请基金,都少不了抱抱信号通路的大腿。

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