【国科科技港】iMeta封面文章:中国农科院科学家揭示中国地方猪和瘦肉型猪表型差异的遗传机制

财富   2024-12-18 18:42   广东  

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2024年12月15日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称“基因组所”)、佛山鲲鹏现代农业研究院(以下简称“鲲鹏院”)唐中林团队联合国内外多家单位解析了猪复杂性状形成和表型分化的遗传基础,揭示了中外品种猪骨骼肌生长发育和产肉性状差异等形成的表观调控机制。相关成果以题为"Multiomics analysis reveals signatures of selection and loci associated with complex traits in pigs"的研究性论文发表在国际著名期刊iMeta(IF 23.8)上。

我国是世界上最大生猪养殖和猪肉消费国家,提高猪肉产量和改良肉品质是动物遗传育种领域的重要课题之一。经过很多年的自然选择和人工选择,西方猪种因体重、生长速度和肌内脂肪含量等经济性状被强烈选择,与东方猪种相比呈现显著差异,它们之间表型分化的遗传基础尚不清楚。

研究人员结合9个高质量基因组和1081个全基因组重测序数据,构建了较为完整的猪泛基因组及遗传变异数据集,为解析猪的复杂性状奠定了基础。通过整合骨骼肌27个发育时间点的转录组和甲基化组数据,揭示了东西方猪种骨骼肌生长发育差异的表观遗传和异时基因调控机制,并进一步发现人工选择对DNA甲基化和异时基因调控有显著影响,与东西方猪种骨骼肌生长和肉质的差异密切相关。最终,通过多组学整合分析和功能实验验证,发现了系列与猪脂肪沉积(BRCA1)、肌肉生长(GHSR和BDH1)、免疫性状(ABCA3)相关的选择性清除信号和基因,为猪的遗传改良提供了重要的基因标记。

本研究被选为iMeta期刊最新一期的封面文章。中国农业科学院农业基因组研究所已出站博士后刘磊(现就职于崖州湾国家实验室)、易国强研究员、博士后姚一龙、刘毓文研究员和凌恩生物科技(深圳)李江等为共同第一作者,基因组所、鲲鹏院唐中林研究员、易国强研究员和瓦赫宁根大学的Martien A. M. Groenen教授为共同通讯作者。本研究得到国家重点研发计划、国家自然科学基金及中国农科院重大攻关任务等项目资助。

论文链接:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/imt2.250

来源:基因组所、鲲鹏院

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