PNAS | 李洪林/李英贤团队发现老药坦索罗辛具有抗骨质疏松新作用

学术   2025-01-02 00:02   湖南  

2024年12月31日,华东师范大学药学院/人工智能新药创智中心李诗良/李洪林团队、中国航天员科研训练中心航天医学全国重点实验室李英贤团队、瓯江实验室凌树宽团队,联合复旦大学附属华东医院郑拥军团队、上海市第六人民医院胡晓勇团队等多家单位在PNAS发表题为“Tamsulosin ameliorates bone loss by inhibiting the release of Cl through wedging into a novel allosteric site of TMEM16A”的研究论文。

研究背景

TMEM16A,也称为ANO1,是一种重要的钙激活氯离子通道 (CaCC) ,在液体分泌、平滑肌收缩和肿瘤形成等生理过程中发挥着关键作用,其功能异常与多种疾病包括癌症、高血压和骨质疏松等有关,因此成为了药物研究的热点。尽管已有多个TMEM16A调节剂被报道,但它们的作用机制和精确的结合位点尚未明确。研究团队使用自主发展的分子三维相似性的方法SHAFTS,发现老药Tamsulosin对TMEM16A表现出微摩尔水平的抑制活性 (IC50 = 7.22 μM) 。接着,作者利用冷冻电镜技术,解析了TMEM16A与Tamsulosin的复合物结构(PDB: 8XLR,分辨率为2.93 Å),发现Tamsulosin楔入在TMEM16A细胞外结构域的全新的隐式口袋中,通过稳定TMEM16A在Ca2+离子激活状态下的预开放瞬时构象,阻止孔道打开以及Cl的透过。随后,综合应用分子动力学模拟、电生理、点突变和功能实验,作者进一步验证了胞外 α5-α6 环上关键残基 R605 和 E624 在调节Tamsulosin结合和孔道活性中的关键作用。Tamsulosin像“楔子”一样插入胞外新口袋,诱导细胞外环(尤其是α5-α6环)发生显著的位移,进一步导致孔道相关螺旋发生明显构象重排。其中,α5中的 P595 和 α7 中的 G711 处所诱导形成的铰链作用使跨膜螺旋具有更高的灵活性,从而使 Y593 与 I641 协同有效地调控TMEM16A的“pre-open”状态。此外,Tamsulosin在动物模型中表现出显著的抗骨质疏松效果,为老药新用开辟了新途径。本研究不仅加深了我们对TMEM16A抑制机制的理解,还为开发针对TMEM16A的新型疗法提供了重要的结构基础。

图1 

 Tamsulosin与TMEM16A胞外域隐藏口袋结合后的变构门控和调节机制示意图

[4]

研究内容

该研究使用自主发展的分子三维相似性方法SHAFTS,从老药库中筛选出TMEM16A的候选抑制剂Tamsulosin。实验验证结果显示,Tamsulosin能够浓度依赖性地抑制TMEM16A电流 (IC50 = 7.22 μM) 和破骨细胞的分化,降低关键破骨细胞标志基因的表达。同时,它通过调控Cl浓度和特定信号通路(如Syk-Btk-PLCγ2和CaMKIV-CREB-NFATc1),减少骨吸收。这证明了,Tamsulosin通过抑制TMEM16A,有效地抑制了 RANKL 诱导的破骨细胞分化和功能,揭示了 Tamsulosin 作为骨质疏松症潜在治疗药物的可能性。

图2 

 Tamsulosin通过抑制TMEM16A抑制 RANKL 诱导的破骨细胞分化和功能

[4]

随后,研究团队通过冷冻电镜技术,解析了 TMEM16A 与 Tamsulosin 复合物的三维结构,发现Tamsulosin结合在 TMEM16A 细胞外结构域的一个新结合位点。结构分析显示,Tamsulosin像“楔子”一样嵌入跨膜螺旋环(α1-α2、α5-α6和α9-α10环)之间的隐藏口袋,导致门控位置的通道孔径小于氯离子的半径 (1.81 Å) ,从而阻止阴离子通过。这表明,Tamsulosin 的结合使通道处于钙离子激活状态下的关闭状态,其作用机制与此前研究的 TMEM16A 抑制剂有所不同。Tamsulosin的甲氧基苯磺酰胺部分通过磺酰胺基团与α5-α6 环上的 G608、Y613 和 E624 形成极性相互作用。此外,参与 Tamsulosin 相互作用的残基在 TMEM16 蛋白中表现出高度保守性,表明其他TMEM16亚型可能具有类似的调节机制。

图3 

 Tamsulosin楔入TMEM16A细胞外结构域的全新的隐式结合口袋中,通过稳定TMEM16A在Ca2+子激活状态下的预开放瞬时构象,阻止孔道打开以及Cl的透过

[4]

为了深入研究 Tamsulosin 与 TMEM16A 的结合机制,研究团队首先进行了分子动力学模拟。结果显示,Tamsulosin 在1 μs 的模拟过程中结合的相对稳定。通过MM-PBSA计算,研究团队评估了口袋周围残基对 Tamsulosin 结合的贡献,其中R605对结合能贡献最大 (-3.004 kcal/mol) 。基于计算结果,团队对R605、E624、Y838和D840进行了丙氨酸突变实验。电生理实验结果显示,R605A 和 E624A 的突变显著削弱了 Tamsulosin 的抑制效果,而 Y838A 和 D840A 对其影响不大。同样,在破骨细胞分化实验中,R605A 和 E624A 突变也显著减弱了 Tamsulosin 的抑制作用,验证了这些关键残基在药物效应中的重要性。上述研究表明,位于 α5-α6 环上的氨基酸 R605 和 E624 在 Tamsulosin 与 TMEM16A 的结合中起关键作用。

图4 

 TMEM16A 胞外结合位点的计算及功能验证

[4]

研究团队通过将 TMEM61A/Tamsulosin 复合物的结构(PDB: 8XLR,青色)与经典的无钙结合状态下的冷冻电镜结构(PDB:5OYG,紫色)进行比较,发现Ca²⁺的结合触发 α6 螺旋的构象重排,使其从 α 螺旋转变为 π 螺旋,激活了通道。另外,Tamsulosin 的结合引起了胞外 loop 环的显著构象变化,使得 α5 和 α6 螺旋发生移位,继而导致 P595 和 G711 残基引发铰链效应,使 α5 和 α7 更靠近孔口,并且 α5 和 α7 的二级结构遭到破坏,氢键网络发生重排。离子通道孔径的分析表明,TMEM16A/Tam_Ca²⁺的通道外前庭没有显著收缩,而门控的孔径大小变化趋势与5OYG相反,呈现出缩小和关闭状态。在 I641 和 Y593 的位置,孔径明显缩小,使通道维持在封闭状态。这表明,通道外前庭受到 Tamsolusin 在胞外结合的影响,通过调节孔径中氨基酸 P595、Y593 和 I641 的构象,使通道变窄,进而阻止了阴离子的渗透。在分子动力学模拟中,作者也观察到这一被 Tamsolusin 捕获的预开放的瞬时构象能持续存在。

作者通过突变实验验证了门控关键残基 Y593 和 I641 的重要性。在这两个位置的单突变显著削弱了 Tamsulosin 的抑制效果,而 Y593/I641 双突变几乎完全消除了其抑制作用。这些结果表明,Y593 和 I641 是 Tamsulosin 诱导的 TMEM16A 构象变化和通道关闭的关键位点,直接影响了破骨细胞的分化过程。通过这些研究,该团队深入揭示了 Tamsulosin 通过与胞外口袋结合来间接调控 TMEM16A 通道状态的机制。

图5 

 TMEM16ATam_Ca2+的通道构象及 Tamsulosin 在胞外结合的间接抑制机制

[4]

为了评估 Tamsulosin 对 OVX 诱导的骨丢失的治疗效果,研究团队在手术后三个月开始对 OVX 和假手术小鼠进行为期4周的 Tamsulosin 治疗,剂量分别为低 (1.0 mg/kg/d) 、中 (3.0 mg/kg/d) 和高 (9.0 mg/kg/d) 。Micro-CT分析显示,与PBS处理的OVX组相比,Tamsulosin 治疗组的小鼠骨体积/总体积 (BV/TV) 、骨小梁数量 (Tb.N) 和厚度 (Tb.Th) 增加,结构模型指数 (SMI) 降低,且呈剂量依赖性。进一步的检测发现, Tamsulosin 治疗降低了血清CTX-1水平以及破骨细胞标志基因 (NFATc1、Acp5和 Ctsk) 的表达。结果表明,Tamsulosin 能够有效抑制 OVX 诱导的骨丢失,具有潜在的治疗骨质疏松症的应用价值。

图6 

 Tamsulosin有效保护 OVX 诱导的骨质流失

[4]

总结
TMEM16A 功能障碍与骨质流失密切相关。然而,复合物结构信息匮乏阻碍了有效的靶点确证和新药发现。通过老药新用的计算筛选,本研究发现了 Tamsulosin 能有效抑制 TMEM16A 电流,体外实验显示其抑制 RANKL 诱导的破骨细胞分化,且在 OVX 小鼠模型中对骨质流失有显著保护作用。通过对冷冻电镜复合物结构分析发现,Tamsulosin结合于TMEM16A的胞外全新的隐式口袋,并确定了残基 R605 和 E624 的关键作用,这些发现揭示了 TMEM16A 全新的变构抑制机制。Tamsulosin 通过影响通道构象的方式进行别构调控,稳定 TMEM16A “pre-open”的瞬时构象,阻止了Cl离子的渗透。尽管已有几种 TMEM16A 调节剂被报道,但尚无临床批准药物。Tamsulosin 作为已用于治疗良性前列腺增生的上市药物,为开发更安全有效的 TMEM16A 抑制剂提供了新的思路,该团队的研究为其在骨质疏松症等疾病中的应用提供了可能性。

李诗良、孙维佳、李爽为本研究的共同第一作者,参与本研究工作的还有华东理工大学药学院朱丽丽副教授和王蕊教授、河北大学生命科学学院郭帅副研究员等。该工作得到了中国国家自然科学基金 (82425104,82173690,82192880,82192882) 的资助。

参考文献 
[1] Sun W, Guo S, Li Y, et al. Anoctamin 1 controls bone resorption by coupling Cl− channel activation with RANKL-RANK signaling transductionNature communications.  2022, 13(1):2899.
[2] Dang S, Feng S, Tien J, et al. Cryo-EM structures of the TMEM16A calcium-activated chloride channelNature.  2017, 552(7685):426-429.
[3] Peters C J, Gilchrist J M, Tien J, et al. The sixth transmembrane segment is a major gating component of the TMEM16A calcium-activated chloride channelNeuron.  2018, 97(5):1063-1077.
[4] Li S, Sun W, Li S, et al. Tamsulosin ameliorates bone loss by inhibiting the release of Cl− through wedging into a novel allosteric site of TMEM16AProceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.  2025, 122(1):e2407493121.


供稿:李爽/张怡清

校稿:李诗良
编辑:汤荣凡

华东理工大学/上海市新药设计重点实验室/李洪林教授课题组
招聘博后
华东理工大学李洪林教授团队诚聘博士后

Li's Lab
地址:上海市梅陇路130号 
电话:021-64250213
课题组网站:http://www.lilab-ecust.cn

长按扫码可关注


DrugAI
关注人工智能与化学、生物、药学和医学的交叉领域进展,提供“原创、专业、实例”的解读分享。
 最新文章