信号通路本质上就是前人研究的比较透彻的一些分子,包括它的调控方式的一个总结。
在生物医学研究中,只要做到分子水平的研究,细胞信号通路基本是绕不过去的。一份清楚明白的信号通路图,会让你快速了解研究对象的上下游分子、准确定位自己的研究。
所以,很多实验室都会张贴一张相关信号通路图的海报。供低年级的学生时刻查看。
此外,在基金申请和SCI论文写作也少不了信号通路图。
就在北京大学肿瘤医院团队刚刚发表的一篇一区SCI文章中,作者发现了 PME 内细胞相互作用网络的不同耐药模式和治疗驱动的时间动力学。
一般来说,在化疗耐药和免疫耐药病例中分别揭示了显着的代谢重编程和补体激活以及 TGF-β 通路激活(图 8A)。
图 8A
来源:CTM期刊(影响因子7.9分;中科院一区)
文章名称:《Single-cell characterization of differentiation trajectories and drug resistance features in gastric cancer with peritoneal metastasis》(胃癌腹膜转移分化轨迹和耐药特征的单细胞表征)
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分析信号通路对于理解生物过程背后的复杂机制至关重要,从文献中捕获有关信号通路的信息对于许多生物学研究的实验设计和分析必不可少。
但很多刚刚着手信号通路学习的研究僧表示,信号通路太复杂了,根本看不懂……
为了帮助大家保质保量地完成信号通路相关课题和SCI文章,今天小编特意为大家整理了一份最具学习价值的信号通路入门级学习指南!
01
想对感兴趣的信号通路进行查询?
不妨访问下这个比较赞的国外数据库——KEGG!
网址:https://www.genome.jp/kegg/
KEGG,京都基因与基因组百科全书,是日本京都 Kanehisa Laboratories 根据文献证据手工整理的一个庞大数据库(包括信号通路、基因、疾病、药物等等)。
在所有子数据库中,最重要也是最常用的就是KEGG PATHWAY,包含了大量物种的代谢与生物信号传导通路信息。
02
想做出超高颜值SCI通路图?
那必然少不了以下专门绘制信号通路的软件!
① IBS:
非常适合绘制基因结构、序列互作结合的示意图,可以下载使用,也可以在线使用。
② ScienceSlide:
一款专门做医学图片的ppt插件,安装后,会在PPT界面出现一个工作条,包括了常用元件、信号通路、方法学、生物化学、分子生物学等几千种素材。
③PathwayBuilder:
一款专业的细胞信号通路绘图软件,自带基本元素(分子、细胞、模式生物、甚至人体组织器官及系统的)模板,还自带很多经典通路,在上面可以直接修改,非常方便。
03
想成为信号通路达人?
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课程大纲如下图👇
接下来,就带各位同学提前了解一下部分课程内容~
一是明确该通路中的配体和受体、蛋白激酶,以及转录因子,具体表现为提炼出该条通路有代表性的待测分子。也就是说,检测哪些分子的表达能够指示该条通路的状态。
二是理解该条信号通路的活化过程,及其受到的正调控和负调控。推荐大家的学习顺序就是按照受体的类型来分门别类地去记忆。
所以课程一开始,老师就为我们理清了信号通路基础知识!
信号通路是什么?核心成员有哪些?信号通路传导过程中的普遍规律是什么?……建议0基础学员逐字逐句听讲记录!全都是干货!
信号通路在课题中应该是万年配角,很少作为主角出现,通常是做因变量。但是,信号通路中的某个关键分子,是可以作为课题的主变量来出现的。
我们现在提及的,都是把一群分子当做一个整体的这种信号通路。
信号通路作为因变量,可以有间接机制,也可以有直接机制。
那么,下游通路如何筛选?该信号通路为什么被激活了,由何种分子介导?信号通路激活后,细胞为何发生了变化?……
本伴学营里全都讲到了!最重要的是,老师讲清楚了如何利用AI工具——LibreChat的强大功能,辅助完成课题设计!
在伴学营课程中,老师列举了2种信号通路的检测方法,一种是Western Blot,另一种是细胞免疫荧光检测(又称IF检测)。
从检测原理到检测过程中的注意事项,老师全都讲解清楚了!
课上,老师以几篇文献为例,详细讲解了Western Blot和免疫荧光显示是如何表达出XXX信号通路的状态发生了改变。
有干货,有示例,0基础小白看完也能学会拆解文献!
同时,老师还介绍了如何借助科研AI工具LibreChat避开通路检测实验过程中的误区、雷区。
在课上,老师列举了3种信号通路的常用筛选策略,并分享了特异性更好的下游通路筛选方法——生物芯片技术,其本质、类型、原理,以及它在信号通路筛选中的应用都介绍的清清楚楚。
同时,老师还介绍了如何借助科研AI工具LibreChat,进行数据库筛选通路或文献筛选通路。
以上ppt为部分资料,完整版课程资料,文末扫码领取!
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写在最后:
如果你也对信号通路感到复杂、棘手、一筹莫展,读不懂文献中信号通路相关的研究内容,那就快来看看这节解螺旋精心准备的【AI辅助信号通路研究】伴学营课程!
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