Notch、TGF-β、AMPK、NF-κB、Wnt……搞定信号通路的利器又多一个!(都是干货)

学术   2024-11-20 16:27   上海  

TGF-β超家族配体调控细胞功能,在胚胎发育、组织修复和骨骼肌、心血管、神经、内分泌和免疫系统的稳态中发挥着重要作用。早已是肿瘤免疫治疗的宠儿。

不仅仅是TGF-β信号通路,在肿瘤免疫和靶向研究中,MAPK、PI3K、NF-κB、Wnt、Notch、AMPK……等其他信号通路也都非常重要。

每年与通路相关的研究论文在上千篇以上。四川华西等知名院校都在发!👇

文章标题:《Targeting TGF-β signal transduction for fibrosis and cancer therapy》

关键词:TGF-β;TGF-β信号通路;靶向治疗。

发表期刊:Mol Cancer(影响因子27.7分;医学Top;中科院一区)

该综述总结了TGF-β的生物学过程及其在纤维化发生中的双重作用,以及TGF-β靶向治疗的临床应用。






想靠信号通路发医学SCI,首先要掌握信号传导的基本概念和机制,能够识别在各种生理和病理状态下的关键信号分子或靶点,才能更好的去灵活运用信号通路发文!

所以,今天我们不仅简单总结了一些3-5分通路研究相关的SCI文章套路,含二元变量组合套路、三元变量组合套路。

更重要的是,我们还为大家带来了一节专为医学科研新手准备的【AI辅助信号通路研究】2天伴学营。学会之后,什么NF-κB、PI3K/AKT、MAPK,全都轻松拿捏!

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【AI辅助信号通路研究】2天伴学营

带你快速入门信号通路

掌握分子研究机制

快速发3-5分SCI


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灵活运用通路发3-5分SCI

二元变量、三元变量
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含有通路的二元变量组合套路


二元变量,即两个变量要素组合。有了变量的组合也就有了分子机制,有了机制,就能胜任3-5分SCI的内容产出了。

含有通路的二元变量组合有:

1、药物+通路:

数据库推荐KEGG数据库,提供了药物与通路之间相互作用的信息。

2、分子+通路:

数据库推荐DAVID数据库, 用于筛选出差异基因之后的功能和通路富集分析。

Metascape数据库,能完成通路富集和生物过程注释,还能做基因相关的蛋白质网络分析和涉及到的药物分析。

二元变量的逻辑论证链一般分为以下几个步骤:主变量(A)调节表型,主变量(A)调节因变量(B),Rescue证明A调节表型依赖于B。

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含有通路的三元变量组合套路


药物、分子、通路这三元变量进行组合,有意义的组合有七种。

药物/分子+分子/通路+通路/分子

排列组合的原则是:药物不做次,通路不做主,分子主次皆可。

通过将以上二元变量相关的数据库,两两组合,同样可以解决三元论证的问题。

包括目标分子的来源问题是通过数据库或者生信分析筛出来的,药物的有效成分是通过数据库检索出来的。

与其他分子的相互作用,与哪些生物学功能、通路机制相关也是通过分析预测缩小了研究范围。

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入门信号通路,跟着学就对了!

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你想靠信号通路发篇3-5分SCI?奈何一看到这些弯弯绕绕的信号通路研究搞得头痛。通路中那么许多分子真的太太太难理清楚了。

“信号通路是什么鬼东西!看不懂,又不敢放弃,暴躁!”

“怎么找信号通路?已经卡住半个月了,救救孩子吧。”

“信号通路争取早日把我送走算了,生无可恋……”


不过,最难的日子已经过去。

为了帮助大家了解信号通路、了解分子机制、设计实验内容,解螺旋贴心整理了这份专为医学科研新手准备的入门级课程——《AI辅助信号通路研究》课2天伴学营,并分享了超实用的AI科研工具-LibreChat绝对是你读文献、做课题设计、发表SCI文章必备!

(可直接划至文末扫码领取)

包含:

✅信号通路基础知识:定义、关键成员、普遍规律、相关科学问题

✅信号通路的检测方法和筛选策略

✅以及AI工具辅助通路机制研究的方法技巧



Part 01. 什么是信号通路?

信号通路其实就是分子信号不停传导,进入细胞的过程。每条信号通路都有自己的一个过程,每个信号通路之间,又有可能相互关联。

✅比如Notch信号通路传导过程:

通过膜蛋白作为配体和受体,介导两个细胞相互靠近接触之后的活化效应。

Notch与配体结合,经过ADAM剪切释放胞外段与配体一同降解,经y-secretase剪切释放胞内段传导信号;Notch胞内段进入细胞质传导信号;Notch胞内段进入细胞核,与转录因子RBPJ结合调控转录,输出信号。

✅又比如AMPK信号通路传导过程:

众多的生长因子,细胞压力改变,细胞运动改变,能量摄取改变,均可激活AMPK上游激酶。

LKB1、CaMKK、PKA 是主要激活AMPK的上游激酶,它们的活化能够磷酸化AMPK的T172;AMPK可进一步磷酸化多种下游的转录因子,参与调控糖代谢、脂代谢、细胞增殖等等过程。

所以在研究中,信号通路就显得十分复杂,如果不熟练掌握它们,别说设计实验了,连文献看不明白!

课上,老师详细介绍了信号通路的定义和本质。


Part 02. 信号通路的三大关键成员

同时,老师还详细介绍了信号通路的三大关键成员:配体和受体、蛋白激酶、转录因子。


Part 03. 信号传导的普遍规律

如:特异性、级联放大、反馈调节、适应性等

学会后,我们才能够更好的理解不同生物体或细胞类型中类似的信号传导机制,提高我们对特定信号通路的理解和研究效率。


Part 04. 信号通路相关的科学问题

课上,老师简单总结了3条信号通路研究中常用的课题思路。


Part 05. 用AI辅助信号通路研究
  • 做某通路时,需要检测哪些分子?

  • 通路与表型之间有何联系,已知表型如何聚焦到通路?

  • 如何利用数据库来筛选通路?

  • 如何证明某通路参与了调控作用?

学会用好AI,以上问题,它统统都能帮你解决~

这里老师使用的AI工具是LibreChat,“科研的加速器”!中科院博士老谈老师、复旦博士雪球老师都在用它!

对于科研新人来说,有问题就问问LibreChat,1秒即可get答案!


Part 06. 信号通路的检测方法

信号通路的检测方法通常涉及:上游分子和下游效应的检测,具体选择取决于研究的目标和关注的特定信号传导阶段。

上游在信号通路中起到了引发和调控信号传导的作用,而下游则是受到上游事件的调控,进一步传递和执行信号的能力。

在伴学营中,老师详细介绍了两种常用的信号通路检测方法——Western Blot检测和IF免疫荧光检测,简单介绍了检测过程中会用的抑制剂及其他注意事项,以及如何用AI辅助完成通路检测实验。


Part 07. 信号通路的筛选策略

筛选信号通路的策略有很多,我们可以根据研究的目的、条件和具体的信号通路进行调整,如:

文献调研、生物信息学分析、高通量筛选技术、基因组学或转录组学、基因敲除或激活等等,以便更有效地筛选出相关的信号通路。

在伴学营中,老师详细讲解了3种信号通路的筛选思路,并分享了如何利用AI辅助快速完成下游通路的筛选。

以上仅部分课程资料展示~

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END



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