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高通量智选毒性化合物亲和型纳米抗体
传统的毒性化合物筛选方法(如急性毒性实验、体外细胞毒性试验、肝毒性和肾毒性评估等)不仅费时费力,还无法高效地识别大量化合物的毒性特征。随着生物技术的进步,纳米抗体在药物开发、疾病诊断和靶向治疗中展现了巨大的潜力。
高通量智选纳米抗体技术的核心优势在于结合纳米抗体的小巧、稳定、靶点特异性识别能力,成为检测毒性或活性化合物的理想工具。通过这一技术,研究人员可以同时评估化合物的生物活性和毒性,大幅提高筛选效率。
总的来说,纳米抗体的高选择性识别与高通量筛选技术相结合,为化合物的高效检测和毒性筛查提供了强有力的支持,推动了药物开发、化合物/代谢产物监测的进展。
文献案例重现及结果分析
参考文献:Nie Y, Li S, Zhu J, Hu R, Liu M, He T, Yang Y. Chemical shift assignments of a camelid nanobody against aflatoxin B1. Biomol NMR Assign. 2019 Apr;13(1):75-78.
黄曲霉素是一种具有强烈致癌性的毒素,广泛存在于受到污染的食品和饲料中。传统的检测方法,比如ELISA试剂盒,通常依赖于抗体质量。纳米抗体的小分子量,高亲和力和稳定性,可以显著提高检测的灵敏度,减少假阳性和假阴性结果。
在这篇文献中研究人员通过核磁共振,研究纳米抗体Nb26 与黄曲霉素B1的相互作用机制和抗体结构。我们以此为契,验证一下高通量虚拟筛选毒性化合物高亲和纳米抗体的可行性。
黄曲霉素的一组化合物结构如图1所示。将所有黄曲霉素录入天然化合物库中,以Nb26抗体为受体蛋白,使用AutoDock Vina将纳米抗体与所有化合物对接,获得结合能分值,将结合能从低到高排序,结合能越低,互作越稳定。
从图2中我们可以看到,所有黄曲霉素均排在前40,且结合能分值较低,证明Nb26与黄曲霉素的亲和力较高,纳米抗体可以有效识别毒性化合物。
图1: 黄曲霉素的化合物结构
图2: 所有天然化合物的结合能分值排布(1-40)
然后我们将黄曲霉素B1(CAS号 1162-65-8)作为配体化合物,从所储备的合成纳米抗体文库中筛选高亲和纳米抗体。从图3中,纳米抗体Nb26排在第30名,还有多个排名靠前的,具有研究潜力的纳米抗体。
从正反两个层面证明,科晶生物的高通量筛选技术平台可以根据化合物筛选出高亲和的纳米抗体。
图3: 黄曲霉素B1筛选高亲和纳米抗体排布(1-30)
图1: 纳米抗体Nb26(绿色)与黄曲霉素B1(蓝色)的结合图像
化合物智选纳米抗体的技术流程
配体化合物的准备
获取配体的完整数据,包括分子结构式、理化性质等。
构建合成纳米抗体文库
根据天然纳米抗体序列特征,对CDR1、CDR2、CDR3 进行随机突变,形成库容量千万条独特序列的突变纳米抗体文库,对文库中的序列逐一准确建模,构建数字化的合成纳米抗体文库。
纳米抗体选择性突变示意图
科晶智选纳米抗体技术平台
使用AutoDock Vina,以化合物为配体,从所储备的合成纳米抗体文库中高通量筛选得到选择性高亲和纳米抗体。
化合物智选纳米抗体的简要流程图
合肥科晶生物采用最新的计算化学技术,提供高效、准确的纳米抗体预测结果。根据老师、同学的需求,提供个性化的服务方案,由经验丰富的科研团队进行数据分析和结果验证。
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