近日，中国农业科学院生物技术研究所棉花生物技术设计育种创新团队开发了一种名为SRS（SGR1-based reporter system，基于SGR1基因的报告系统）的高效、可靠、智能化且具有可视化功能的系统，用于验证蛋白与DNA的互作。相关研究成果发表在《植物生物技术杂志（Plant Biotechnology Journal）》上。
近年来，RNA-Seq、ChIP-Seq等组学技术推动了转录因子下游基因的规模化发现，但在植物体内快速且准确地验证转录因子直接结合的下游靶基因依然具有挑战性。该研究利用叶绿素降解基因，构建了一个基于植物叶片颜色变化的可视化报告系统。此外，团队还利用CRISPR/Cas9技术创建了降低假阳性的底盘烟草CR19，并开发了智能模型SMGY来追踪颜色变化。
SRS系统已在水稻、棉花、辣椒等多种作物中成功验证了5组不同类型的转录因子与DNA的互作，并证明该系统同样适用于非烟草物种如油菜和生菜等。SRS系统的开发为构建基因遗传调控网络及作物智能设计育种提供了一种新的技术方法。
该研究得到了科技创新2030重大项目（No.2023ZD04076）、国家重点研发计划（No.2023YFF1000103）、国家自然科学基金（No.32072115）以及中国农科院创新工程资助。生物技术研究所博士生周琪、已毕业硕士生叶育璐、博士生何海焱以及孟志刚副研究员为论文并列第一作者，梁成真研究员为论文通讯作者。此外，生物技术研究所郭三堆研究员、周焘副研究员以及郑州轻工业学院的张静涛教授为本研究提供了重要支持。
