除了发布旗舰车型R9外，雅马哈还发布了全新升级的R3，新款R3的最大变化就是使用了跟R9类似的设计，这么久了，终于也是升级外观了。
全新R3的设计跟R9非常相识，同样的长条形日行灯设计，但是内置两条LED灯带，大灯也是改为进风口鱼眼大灯。但是两边的转向灯直接安装在了车头两侧，有点影响。车身方面，线条还是有大变化的，两侧导流板采用了镂空的设计，虽然没有大翅膀但是也够看够用。除了传统蓝色和黑色外，还有白紫配色，相当不错。
动力方面，新款的R3并没有对发动机进行升级调整，搭载的依旧是实际排量321cc的直列双缸水冷发动机，最大马力42HP，最大功率30,9 kW@10,750rpm，最大扭矩29.5Nm@9,000rpm。虽然动力没变化，但是终于是用上了（满大街标配的）A&S滑动离合器。
车身配置方面，除了改用KYB 37mm倒置前叉外，其他包括后减震、制动系统都与老款保持一致。
除此之外，新款的R3还升级了仪表，改为5寸LCD仪表，支持手机MyRide互联功能，都这年代了，还不肯给一块TFT仪表。
此次2025款R3的升级并不多，最大惊喜也就是外观终于变了。未来国内也应该会相应推出升级款，但是价格应该维持不变。
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