零基础 | 鼠标点点「TBtools-RNAseq」界面化转录组数据分析使用指北

文摘   科学   2024-12-13 20:12   海南  

晚间,收到还在海外的朋友说 TBtools 帮了他大忙... 当然我完全没想到是 他用 TBtools RNAseq 系列插件更新了课题组多年数据,挖到了不错的基因,也验证拿到了表型。细细讨论才知道,主要原因是以前的参考基因组不完善,注释也不行,结果不理想就放着吃灰。这个哥们运气很好,只是想随便跑跑看,没想到因为更新一下基因组版本,用TBtools简单点点练手却挖到了不错的故事.... 这一系列插件是众筹开发,曾经完全开放,诸多原因又关闭开放,现在已经不在我的覆盖范畴,由朋友去折腾。上次到在贵州一起吃了个饭,提及他们做了大量优化更新,我觉得挺好。有时候,我们需要的是好用的能用的工具,花钱也行。

--CJ

凌晨录制的讲演,年前填补两年前的坑。

直接在 TBtools 中开展转录组数据分析,尤其上游,从「原始测序数据(.sra/.fastq)」到「基因表达量与差异表达基因」。

如此,任何人都能轻松地直接在 Windows 下 或者 MacOS 下开展 RNAseq 数据分析。


为什么要掌握转录组数据分析技能?

Ø时时刻刻看遍基因表达:

    Ø自主完成常规转录组分析,随时可看基因表达

Ø充分利用已有数据:

    Ø1)公共数据库 SRA ;

    Ø2)实验室已有旧数据

Ø更新已有结果:

    Ø1)基因组序列更新了;

    Ø2)基因组注释更新了。


为什么要开发转录组数据分析系列插件?

    1. 认为好玩,值得一试

    2. 一件往事:答联合组会所获一问

    3. 解决问答烦恼

    4. 没有服务器,课题太忙

    5. 继续拆除常规数据分析门槛


TBtools 有别于其他生物信息学数据分析解决方案的地方

本地化,随时可以使用 容易掌握,且不容易忘却 两年前尝试众筹开发 TBtools RNAseq 系列插件,也写了系列教程。但不够直观。当时便提到要组织视频使用教程。一直没有时间,近日碎片化时间较多,决定填坑。

点击“阅读原文”可达 B站 视频链接


RNAseq/转录组数据分析-众筹插件大特惠

两年前,用户众筹下,我写了系列插件,可以在「Windows/Mac界面上快速完成RNAseq数据分析」。短暂开放后,发生了一些事情。于是将插件全权授予朋友公司代理运营,具体众筹价格也一直增长。最近我与他们协商确定,争取了全套众筹插件优惠,有需要的,可以联系微信「Watchbio」。

写在最后

春去秋来,做一点东西,交一班朋友,或许这就是生活。

生信石头
记录和分享生信学习经验和数据处理技巧
 最新文章