在达尔文提出进化论前的数千年时间里，人类一直认为自己是万物之灵，是天生就凌驾于其他物种之上的“统治者，这种实则虚假的优越感从太古时期开始便一直持续，在带给人类自信的同时也为后来的反对进化论埋下了伏笔。进化论和进化理论出现之前社会上是创造论的天下，认为上帝设计创造了所有物种，而这些物种包括人类自己都是生来如此且永恒不变。但并不是所有人都相信这种说法，法国生物学家拉马克在1809年系统的阐述了自己的生物演化理论，认为用进废退和获得性遗传是生物产生变异的原因和适应环境的过程，可惜他找不到支撑自己理论的证据。
1859年英国科学家达尔文在总结自己过去数年以来的自然研究成果后发表了自己对于物种形成的看法，《物种起源》就这么诞生了。
尽管在当时的社会环境下达尔文和他的进化论招骂无数，但科学界对进化论还是持客观公正态度的，并没有急着反对而是在确定其大方向正确后再对其进行修补，达尔文的化石证据和后来分子生物学层面上的证据一起成为了现代进化论，自此开始“地球生物拥有共同祖先”这一理论被正式确定。
结合现代生物学和地球演化模型，如今的我们已经可以大致复原38亿年前海底生命的进化之路，简单且单一的单细胞生物为了更好的活下去进化为了多细胞生物，而生物发展到一定程度后就开始在不同环境的影响下产生不同的变化。
生物的分化尽管让它们的外表产生了巨大变化，但它们的基因仍有很大一部分是完全相同的，这种相同就是共同祖先的最好证据，人类的30多亿碱基对中只有极小一部分完全属于自己，而就是这极小一部分使得每个人的外貌都不一样。
人类之间的基因相似度为99.9%，但放到30多亿的碱基对上也还是有一部分完全不同，因此人类和其他物种基因相似度60%甚至90%都不用太吃惊，毕竟人和人在99.9%相似度情况下都能如此不同，其他物种90%的相似度却和人类差别如此之大就不奇怪了。
黑猩猩的和人类之间的基因相似性在98.6%到99%，此外基因还告诉我们人类的祖先和黑猩猩的祖先是在500到600万年前分道扬镳成为不同物种的。
有趣的是非洲刚果河两岸的黑猩猩的其中一支在130万年前变成了“天生中分发型”的倭黑猩猩，这个变种和黑猩猩之间的基因相似度为99.6%，科学家普遍认为是黑猩猩的不善于游泳导致了与对岸同族产生地理隔绝，最终分化成了不同物种。基因作为DNA中具有遗传效应的片段，那怕排列顺序只有一个不同也足以让生物产生巨大变化，地球物种之间相似度如此之高只是说明大家“本身同根生”
