骨骼肌不仅是大多数脊椎动物体内最大(重量)的组织,也是农业动物最重要的产肉组织。解析骨骼肌生长发育过程中基因表达调控的动态变化规律是理解产肉动物表型形成和相关肌病致病机理的重要基础。近年来,基于4C及其衍生技术等多种实验手段,已认识到细胞核内染色质的三维空间构象对基因转录具有重要调控作用。尽管全球养鸡业快速发展,但鸟类骨骼肌高分辨率的染色质互作图谱少有报道,骨骼肌发育的染色质构象动态变化和转录调控过程亦尚未阐明。回答这些问题,有助于加深对农业动物产肉量和骨骼肌发育机制及相关疾病机理的理解。
2024年4月6日,四川农业大学动科学院/猪禽种业全国重点实验室李明洲教授等团队合作在国际著名期刊《Advanced Science》上在线发表了题为“Building Haplotype-Resolved 3D Genome Maps of Chicken Skeletal Muscle ”的研究论文。该研究利用高深度in situ Hi-C技术,结合长读长基因组、RNA-seq等数据,构建了杂交鸡骨骼肌的高分辨率单倍型三维基因组动态图谱,揭示了同源染色体的空间结构特征,并在多个尺度上系统地解析了骨骼肌染色体构象的发育动态变化。
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